Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q06505

Protein Details
Accession Q06505    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-151EEKLDRILKKPKVRRTRRDEDDLEBasic
312-342SEKLRKKSVMDSAKNRKKKSKSGEDPTSRGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-142KKPKVRR
317-332KKSVMDSAKNRKKKSK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0061629  F:RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0034243  P:regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG sce:YPR133C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSTADQEQPKVVEATPEDGTASSQKSTINAENENTKQNQSMEPQETSKGTSNDTKDPDNGEKNEEAAIDENSNVEAAERKRKHISTDFSDDDLEKEEHNDQSLQPTVENRASKDRDSSATPSSRQELEEKLDRILKKPKVRRTRRDEDDLEQYLDEKILRLKDEMNIAAQLDIDTLNKRIETGDTSLIAMQKVKLLPKVVSVLSKANLADTILDNNLLQSVRIWLEPLPDGSLPSFEIQKSLFAALNDLPVKTEHLKESGLGRVVIFYTKSKRVEAQLARLAEKLIAEWTRPIIGASDNYRDKRIMQLEFDSEKLRKKSVMDSAKNRKKKSKSGEDPTSRGSSVQTLYEQAAARRNRAAAPAQTTTDYKYAPVSNLSAVPTNARAVGVGSTLNNSEMYKRLTSRLNKKHK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.23
4 0.21
5 0.19
6 0.21
7 0.19
8 0.2
9 0.16
10 0.17
11 0.17
12 0.19
13 0.24
14 0.28
15 0.29
16 0.3
17 0.33
18 0.39
19 0.41
20 0.45
21 0.42
22 0.38
23 0.36
24 0.35
25 0.37
26 0.34
27 0.4
28 0.38
29 0.39
30 0.39
31 0.39
32 0.38
33 0.38
34 0.39
35 0.32
36 0.31
37 0.35
38 0.37
39 0.41
40 0.44
41 0.42
42 0.39
43 0.43
44 0.47
45 0.47
46 0.45
47 0.42
48 0.39
49 0.37
50 0.36
51 0.3
52 0.23
53 0.18
54 0.17
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.11
60 0.09
61 0.08
62 0.12
63 0.15
64 0.25
65 0.27
66 0.32
67 0.4
68 0.41
69 0.48
70 0.51
71 0.55
72 0.52
73 0.58
74 0.56
75 0.49
76 0.49
77 0.42
78 0.34
79 0.31
80 0.24
81 0.16
82 0.16
83 0.18
84 0.17
85 0.18
86 0.19
87 0.15
88 0.19
89 0.22
90 0.2
91 0.18
92 0.19
93 0.22
94 0.26
95 0.27
96 0.25
97 0.31
98 0.33
99 0.34
100 0.36
101 0.35
102 0.32
103 0.34
104 0.36
105 0.33
106 0.35
107 0.35
108 0.34
109 0.34
110 0.33
111 0.3
112 0.29
113 0.25
114 0.26
115 0.3
116 0.29
117 0.28
118 0.32
119 0.31
120 0.33
121 0.4
122 0.42
123 0.45
124 0.53
125 0.61
126 0.67
127 0.76
128 0.82
129 0.83
130 0.85
131 0.83
132 0.83
133 0.76
134 0.69
135 0.67
136 0.59
137 0.5
138 0.39
139 0.33
140 0.24
141 0.21
142 0.16
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.17
151 0.17
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.11
157 0.09
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.11
177 0.09
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.14
183 0.14
184 0.15
185 0.17
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.15
192 0.13
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.08
199 0.06
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.08
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.07
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.09
231 0.12
232 0.11
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.13
237 0.12
238 0.15
239 0.15
240 0.17
241 0.14
242 0.15
243 0.16
244 0.16
245 0.18
246 0.18
247 0.18
248 0.16
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.16
256 0.22
257 0.24
258 0.24
259 0.27
260 0.29
261 0.37
262 0.38
263 0.4
264 0.4
265 0.4
266 0.39
267 0.37
268 0.34
269 0.25
270 0.21
271 0.14
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.09
281 0.1
282 0.13
283 0.16
284 0.22
285 0.27
286 0.28
287 0.3
288 0.3
289 0.29
290 0.33
291 0.36
292 0.31
293 0.29
294 0.31
295 0.35
296 0.35
297 0.36
298 0.32
299 0.29
300 0.33
301 0.32
302 0.31
303 0.28
304 0.29
305 0.34
306 0.4
307 0.48
308 0.5
309 0.58
310 0.68
311 0.75
312 0.81
313 0.8
314 0.8
315 0.77
316 0.79
317 0.79
318 0.79
319 0.79
320 0.82
321 0.87
322 0.85
323 0.8
324 0.75
325 0.68
326 0.57
327 0.47
328 0.38
329 0.31
330 0.25
331 0.24
332 0.2
333 0.18
334 0.19
335 0.23
336 0.23
337 0.21
338 0.28
339 0.27
340 0.29
341 0.3
342 0.31
343 0.29
344 0.32
345 0.35
346 0.33
347 0.37
348 0.37
349 0.36
350 0.37
351 0.36
352 0.35
353 0.33
354 0.27
355 0.22
356 0.23
357 0.23
358 0.23
359 0.24
360 0.23
361 0.22
362 0.24
363 0.25
364 0.23
365 0.22
366 0.23
367 0.21
368 0.21
369 0.19
370 0.17
371 0.15
372 0.13
373 0.14
374 0.12
375 0.12
376 0.11
377 0.12
378 0.13
379 0.14
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.18
384 0.22
385 0.25
386 0.27
387 0.31
388 0.39
389 0.49
390 0.57