Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P29468

Protein Details
Accession P29468    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
521-547VFDENEKRPSKKSKRKNLDARHETVKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
527-539KRPSKKSKRKNLD
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 9.5, cyto_mito 8, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR011068  NuclTrfase_I-like_C  
IPR007012  PolA_pol_cen_dom  
IPR007010  PolA_pol_RNA-bd_dom  
IPR014492  PolyA_polymerase  
IPR002934  Polymerase_NTP_transf_dom  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0000287  F:magnesium ion binding  
GO:1990817  F:poly(A) RNA polymerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
GO:0071050  P:sno(s)RNA polyadenylation  
GO:0030846  P:termination of RNA polymerase II transcription, poly(A)-coupled  
KEGG sce:YKR002W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01909  NTP_transf_2  
PF04928  PAP_central  
PF04926  PAP_RNA-bind  
CDD cd05402  NT_PAP_TUTase  
Amino Acid Sequences MSSQKVFGITGPVSTVGATAAENKLNDSLIQELKKEGSFETEQETANRVQVLKILQELAQRFVYEVSKKKNMSDGMARDAGGKIFTYGSYRLGVHGPGSDIDTLVVVPKHVTREDFFTVFDSLLRERKELDEIAPVPDAFVPIIKIKFSGISIDLICARLDQPQVPLSLTLSDKNLLRNLDEKDLRALNGTRVTDEILELVPKPNVFRIALRAIKLWAQRRAVYANIFGFPGGVAWAMLVARICQLYPNACSAVILNRFFIILSEWNWPQPVILKPIEDGPLQVRVWNPKIYAQDRSHRMPVITPAYPSMCATHNITESTKKVILQEFVRGVQITNDIFSNKKSWANLFEKNDFFFRYKFYLEITAYTRGSDEQHLKWSGLVESKVRLLVMKLEVLAGIKIAHPFTKPFESSYCCPTEDDYEMIQDKYGSHKTETALNALKLVTDENKEEESIKDAPKAYLSTMYIGLDFNIENKKEKVDIHIPCTEFVNLCRSFNEDYGDHKVFNLALRFVKGYDLPDEVFDENEKRPSKKSKRKNLDARHETVKRSKSDAASGDNINGTTAAVDVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.11
7 0.13
8 0.16
9 0.16
10 0.17
11 0.18
12 0.18
13 0.18
14 0.16
15 0.19
16 0.22
17 0.24
18 0.24
19 0.25
20 0.27
21 0.28
22 0.27
23 0.22
24 0.23
25 0.23
26 0.23
27 0.26
28 0.26
29 0.26
30 0.26
31 0.29
32 0.24
33 0.24
34 0.25
35 0.2
36 0.18
37 0.21
38 0.21
39 0.2
40 0.2
41 0.2
42 0.19
43 0.25
44 0.26
45 0.26
46 0.25
47 0.23
48 0.22
49 0.22
50 0.26
51 0.27
52 0.32
53 0.36
54 0.43
55 0.44
56 0.46
57 0.51
58 0.48
59 0.47
60 0.49
61 0.45
62 0.44
63 0.44
64 0.42
65 0.36
66 0.35
67 0.29
68 0.21
69 0.17
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.13
74 0.13
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.17
79 0.18
80 0.18
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.13
85 0.15
86 0.13
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.08
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.11
96 0.14
97 0.16
98 0.19
99 0.18
100 0.24
101 0.28
102 0.27
103 0.26
104 0.25
105 0.24
106 0.22
107 0.21
108 0.17
109 0.15
110 0.2
111 0.21
112 0.19
113 0.2
114 0.22
115 0.25
116 0.24
117 0.22
118 0.24
119 0.24
120 0.25
121 0.25
122 0.23
123 0.2
124 0.18
125 0.17
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.11
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.15
150 0.16
151 0.17
152 0.17
153 0.17
154 0.14
155 0.16
156 0.16
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.16
161 0.18
162 0.2
163 0.18
164 0.18
165 0.22
166 0.23
167 0.29
168 0.29
169 0.27
170 0.28
171 0.28
172 0.27
173 0.25
174 0.23
175 0.19
176 0.23
177 0.22
178 0.19
179 0.18
180 0.19
181 0.16
182 0.15
183 0.12
