Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q04437

Protein Details
Accession Q04437    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-50EYTLLNKSKKSRKTDWISCYLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006164  Ku70/Ku80_beta-barrel_dom  
IPR024193  Ku80  
IPR005160  Ku_C  
IPR005161  Ku_N  
IPR016194  SPOC-like_C_dom_sf  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0043564  C:Ku70:Ku80 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003678  F:DNA helicase activity  
GO:0070034  F:telomerase RNA binding  
GO:0042162  F:telomeric DNA binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0007535  P:donor selection  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0006303  P:double-strand break repair via nonhomologous end joining  
GO:0097695  P:establishment of protein-containing complex localization to telomere  
GO:0034502  P:protein localization to chromosome  
GO:0000725  P:recombinational repair  
GO:0031509  P:subtelomeric heterochromatin formation  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
KEGG sce:YMR106C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02735  Ku  
PF03730  Ku_C  
PF03731  Ku_N  
CDD cd00873  KU80  
cd01458  vWA_ku  
Amino Acid Sequences MSSESTTFIVDVSPSMMKNNNVSKSMAYLEYTLLNKSKKSRKTDWISCYLANCPVSENSQEIPNVFQIQSFLAPVTTTATIGFIKRLKQYCDQHSHDSSNEGLQSMIQCLLVVSLDIKQQFQARKILKQIVVFTDNLDDLDITDEEIDLLTEELSTRIILIDCGKDTQEERKKSNWLKLVEAIPNSRIYNMNELLVEITSPATSVVKPVRVFSGELRLGADILSTQTSNPSGSMQDENCLCIKVEAFPATKAVSGLNRKTAVEVEDSQKKERYVGVKSIIEYEIHNEGNKKNVSEDDQSGSSYIPVTISKDSVTKAYRYGADYVVLPSVLVDQTVYESFPGLDLRGFLNREALPRYFLTSESSFITADTRLGCQSDLMAFSALVDVMLENRKIAVARYVSKKDSEVNMCALCPVLIEHSNINSEKKFVKSLTLCRLPFAEDERVTDFPKLLDRTTTSGVPLKKETDGHQIDELMEQFVDSMDTDELPEIPLGNYYQPIGEVTTDTTLPLPSLNKDQEENKKDPLRIPTVFVYRQQQVLLEWIHQLMINDSREFEIPELPDSLKNKISPYTHKKFDSTKLVEVLGIKKVDKLKLDSELKTELEREKIPDLETLLKRGEQHSRGSPNNSNN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.16
3 0.2
4 0.21
5 0.28
6 0.36
7 0.38
8 0.38
9 0.4
10 0.37
11 0.36
12 0.37
13 0.32
14 0.25
15 0.21
16 0.2
17 0.23
18 0.23
19 0.23
20 0.26
21 0.26
22 0.29
23 0.37
24 0.45
25 0.49
26 0.57
27 0.63
28 0.68
29 0.76
30 0.82
31 0.8
32 0.79
33 0.75
34 0.69
35 0.62
36 0.54
37 0.5
38 0.41
39 0.33
40 0.28
41 0.25
42 0.26
43 0.25
44 0.25
45 0.21
46 0.24
47 0.24
48 0.22
49 0.22
50 0.22
51 0.24
52 0.21
53 0.2
54 0.17
55 0.18
56 0.18
57 0.16
58 0.14
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.13
68 0.13
69 0.18
70 0.17
71 0.21
72 0.29
73 0.34
74 0.37
75 0.45
76 0.53
77 0.58
78 0.64
79 0.66
80 0.66
81 0.66
82 0.64
83 0.56
84 0.5
85 0.41
86 0.35
87 0.3
88 0.22
89 0.17
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.13
94 0.1
95 0.09
96 0.08
97 0.09
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.07
102 0.1
103 0.11
104 0.12
105 0.14
106 0.19
107 0.23
108 0.26
109 0.33
110 0.34
111 0.39
112 0.45
113 0.5
114 0.48
115 0.47
116 0.47
117 0.44
118 0.42
119 0.37
120 0.31
121 0.26
122 0.22
123 0.19
124 0.16
125 0.1
126 0.08
127 0.1
128 0.09
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.09
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.15
154 0.24
155 0.31
156 0.35
157 0.38
158 0.41
159 0.51
160 0.55
161 0.61
162 0.58
163 0.51
164 0.49
165 0.5
166 0.51
167 0.45
168 0.43
169 0.36
170 0.31
171 0.31
172 0.28
173 0.25
174 0.23
175 0.2
176 0.24
177 0.23
178 0.22
179 0.19
180 0.19
181 0.18
182 0.15
183 0.13
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.1
192 0.12
193 0.17
194 0.17
195 0.18
196 0.2
197 0.21
198 0.22
199 0.2
200 0.26
201 0.22
