Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40343

Protein Details
Accession P40343    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-58RSRRVNPKDSMRCIKKRILNHydrophilic
228-259DYDLKRHDDSKKSKKHRHKRKKDRDYSTPEDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-250SKKSKKHRHKRKKD
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR017073  HGS/VPS27  
IPR003903  UIM_dom  
IPR002014  VHS_dom  
IPR000306  Znf_FYVE  
IPR017455  Znf_FYVE-rel  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005768  C:endosome  
GO:0010008  C:endosome membrane  
GO:0033565  C:ESCRT-0 complex  
GO:0032991  C:protein-containing complex  
GO:0005774  C:vacuolar membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0032266  F:phosphatidylinositol-3-phosphate binding  
GO:0019904  F:protein domain specific binding  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:1904669  P:ATP export  
GO:0045324  P:late endosome to vacuole transport  
GO:0016237  P:lysosomal microautophagy  
GO:0140504  P:microlipophagy  
GO:0071985  P:multivesicular body sorting pathway  
GO:1903319  P:positive regulation of protein maturation  
GO:0045053  P:protein retention in Golgi apparatus  
GO:0009306  P:protein secretion  
GO:0006623  P:protein targeting to vacuole  
GO:0043328  P:protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway  
GO:0043162  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway  
KEGG sce:YNR006W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01363  FYVE  
PF02809  UIM  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
PS50179  VHS  
PS50178  ZF_FYVE  
CDD cd21385  GAT_Vps27  
cd16979  VHS_Vps27  
Amino Acid Sequences MSVSTPSELDALIEQATSESIPNGDLDLPIALEISDVLRSRRVNPKDSMRCIKKRILNTADNPNTQLSSWKLTNICVKNGGTPFIKEICSREFMDTMEHVILREDSNEELSELVKTILYELYVAFKNDSQLNYVAKVYDKLISRGIKFPEKLTLSNSPTAMFDSKTPADWIDSDACMICSKKFSLLNRKHHCRSCGGVFCQEHSSNSIPLPDLGIYEPVRVCDSCFEDYDLKRHDDSKKSKKHRHKRKKDRDYSTPEDEEELIRKAIELSLKESRNSASSEPIVPVVESKNEVKRQEIEEEEDPDLKAAIQESLREAEEAKLRSERQKASRQMQPQQPSPQPQPIHSVDLSDEEKDSIYMFASLVEKMKSRPLNEILEDSKLQNLAQRVFASKARLNYALNDKAQKYNTLIEMNGKISEIMNIYDRLLEQQLQSINLSQQYTLPQVPSDPYNYLTENVQNPAESYQTPPLQQLSSHQYKPQQDVSRQQSVKANSSPTTNIDHLKTIDVTPHAQQKPQSHVELAPSDPPYPKEEAEDEGTQAVQDEESSTQESRERPYPVETENGETSINKRPQGITRYDFPTVPARKFVQPESTVPLPASSSEIPIKEERPPSPQEELLIEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.09
4 0.08
5 0.08
6 0.07
7 0.07
8 0.08
9 0.08
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.1
14 0.1
15 0.09
16 0.09
17 0.08
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.1
23 0.11
24 0.12
25 0.18
26 0.2
27 0.26
28 0.36
29 0.41
30 0.44
31 0.51
32 0.61
33 0.65
34 0.73
35 0.77
36 0.77
37 0.8
38 0.79
39 0.8
40 0.77
41 0.75
42 0.76
43 0.73
44 0.72
45 0.7
46 0.75
47 0.73
48 0.67
49 0.61
50 0.52
51 0.45
52 0.37
53 0.35
54 0.27
55 0.26
56 0.25
57 0.28
58 0.28
59 0.3
60 0.4
61 0.39
62 0.39
63 0.38
64 0.38
65 0.39
66 0.4
67 0.41
68 0.33
69 0.31
70 0.32
71 0.3
72 0.31
73 0.26
74 0.28
75 0.27
76 0.29
77 0.3
78 0.29
79 0.27
80 0.25
81 0.27
82 0.24
83 0.23
84 0.21
85 0.19
86 0.16
87 0.16
88 0.17
89 0.13
90 0.14
91 0.12
92 0.11
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.14
113 0.16
114 0.19
115 0.2
116 0.19
117 0.21
118 0.21
119 0.22
120 0.22
121 0.2
122 0.18
123 0.18
124 0.17
125 0.18
126 0.18
127 0.19
128 0.25
129 0.28
130 0.29
131 0.34
132 0.37
133 0.4
134 0.39
135 0.38
136 0.4
137 0.39
138 0.38
139 0.37
140 0.41
141 0.37
142 0.39
143 0.38
144 0.3
145 0.28
146 0.29
147 0.26
148 0.18
149 0.15
150 0.18
151 0.18
152 0.18
153 0.19
154 0.17
155 0.17
156 0.17
157 0.19
158 0.15
159 0.15
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.16
169 0.21
170 0.28
171 0.37
172 0.46
173 0.56
174 0.64
175 0.73
176 0.75
177 0.76
178 0.72
179 0.65
180 0.6