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.17
196 0.23
197 0.25
198 0.26
199 0.25
200 0.23
201 0.27
202 0.31
203 0.32
204 0.31
205 0.31
206 0.32
207 0.33
208 0.35
209 0.32
210 0.28
211 0.26
212 0.21
213 0.19
214 0.17
215 0.14
216 0.12
217 0.1
218 0.08
219 0.05
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.07
233 0.08
234 0.09
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.11
239 0.1
240 0.15
241 0.17
242 0.16
243 0.15
244 0.14
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.1
249 0.07
250 0.09
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.11
257 0.14
258 0.14
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.17
264 0.19
265 0.15
266 0.14
267 0.11
268 0.14
269 0.14
270 0.15
271 0.14
272 0.17
273 0.19
274 0.2
275 0.2
276 0.19
277 0.25
278 0.26
279 0.32
280 0.32
281 0.37
282 0.4
283 0.42
284 0.41
285 0.36
286 0.34
287 0.27
288 0.29
289 0.26
290 0.22
291 0.19
292 0.18
293 0.18
294 0.18
295 0.17
296 0.14
297 0.11
298 0.12
299 0.13
300 0.14
301 0.15
302 0.16
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.2
307 0.19
308 0.17
309 0.19
310 0.19
311 0.21
312 0.2
313 0.23
314 0.2
315 0.2
316 0.2
317 0.18
318 0.15
319 0.13
320 0.14
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.14
330 0.15
331 0.16
332 0.23
333 0.28
334 0.34
335 0.37
336 0.4
337 0.39
338 0.39
339 0.38
340 0.33
341 0.29
342 0.23
343 0.21
344 0.19
345 0.19
346 0.18
347 0.18
348 0.2
349 0.19
350 0.21
351 0.21
352 0.22
353 0.22
354 0.21
355 0.2
356 0.16
357 0.17
358 0.19
359 0.2
360 0.18
361 0.24
362 0.25
363 0.24
364 0.24
365 0.24
366 0.21
367 0.2
368 0.2
369 0.15
370 0.16
371 0.17
372 0.16
373 0.15
374 0.14
375 0.11
376 0.13
377 0.13
378 0.13
379 0.12
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.08
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.12
392 0.16
393 0.21
394 0.21
395 0.22
396 0.25
397 0.3
398 0.31
399 0.35
400 0.33
401 0.28
402 0.28
403 0.28
404 0.28
405 0.24
406 0.24
407 0.19
408 0.2
409 0.21
410 0.21
411 0.19
412 0.15
413 0.14
414 0.18
415 0.22
416 0.2
417 0.2
418 0.23
419 0.24
420 0.31
421 0.31
422 0.31
423 0.31
424 0.28
425 0.28
426 0.25
427 0.24
428 0.18
429 0.18
430 0.16
431 0.14
432 0.15
433 0.17
434 0.18
435 0.18
436 0.19
437 0.18
438 0.19
439 0.22
440 0.22
441 0.23
442 0.23
443 0.23
444 0.25
445 0.25
446 0.22
447 0.22
448 0.21
449 0.19
450 0.19
451 0.19
452 0.17
453 0.16
454 0.15
455 0.11
456 0.1
457 0.12
458 0.16
459 0.17
460 0.2
461 0.21
462 0.23
463 0.25
464 0.26
465 0.3
466 0.33
467 0.37
468 0.4
469 0.45
470 0.44
471 0.42
472 0.43
473 0.37
474 0.29
475 0.25
476 0.28
477 0.23
478 0.23
479 0.23
480 0.24
481 0.26
482 0.26
483 0.29
484 0.22
485 0.26
486 0.33
487 0.34
488 0.31
489 0.28
490 0.27
491 0.24
492 0.27
493 0.25
494 0.21
495 0.21
496 0.23
497 0.24
498 0.23
499 0.25
500 0.22
501 0.22
502 0.21
503 0.22
504 0.2
505 0.2
506 0.23
507 0.2
508 0.2
509 0.2
510 0.2
511 0.2
512 0.28
513 0.31
514 0.31
515 0.38
516 0.48
517 0.57
518 0.64
519 0.73
520 0.76
521 0.82
522 0.91
523 0.95
524 0.94
525 0.94
526 0.92
527 0.87
528 0.86
529 0.8
530 0.75
531 0.74
532 0.7
533 0.62
534 0.6
535 0.6
536 0.54
537 0.56
538 0.54
539 0.51
540 0.49
541 0.46
542 0.43
543 0.38
544 0.34
545 0.27
546 0.22
547 0.16
548 0.11