202 0.21
203 0.21
204 0.19
205 0.17
206 0.16
207 0.14
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.1
220 0.14
221 0.13
222 0.15
223 0.15
224 0.16
225 0.16
226 0.15
227 0.13
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.12
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.15
236 0.15
237 0.15
238 0.14
239 0.12
240 0.14
241 0.19
242 0.2
243 0.23
244 0.24
245 0.24
246 0.24
247 0.24
248 0.2
249 0.18
250 0.19
251 0.19
252 0.24
253 0.26
254 0.28
255 0.29
256 0.28
257 0.26
258 0.27
259 0.27
260 0.23
261 0.26
262 0.29
263 0.27
264 0.28
265 0.29
266 0.26
267 0.22
268 0.18
269 0.17
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.19
276 0.19
277 0.17
278 0.15
279 0.16
280 0.2
281 0.21
282 0.22
283 0.19
284 0.18
285 0.18
286 0.18
287 0.16
288 0.12
289 0.09
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.13
300 0.14
301 0.13
302 0.14
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.18
307 0.15
308 0.14
309 0.14
310 0.13
311 0.11
312 0.09
313 0.07
314 0.05
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.04
319 0.03
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.09
333 0.1
334 0.09
335 0.13
336 0.14
337 0.15
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.16
342 0.19
343 0.16
344 0.15
345 0.18
346 0.16
347 0.17
348 0.16
349 0.16
350 0.13
351 0.13
352 0.14
353 0.09
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.05
371 0.04
372 0.03
373 0.05
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.11
382 0.13
383 0.18
384 0.25
385 0.29
386 0.3
387 0.31
388 0.32
389 0.31
390 0.33
391 0.32
392 0.27
393 0.27
394 0.26
395 0.24
396 0.23
397 0.2
398 0.13
399 0.1
400 0.08
401 0.07
402 0.08
403 0.1
404 0.11
405 0.12
406 0.15
407 0.16
408 0.18
409 0.16
410 0.17
411 0.18
412 0.19
413 0.21
414 0.18
415 0.25
416 0.28
417 0.35
418 0.42
419 0.47
420 0.45
421 0.43
422 0.44
423 0.38
424 0.35
425 0.32
426 0.3
427 0.22
428 0.25
429 0.27
430 0.28
431 0.28
432 0.26
433 0.22
434 0.16
435 0.22
436 0.21
437 0.18
438 0.19
439 0.2
440 0.24
441 0.26
442 0.26
443 0.22
444 0.25
445 0.26
446 0.27
447 0.27
448 0.25
449 0.25
450 0.27
451 0.28
452 0.33
453 0.33
454 0.33
455 0.31
456 0.3
457 0.28
458 0.27
459 0.24
460 0.15
461 0.12
462 0.09
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.07
471 0.07
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.1
481 0.09
482 0.09
483 0.09
484 0.1
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.1
489 0.11
490 0.11
491 0.11
492 0.11
493 0.1
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.12
498 0.19
499 0.22
500 0.24
501 0.27
502 0.34
503 0.42
504 0.48
505 0.49
506 0.51
507 0.54
508 0.54
509 0.56
510 0.56
511 0.53
512 0.47
513 0.48
514 0.45
515 0.46
516 0.46
517 0.45
518 0.44
519 0.38
520 0.39
521 0.35
522 0.3
523 0.23
524 0.26
525 0.23
526 0.18
527 0.17
528 0.16
529 0.16
530 0.16
531 0.15
532 0.13
533 0.18
534 0.19
535 0.19
536 0.19
537 0.21
538 0.2
539 0.21
540 0.19
541 0.18
542 0.16
543 0.18
544 0.2
545 0.2
546 0.24
547 0.25
548 0.28
549 0.28
550 0.29
551 0.29
552 0.33
553 0.37
554 0.43
555 0.51
556 0.55
557 0.59
558 0.61
559 0.63
560 0.64
561 0.66
562 0.67
563 0.62
564 0.59
565 0.54
566 0.51
567 0.47
568 0.44
569 0.39
570 0.34
571 0.3
572 0.25
573 0.27
574 0.32
575 0.35
576 0.36
577 0.38
578 0.37
579 0.44
580 0.51
581 0.48
582 0.47
583 0.46
584 0.43
585 0.4
586 0.4
587 0.34
588 0.33
589 0.33
590 0.33
591 0.33
592 0.34
593 0.33
594 0.32
595 0.32
596 0.36
597 0.36
598 0.35
599 0.34
600 0.34
601 0.35
602 0.37
603 0.42
604 0.37
605 0.41
606 0.46
607 0.52
608 0.56
609 0.61