Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P46962

Protein Details
Accession P46962    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-31FFSRPFLSKRQIQRAQKNTISDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 10, cyto_nucl 7.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR043198  Cyclin/Ssn8  
IPR006671  Cyclin_N  
Gene Ontology GO:0032806  C:carboxy-terminal domain protein kinase complex  
GO:0070692  C:CTDK-1 complex  
GO:0008024  C:cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0061575  F:cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0031124  P:mRNA 3'-end processing  
GO:0032786  P:positive regulation of DNA-templated transcription, elongation  
GO:0045943  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase I  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0045903  P:positive regulation of translational fidelity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YJL006C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00134  Cyclin_N  
CDD cd20547  CYCLIN_ScCTK2-like_rpt1  
cd20546  CYCLIN_SpCG1C_ScCTK2-like_rpt2  
Amino Acid Sequences MPSTFESQLFFSRPFLSKRQIQRAQKNTISDYRNYNQKKLAVFKFLSDLCVQLKFPRKTLETAVYFYQRYHLFNRFETEVCYTVATSCLTLGCKEVETIKKTNDICTLSLRLRNVVKINTDILENFKKRVFQIELRILESCSFDYRVNNYVHIDEYVIKIGRELSFDYKLCNLAWVIAYDALKLETILVIPQHSIALAILKIAYELLDNKNWSSKRYSLFETDEKSVNEAYFDIVNFYINSFDMCDLQRHLPADLLPIGVERFMELKKNAGPESGLPQIPDHLLNADPYITITRDNNVQERRYVLSLELINGESSINSSTRHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.4
4 0.46
5 0.54
6 0.63
7 0.67
8 0.73
9 0.79
10 0.81
11 0.83
12 0.8
13 0.75
14 0.7
15 0.69
16 0.62
17 0.56
18 0.55
19 0.51
20 0.56
21 0.55
22 0.54
23 0.52
24 0.52
25 0.54
26 0.55
27 0.54
28 0.52
29 0.48
30 0.45
31 0.46
32 0.41
33 0.38
34 0.3
35 0.27
36 0.21
37 0.23
38 0.22
39 0.23
40 0.32
41 0.32
42 0.35
43 0.4
44 0.4
45 0.41
46 0.46
47 0.48
48 0.41
49 0.41
50 0.42
51 0.39
52 0.37
53 0.33
54 0.33
55 0.27
56 0.27
57 0.29
58 0.33
59 0.32
60 0.33
61 0.38
62 0.35
63 0.33
64 0.33
65 0.31
66 0.25
67 0.22
68 0.21
69 0.16
70 0.14
71 0.15
72 0.13
73 0.09
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.15
83 0.2
84 0.24
85 0.26
86 0.27
87 0.32
88 0.32
89 0.35
90 0.35
91 0.31
92 0.28
93 0.29
94 0.31
95 0.27
96 0.3
97 0.28
98 0.26
99 0.25
100 0.28
101 0.27
102 0.26
103 0.25
104 0.23
105 0.24
106 0.2
107 0.2
108 0.16
109 0.18
110 0.23
111 0.22
112 0.21
113 0.21
114 0.22
115 0.22
116 0.28
117 0.28
118 0.25
119 0.32
120 0.38
121 0.39
122 0.38
123 0.38
124 0.33
125 0.29
126 0.25
127 0.18
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.12
132 0.14
133 0.18
134 0.18
135 0.19
136 0.18
137 0.17
138 0.17
139 0.16
140 0.14
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.1
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.15
153 0.15
154 0.16
155 0.16
156 0.16
157 0.15
158 0.14
159 0.11
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.06
193 0.09
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.2
198 0.2
199 0.22
200 0.24
201 0.27
202 0.29
203 0.32
204 0.35
205 0.34
206 0.38
207 0.41
208 0.4
209 0.37
210 0.36
211 0.32
212 0.31
213 0.27
214 0.21
215 0.17
216 0.14
217 0.12
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.12
233 0.14
234 0.16
235 0.19
236 0.19
237 0.19
238 0.18
239 0.17
240 0.19
241 0.16
242 0.15
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.07
249 0.08
250 0.09
251 0.14
252 0.14
253 0.18
254 0.2
255 0.25
256 0.25
257 0.24
258 0.24
259 0.21
260 0.26
261 0.28
262 0.26
263 0.22
264 0.22
265 0.23
266 0.23
267 0.22
268 0.17
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.14
273 0.12
274 0.1
275 0.11
276 0.13
277 0.12
278 0.14
279 0.14
280 0.15
281 0.21
282 0.25
283 0.32
284 0.36
285 0.38
286 0.38
287 0.4
288 0.41
289 0.37
290 0.34
291 0.27
292 0.27
293 0.26
294 0.25
295 0.24
296 0.21
297 0.19
298 0.18
299 0.17
300 0.11
301 0.11
302 0.12
303 0.1