Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q05635

Protein Details
Accession Q05635    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-339VSLPVKKVTKKIVQNKKPKVAIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
325-342TKKIVQNKKPKVAIGKGA
348-350KRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 15, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040456  RNase_H2_suB  
IPR019024  RNase_H2_suB_wHTH  
IPR041195  Rnh202_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032299  C:ribonuclease H2 complex  
GO:0043137  P:DNA replication, removal of RNA primer  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
GO:0090502  P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  
KEGG sce:YDR279W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09468  RNase_H2-Ydr279  
PF17745  Ydr279_N  
CDD cd09270  RNase_H2-B  
Amino Acid Sequences MTVSNIGGEERLIILPDDYETSKTINTFTLPPPSNITSKPRIELFENINGKLYEIRSFQFGKGPSYSHEEDLANDKYHYTKENHPIKSTFIVNTSDPTDGYVFNSSKIHFCSLYDIAFSLIGFYYRNSVSADEQDYSNSSDTGENQKSNSKTNEKFLTVRDYHDFLTDNHDKNWENISLSRLKSGLAKVSETIEEAGDVYYKITSAMITQFLLGKVSKIVENFPPSIPTLKNAPTEIKQCYKVVMATNLLVSLIPRAAYHNLLTFSPTMDSGCLNPDIKASFIELENYETTNELQNAERELLMKSAMNVGLNSNGRVSLPVKKVTKKIVQNKKPKVAIGKGAIDGFFKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.1
4 0.13
5 0.12
6 0.14
7 0.14
8 0.16
9 0.17
10 0.17
11 0.18
12 0.16
13 0.18
14 0.2
15 0.23
16 0.31
17 0.31
18 0.32
19 0.37
20 0.38
21 0.4
22 0.4
23 0.44
24 0.42
25 0.43
26 0.45
27 0.43
28 0.43
29 0.42
30 0.44
31 0.42
32 0.43
33 0.44
34 0.4
35 0.4
36 0.37
37 0.34
38 0.31
39 0.27
40 0.22
41 0.21
42 0.21
43 0.22
44 0.25
45 0.25
46 0.27
47 0.27
48 0.27
49 0.27
50 0.27
51 0.26
52 0.31
53 0.32
54 0.28
55 0.29
56 0.25
57 0.25
58 0.3
59 0.3
60 0.24
61 0.22
62 0.21
63 0.2
64 0.21
65 0.24
66 0.22
67 0.27
68 0.36
69 0.45
70 0.48
71 0.5
72 0.5
73 0.49
74 0.49
75 0.43
76 0.34
77 0.27
78 0.27
79 0.23
80 0.24
81 0.23
82 0.19
83 0.17
84 0.17
85 0.15
86 0.12
87 0.14
88 0.17
89 0.15
90 0.16
91 0.18
92 0.17
93 0.19
94 0.21
95 0.21
96 0.16
97 0.16
98 0.2
99 0.2
100 0.19
101 0.17
102 0.15
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.08
112 0.08
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.15
118 0.17
119 0.15
120 0.15
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.11
129 0.19
130 0.2
131 0.19
132 0.2
133 0.25
134 0.26
135 0.3
136 0.33
137 0.33
138 0.33
139 0.38
140 0.41
141 0.38
142 0.38
143 0.35
144 0.38
145 0.31
146 0.32
147 0.28
148 0.26
149 0.24
150 0.23
151 0.23
152 0.15
153 0.22
154 0.25
155 0.23
156 0.22
157 0.25
158 0.24
159 0.24
160 0.26
161 0.19
162 0.15
163 0.15
164 0.17
165 0.19
166 0.19
167 0.18
168 0.16
169 0.15
170 0.17
171 0.17
172 0.18
173 0.14
174 0.15
175 0.14
176 0.16
177 0.15
178 0.13
179 0.13
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.09
206 0.12
207 0.14
208 0.18
209 0.2
210 0.19
211 0.2
212 0.19
213 0.22
214 0.2
215 0.18
216 0.19
217 0.21
218 0.23
219 0.23
220 0.26
221 0.26
222 0.3
223 0.33
224 0.33
225 0.32
226 0.3
227 0.3
228 0.28
229 0.27
230 0.25
231 0.23
232 0.2
233 0.18
234 0.18
235 0.16
236 0.15
237 0.12
238 0.09
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.09
244 0.11
245 0.13
246 0.14
247 0.16
248 0.17
249 0.16
250 0.18
251 0.15
252 0.14
253 0.14
254 0.13
255 0.1
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.12
260 0.14
261 0.14
262 0.13
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.13
269 0.13
270 0.15
271 0.14
272 0.16
273 0.17
274 0.17
275 0.15
276 0.14
277 0.15
278 0.17
279 0.17
280 0.15
281 0.16
282 0.17
283 0.19
284 0.19
285 0.19
286 0.15
287 0.16
288 0.15
289 0.14
290 0.13
291 0.11
292 0.14
293 0.15
294 0.15
295 0.14
296 0.15
297 0.2
298 0.21
299 0.21
300 0.18
301 0.17
302 0.16
303 0.19
304 0.2
305 0.22
306 0.26
307 0.34
308 0.4
309 0.46
310 0.52
311 0.58
312 0.65
313 0.66
314 0.72
315 0.75
316 0.78
317 0.83
318 0.87
319 0.88
320 0.84
321 0.79
322 0.78
323 0.73
324 0.72
325 0.68
326 0.62
327 0.55
328 0.52
329 0.47
330 0.4