181 0.58
182 0.55
183 0.49
184 0.49
185 0.44
186 0.43
187 0.45
188 0.4
189 0.32
190 0.28
191 0.27
192 0.21
193 0.21
194 0.2
195 0.15
196 0.14
197 0.15
198 0.11
199 0.1
200 0.09
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.16
211 0.16
212 0.17
213 0.19
214 0.22
215 0.23
216 0.28
217 0.28
218 0.27
219 0.26
220 0.3
221 0.33
222 0.38
223 0.47
224 0.52
225 0.59
226 0.67
227 0.76
228 0.83
229 0.87
230 0.9
231 0.91
232 0.92
233 0.93
234 0.95
235 0.96
236 0.96
237 0.93
238 0.91
239 0.89
240 0.84
241 0.79
242 0.69
243 0.57
244 0.48
245 0.41
246 0.31
247 0.24
248 0.18
249 0.12
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.1
254 0.11
255 0.1
256 0.14
257 0.2
258 0.22
259 0.22
260 0.23
261 0.22
262 0.21
263 0.22
264 0.18
265 0.15
266 0.15
267 0.16
268 0.15
269 0.15
270 0.13
271 0.11
272 0.12
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.17
278 0.21
279 0.22
280 0.22
281 0.25
282 0.26
283 0.28
284 0.27
285 0.25
286 0.23
287 0.25
288 0.24
289 0.21
290 0.19
291 0.15
292 0.14
293 0.1
294 0.08
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.13
306 0.14
307 0.14
308 0.16
309 0.17
310 0.22
311 0.28
312 0.31
313 0.33
314 0.41
315 0.47
316 0.49
317 0.54
318 0.55
319 0.58
320 0.59
321 0.58
322 0.54
323 0.54
324 0.53
325 0.52
326 0.49
327 0.48
328 0.42
329 0.38
330 0.39
331 0.35
332 0.35
333 0.29
334 0.27
335 0.2
336 0.23
337 0.22
338 0.16
339 0.14
340 0.1
341 0.11
342 0.1
343 0.1
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.1
355 0.17
356 0.19
357 0.2
358 0.24
359 0.27
360 0.3
361 0.3
362 0.33
363 0.28
364 0.27
365 0.27
366 0.22
367 0.18
368 0.15
369 0.14
370 0.13
371 0.15
372 0.13
373 0.15
374 0.16
375 0.16
376 0.18
377 0.2
378 0.23
379 0.22
380 0.24
381 0.24
382 0.26
383 0.25
384 0.26
385 0.31
386 0.31
387 0.31
388 0.33
389 0.31
390 0.34
391 0.34
392 0.32
393 0.27
394 0.25
395 0.26
396 0.23
397 0.22
398 0.21
399 0.22
400 0.21
401 0.19
402 0.16
403 0.13
404 0.12
405 0.13
406 0.1
407 0.09
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.11
412 0.11
413 0.11
414 0.12
415 0.12
416 0.1
417 0.13
418 0.14
419 0.15
420 0.15
421 0.15
422 0.15
423 0.16
424 0.16
425 0.13
426 0.13
427 0.14
428 0.17
429 0.17
430 0.16
431 0.13
432 0.14
433 0.16
434 0.16
435 0.17
436 0.15
437 0.16
438 0.18
439 0.19
440 0.19
441 0.19
442 0.21
443 0.2
444 0.21
445 0.19
446 0.17
447 0.17
448 0.17
449 0.17
450 0.14
451 0.15
452 0.19
453 0.21
454 0.21
455 0.22
456 0.23
457 0.22
458 0.22
459 0.23
460 0.26
461 0.31
462 0.32
463 0.34
464 0.39
465 0.42
466 0.47
467 0.51
468 0.5
469 0.48
470 0.56
471 0.59
472 0.63
473 0.59
474 0.57
475 0.54
476 0.51
477 0.52
478 0.46
479 0.43
480 0.34
481 0.37
482 0.35
483 0.32
484 0.33
485 0.3
486 0.29
487 0.27
488 0.29
489 0.26
490 0.27
491 0.26
492 0.21
493 0.22
494 0.2
495 0.21
496 0.22
497 0.31
498 0.3
499 0.32
500 0.37
501 0.39
502 0.45
503 0.48
504 0.46
505 0.39
506 0.39
507 0.41
508 0.38
509 0.34
510 0.31
511 0.28
512 0.28
513 0.28
514 0.28
515 0.27
516 0.28
517 0.27
518 0.26
519 0.26
520 0.27
521 0.3
522 0.29
523 0.27
524 0.24
525 0.23
526 0.18
527 0.17
528 0.13
529 0.08
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.1
534 0.13
535 0.13
536 0.14
537 0.19
538 0.21
539 0.24
540 0.29
541 0.31
542 0.3
543 0.35
544 0.37
545 0.35
546 0.4
547 0.37
548 0.36
549 0.34
550 0.33
551 0.29
552 0.26
553 0.27
554 0.3
555 0.33
556 0.29
557 0.3
558 0.33
559 0.4
560 0.46
561 0.51
562 0.46
563 0.48
564 0.52
565 0.52
566 0.48
567 0.44
568 0.47
569 0.45
570 0.42
571 0.41
572 0.4
573 0.43
574 0.47
575 0.49
576 0.48
577 0.46
578 0.47
579 0.48
580 0.46
581 0.41
582 0.37
583 0.34
584 0.26
585 0.23
586 0.25
587 0.18
588 0.2
589 0.23
590 0.24
591 0.27
592 0.3
593 0.32
594 0.34
595 0.4
596 0.39
597 0.41
598 0.45
599 0.47
600 0.49
601 0.48
602 0.43