Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P47976

Protein Details
Accession P47976    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
231-251LNELKFKKKSNNYRTKPCINWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-136KRKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 12.333, mito 3.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006879  P:intracellular iron ion homeostasis  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
KEGG sce:YDR151C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MMPNVAPNSYYLNIPNANSTSTTTSSIFSDLNKEYESKIKEIEEYYIKTLLNENTDNDDSSSSEGHNINETDILSEYSPRPSPWLPSKPNCYHPLGDFKDLIISDSRPTNTLPINNPFAGNNNISTLATTEKKRKKRSLEVEINPTYTTSAFSLPLTAENLQKLSQVDSQSTGLPYTLPIQKTTKLEPCRRAPLQLPQLVNKTLYKTELCESFTIKGYCKYGNKCQFAHGLNELKFKKKSNNYRTKPCINWSKLGYCPYGKRCCFKHGDDKDVEIYQNANDGRSKDTALTPLPTSLAPSNNDNITNLSKPRNLHTSVKALQRMTW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.29
3 0.24
4 0.25
5 0.24
6 0.25
7 0.25
8 0.25
9 0.27
10 0.23
11 0.23
12 0.23
13 0.24
14 0.22
15 0.18
16 0.22
17 0.21
18 0.22
19 0.22
20 0.22
21 0.22
22 0.29
23 0.31
24 0.27
25 0.28
26 0.27
27 0.29
28 0.29
29 0.32
30 0.31
31 0.3
32 0.31
33 0.31
34 0.29
35 0.27
36 0.3
37 0.28
38 0.27
39 0.26
40 0.25
41 0.28
42 0.29
43 0.29
44 0.25
45 0.23
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.12
50 0.15
51 0.15
52 0.15
53 0.18
54 0.18
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.14
59 0.13
60 0.14
61 0.1
62 0.12
63 0.13
64 0.15
65 0.17
66 0.16
67 0.2
68 0.2
69 0.26
70 0.33
71 0.42
72 0.46
73 0.52
74 0.61
75 0.62
76 0.68
77 0.66
78 0.6
79 0.53
80 0.48
81 0.51
82 0.45
83 0.43
84 0.36
85 0.32
86 0.3
87 0.28
88 0.26
89 0.17
90 0.14
91 0.13
92 0.16
93 0.16
94 0.14
95 0.15
96 0.17
97 0.18
98 0.21
99 0.24
100 0.25
101 0.29
102 0.28
103 0.28
104 0.25
105 0.25
106 0.24
107 0.21
108 0.17
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.11
114 0.11
115 0.14
116 0.16
117 0.25
118 0.32
119 0.41
120 0.5
121 0.57
122 0.62
123 0.69
124 0.76
125 0.77
126 0.79
127 0.75
128 0.75
129 0.69
130 0.61
131 0.5
132 0.41
133 0.31
134 0.2
135 0.16
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.12
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.15
157 0.14
158 0.14
159 0.12
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.1
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.17
168 0.21
169 0.23
170 0.27
171 0.31
172 0.36
173 0.42
174 0.47
175 0.5
176 0.55
177 0.53
178 0.52
179 0.47
180 0.48
181 0.49
182 0.47
183 0.43
184 0.39
185 0.41
186 0.38
187 0.37
188 0.29
189 0.24
190 0.19
191 0.2
192 0.18
193 0.17
194 0.18
195 0.2
196 0.2
197 0.19
198 0.2
199 0.19
200 0.23
201 0.22
202 0.21
203 0.21
204 0.22
205 0.26
206 0.3
207 0.34
208 0.4
209 0.48
210 0.51
211 0.49
212 0.5
213 0.51
214 0.46
215 0.45
216 0.4
217 0.38
218 0.35
219 0.42
220 0.41
221 0.41
222 0.42
223 0.41
224 0.45
225 0.48
226 0.57
227 0.6
228 0.7
229 0.72
230 0.8
231 0.85
232 0.83
233 0.77
234 0.75
235 0.74
236 0.67
237 0.65
238 0.59
239 0.56
240 0.52
241 0.51
242 0.47
243 0.41
244 0.44
245 0.47
246 0.52
247 0.51
248 0.53
249 0.53
250 0.58
251 0.59
252 0.58
253 0.61
254 0.58
255 0.63
256 0.59
257 0.58
258 0.54
259 0.5
260 0.44
261 0.33
262 0.27
263 0.19
264 0.22
265 0.19
266 0.17
267 0.17
268 0.19
269 0.21
270 0.22
271 0.23
272 0.2
273 0.22
274 0.25
275 0.25
276 0.27
277 0.24
278 0.23
279 0.23
280 0.21
281 0.23
282 0.22
283 0.23
284 0.23
285 0.25
286 0.28
287 0.3
288 0.31
289 0.28
290 0.28
291 0.29
292 0.31
293 0.32
294 0.34
295 0.35
296 0.36
297 0.41
298 0.45
299 0.45
300 0.48
301 0.49
302 0.53
303 0.55
304 0.61
305 0.61