Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40505

Protein Details
Accession P40505    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-28IQKVSNKDLSRKDKRRFNIESKVNKIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0033698  C:Rpd3L complex  
GO:0070210  C:Rpd3L-Expanded complex  
GO:0070822  C:Sin3-type complex  
GO:0042826  F:histone deacetylase binding  
GO:0043709  P:cell adhesion involved in single-species biofilm formation  
GO:0031507  P:heterochromatin formation  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0061188  P:negative regulation of rDNA heterochromatin formation  
GO:0061186  P:negative regulation of silent mating-type cassette heterochromatin formation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0061408  P:positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to heat stress  
GO:2000217  P:regulation of invasive growth in response to glucose limitation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YIL084C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MAIQKVSNKDLSRKDKRRFNIESKVNKIYQNFYSERDNQYKDRLTALQTDLTSLHQGDNGQYARQVRDLEEERDLELVRLRLFEEYRVSRSGIEFQEDIEKAKAEHEKLIKLCKERLYSSIEQKIKKLQEERLLMDVANVHSYAMNYSRPQYQKNTRSHTVSGWDSSSNEYGRDTANESATDTGAGNDRRTLRRRNASKDTRGNNNNQDESDFQTGNGSGSNGHGSRQGSQFPHFNNLTYKSGMNSDSDFLQGINEGTDLYAFLFGEKNPKDNANGNEKKKNRGAQRYSTKTAPPLQSLKPDEVTEDISLIRELTGQPPAPFRLRSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.79
3 0.83
4 0.85
5 0.84
6 0.82
7 0.81
8 0.81
9 0.82
10 0.79
11 0.79
12 0.72
13 0.67
14 0.61
15 0.56
16 0.5
17 0.48
18 0.43
19 0.39
20 0.43
21 0.44
22 0.48
23 0.5
24 0.51
25 0.46
26 0.52
27 0.55
28 0.49
29 0.47
30 0.43
31 0.38
32 0.39
33 0.39
34 0.35
35 0.29
36 0.3
37 0.26
38 0.25
39 0.24
40 0.19
41 0.16
42 0.13
43 0.14
44 0.14
45 0.19
46 0.19
47 0.17
48 0.19
49 0.21
50 0.21
51 0.24
52 0.24
53 0.19
54 0.26
55 0.29
56 0.3
57 0.3
58 0.29
59 0.27
60 0.27
61 0.26
62 0.19
63 0.18
64 0.16
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.15
69 0.15
70 0.17
71 0.21
72 0.22
73 0.25
74 0.26
75 0.26
76 0.24
77 0.25
78 0.29
79 0.23
80 0.23
81 0.2
82 0.19
83 0.25
84 0.24
85 0.24
86 0.19
87 0.18
88 0.15
89 0.19
90 0.23
91 0.17
92 0.23
93 0.24
94 0.28
95 0.3
96 0.37
97 0.37
98 0.37
99 0.4
100 0.4
101 0.4
102 0.37
103 0.38
104 0.38
105 0.38
106 0.42
107 0.46
108 0.45
109 0.43
110 0.43
111 0.47
112 0.43
113 0.44
114 0.41
115 0.38
116 0.41
117 0.43
118 0.44
119 0.39
120 0.36
121 0.3
122 0.26
123 0.22
124 0.14
125 0.11
126 0.09
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.11
135 0.17
136 0.19
137 0.22
138 0.28
139 0.36
140 0.43
141 0.5
142 0.56
143 0.53
144 0.55
145 0.53
146 0.47
147 0.42
148 0.34
149 0.28
150 0.22
151 0.19
152 0.15
153 0.16
154 0.17
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.08
170 0.07
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.14
175 0.18
176 0.23
177 0.28
178 0.34
179 0.38
180 0.47
181 0.54
182 0.59
183 0.66
184 0.69
185 0.73
186 0.75
187 0.71
188 0.71
189 0.68
190 0.66
191 0.63
192 0.6
193 0.53
194 0.44
195 0.41
196 0.33
197 0.34
198 0.31
199 0.23
200 0.17
201 0.17
202 0.17
203 0.15
204 0.14
205 0.1
206 0.06
207 0.07
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.14
212 0.14
213 0.18
214 0.2
215 0.24
216 0.22
217 0.25
218 0.29
219 0.27
220 0.33
221 0.3
222 0.29
223 0.29
224 0.32
225 0.32
226 0.29
227 0.27
228 0.22
229 0.24
230 0.23
231 0.2
232 0.17
233 0.16
234 0.14
235 0.15
236 0.14
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.17
254 0.18
255 0.2
256 0.22
257 0.24
258 0.27
259 0.33
260 0.38
261 0.4
262 0.48
263 0.52
264 0.6
265 0.61
266 0.66
267 0.66
268 0.69
269 0.68
270 0.7
271 0.71
272 0.71
273 0.79
274 0.8
275 0.78
276 0.74
277 0.68
278 0.62
279 0.63
280 0.57
281 0.52
282 0.5
283 0.49
284 0.53
285 0.54
286 0.53
287 0.48
288 0.43
289 0.39
290 0.35
291 0.34
292 0.26
293 0.23
294 0.18
295 0.16
296 0.16
297 0.14
298 0.12
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.19
303 0.21
304 0.23
305 0.27
306 0.31
307 0.35