Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q04305

Protein Details
Accession Q04305    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
325-347GLLAIRTKKKEKRSSDKENAPASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
332-336KKKEK
Subcellular Location(s) mito 9, nucl 8, cyto 5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018983  U3_snoRNA-assocProt_15_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0033553  C:rDNA heterochromatin  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0034455  C:t-UTP complex  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0045943  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase I  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG sce:YMR093W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09384  UTP15_C  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSTARPRIITSKAPLLPQQTTPEQRYWRQYTSAQLVKEHNSVTHISFNPQHPHDFAVTSSTRVQIFSSRTRQVIKTFSRFKDVVYSASFRSDGKLLCAGDATGLVSVYDSYNPRTILLSINASTHPTHVTKFHTQDNKILATASDDRVTRLWDISNAYEPQLELTGATDYVRTLSFIPAAPHLVATGSYDGLIRLYDTRSSGSTPIYSLNHDQPVENVIAVSPTQIVSCGGNNFKVWDLTSNKKLYERGNFNKAVTCLDYVENFDSPMQSALIASSLDGHVKVFDPLDNFQVKFGWKFSGPVLSCAVSPSTAQGNRHLVAGLSSGLLAIRTKKKEKRSSDKENAPASFNKNAKSNNFQRMMRGSEYQGDQEHIIHNDKVRSQRRMRAFERNINQFKWSEALDNAFVPGMAKELTLTVLQELRKRGKVRVALYGRDESTLEPLLNWCLKGIEDVRSASIVADWVAVVLELYGNTLESSPVLQELMIDLKTKVRHEIHKSKEAQRIEGMLQLLTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.51
3 0.49
4 0.46
5 0.47
6 0.46
7 0.5
8 0.51
9 0.54
10 0.55
11 0.58
12 0.64
13 0.64
14 0.6
15 0.57
16 0.56
17 0.57
18 0.59
19 0.58
20 0.5
21 0.48
22 0.48
23 0.48
24 0.48
25 0.41
26 0.33
27 0.3
28 0.3
29 0.28
30 0.31
31 0.28
32 0.29
33 0.33
34 0.39
35 0.44
36 0.44
37 0.44
38 0.37
39 0.39
40 0.37
41 0.32
42 0.26
43 0.25
44 0.23
45 0.23
46 0.24
47 0.24
48 0.22
49 0.22
50 0.23
51 0.22
52 0.27
53 0.33
54 0.39
55 0.4
56 0.43
57 0.47
58 0.49
59 0.48
60 0.52
61 0.51
62 0.53
63 0.58
64 0.57
65 0.6
66 0.57
67 0.52
68 0.52
69 0.46
70 0.4
71 0.35
72 0.36
73 0.29
74 0.32
75 0.32
76 0.22
77 0.23
78 0.23
79 0.19
80 0.19
81 0.23
82 0.21
83 0.2
84 0.2
85 0.18
86 0.14
87 0.14
88 0.11
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.09
96 0.1
97 0.13
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.18
102 0.18
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.18
107 0.19
108 0.19
109 0.2
110 0.19
111 0.17
112 0.18
113 0.16
114 0.17
115 0.18
116 0.24
117 0.29
118 0.33
119 0.4
120 0.44
121 0.45
122 0.48
123 0.49
124 0.44
125 0.37
126 0.34
127 0.26
128 0.22
129 0.24
130 0.21
131 0.19
132 0.18
133 0.19
134 0.19
135 0.21
136 0.17
137 0.15
138 0.14
139 0.14
140 0.16
141 0.17
142 0.2
143 0.19
144 0.19
145 0.18
146 0.17
147 0.15
148 0.14
149 0.12
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.09
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.11
169 0.11
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.14
193 0.14
194 0.16
195 0.17
196 0.19
197 0.22
198 0.22
199 0.21
200 0.18
201 0.19
202 0.17
203 0.14
204 0.1
205 0.06
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.13
225 0.17
226 0.2
227 0.26
228 0.27
229 0.27
230 0.29
231 0.31
232 0.3
233 0.34
234 0.38
235 0.37
236 0.42
237 0.43
238 0.41
239 0.41
240 0.38
241 0.31
242 0.23
243 0.19
244 0.14
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.09
273 0.1
274 0.14
275 0.15
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.15
282 0.13
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.19
287 0.19
288 0.2
289 0.2
290 0.19
291 0.18
292 0.18
293 0.18
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.13
298 0.15
299 0.16
300 0.2
301 0.23
302 0.23
303 0.24
304 0.22
305 0.16
306 0.14
307 0.14
308 0.1
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.1
316 0.16
317 0.22
318 0.3
319 0.37
320 0.47
321 0.57
322 0.66
323 0.72
324 0.75
325 0.81
326 0.83
327 0.84
328 0.82
329 0.78
330 0.69
331 0.61
332 0.55
333 0.49
334 0.46
335 0.4
336 0.35
337 0.34
338 0.36
339 0.37
340 0.42
341 0.45
342 0.47
343 0.51
344 0.49
345 0.48
346 0.48
347 0.48
348 0.43
349 0.38
350 0.3
351 0.29
352 0.3
353 0.28
354 0.25
355 0.22
356 0.19
357 0.18
358 0.19
359 0.17
360 0.19
361 0.18
362 0.2
363 0.22
364 0.25
365 0.34
366 0.38
367 0.45
368 0.48
369 0.55
370 0.61
371 0.67
372 0.68
373 0.7
374 0.7
375 0.7
376 0.72
377 0.74
378 0.7
379 0.63
380 0.6
381 0.49
382 0.43
383 0.36
384 0.29
385 0.21
386 0.17
387 0.19
388 0.17
389 0.17
390 0.16
391 0.14
392 0.13
393 0.11
394 0.09
395 0.08
396 0.07
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.09
404 0.13
405 0.15
406 0.19
407 0.25
408 0.29
409 0.36
410 0.39
411 0.41
412 0.46
413 0.51
414 0.5
415 0.55
416 0.54
417 0.52
418 0.54
419 0.55
420 0.47
421 0.41
422 0.38
423 0.28
424 0.27
425 0.24
426 0.19
427 0.15
428 0.15
429 0.19
430 0.2
431 0.19
432 0.16
433 0.14
434 0.14
435 0.19
436 0.2
437 0.2
438 0.22
439 0.23
440 0.24
441 0.23
442 0.23
443 0.19
444 0.17
445 0.12
446 0.09
447 0.08
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.05
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.07
469 0.09
470 0.12
471 0.12
472 0.13
473 0.13
474 0.18
475 0.22
476 0.24
477 0.3
478 0.34
479 0.42
480 0.51
481 0.61
482 0.64
483 0.7
484 0.76
485 0.76
486 0.78
487 0.72
488 0.66
489 0.6
490 0.55
491 0.47
492 0.44
493 0.36