FuNGI

P49955

Protein Details

Accession

P49955

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
91-110	AVVPRKRKSRWDVKGYEPPD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 9, mito_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0005634 C:nucleus GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0005686 C:U2 snRNP GO:0071004 C:U2-type prespliceosome GO:0005684 C:U2-type spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly GO:1903241 P:U2-type prespliceosome assembly
KEGG	sce:YMR288W -

Amino Acid Sequences

MSHPIQFVNANNSDKSHQLGGQYSIPQDLRENLQKEAARIGENEKDVLQEKMETRTVQNREDSYHKRRFDMKFEPDSDTQTVTSSENTQDAVVPRKRKSRWDVKGYEPPDESSTAVKENSDSALVNVEGIHDLMFFKPSDHKYFADVISKKPIDELNKDEKKERTLSMLLLKIKNGNTASRRTSMRILTDKAVTFGPEMIFNRLLPILLDRSLEDQERHLMIKTIDRVLYQLGDLTKPYVHKILVVAAPLLIDEDPMVRSTGQEIITNLSTVAGLKTILTVMRPDIENEDEYVRNVTSRAAAVVAKALGVNQLLPFINAACHSRKSWKARHTGIKIVQQIGILLGIGVLNHLTGLMSCIKDCLMDDHVPVRIVTAHTLSTLAENSYPYGIEVFNVVLEPLWKGIRSHRGKVLSSFLKAVGSMIPLMDPEYAGYYTTEAMRIIRREFDSPDDEMKKTILLVLQKCSAVESITPKFLREEIAPEFFQKFWVRRVALDRPLNKVVTYTTVTLAKKLGCSYTIDKLLTPLRDEAEPFRTMAVHAVTRTVNLLGTADLDERLETRLIDALLIAFQEQTNSDSIIFKGFGAVTVSLDIRMKPFLAPIVSTILNHLKHKTPLVRQHAADLCAILIPVIKNCHEFEMLNKLNIILYESLGEVYPEVLGSIINAMYCITSVMDLDKLQPPINQILPTLTPILRNKHRKVEVNTIKFVGLIGKLAPTYAPPKEWMRICFELLELLKSTNKEIRRSANATFGFIAEAIGPHDVLVALLNNLKVQERQLRVCTAVAIGIVAKVCGPYNVLPVIMNEYTTPETNVQNGVLKAMSFMFEYIGNMSKDYIYFITPLLEDALTDRDLVHRQTASNVITHLALNCSGTGHEDAFIHLMNLLIPNIFETSPHAIMRILEGLEALSQALGPGLFMNYIWAGLFHPAKNVRKAFWRVYNNMYVMYQDAMVPFYPVTPDNNEEYIEELDLVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.34
3	0.29
4	0.25
5	0.26
6	0.28
7	0.3
8	0.32
9	0.34
10	0.31
11	0.33
12	0.31
13	0.29
14	0.28
15	0.27
16	0.29
17	0.35
18	0.36
19	0.33
20	0.4
21	0.4
22	0.39
23	0.41
24	0.37
25	0.3
26	0.29
27	0.33
28	0.32
29	0.31
30	0.31
31	0.26
32	0.27
33	0.26
34	0.26
35	0.22
36	0.21
37	0.22
38	0.26
39	0.3
40	0.28
41	0.32
42	0.39
43	0.43
44	0.43
45	0.47
46	0.44
47	0.44
48	0.52
49	0.56
50	0.56
51	0.61
52	0.58
53	0.57
54	0.63
55	0.64
56	0.64
57	0.65
58	0.65
59	0.64
60	0.65
61	0.67
62	0.6
63	0.59
64	0.52
65	0.44
66	0.35
67	0.27
68	0.26
69	0.2
70	0.21
71	0.18
72	0.18
73	0.17
74	0.18
75	0.17
76	0.19
77	0.21
78	0.28
79	0.32
80	0.38
81	0.43
82	0.52
83	0.55
84	0.62
85	0.68
86	0.7
87	0.73
88	0.77
89	0.77
90	0.76
91	0.82
92	0.75
93	0.72
94	0.62
95	0.55
96	0.47
97	0.42
98	0.34
99	0.27
100	0.26
101	0.23
102	0.22
103	0.19
104	0.17
105	0.17
106	0.18
107	0.16
108	0.14
109	0.12
110	0.14
111	0.14
112	0.13
113	0.11
114	0.11
115	0.09
116	0.09
117	0.09
118	0.06
119	0.07
120	0.07
121	0.09
122	0.09
123	0.1
124	0.18
125	0.22
126	0.28
127	0.31
128	0.32
129	0.34
130	0.38
131	0.39
132	0.41
133	0.38
134	0.35
135	0.41
136	0.41
137	0.37
138	0.35
139	0.37
140	0.34
141	0.38
142	0.42
143	0.43
144	0.5
145	0.52
146	0.55
147	0.54
148	0.53
149	0.52
150	0.46
151	0.41
152	0.36
153	0.38
154	0.39
155	0.41
156	0.41
157	0.38
158	0.38
159	0.37
160	0.35
161	0.38
162	0.33
163	0.34
164	0.33
165	0.38
166	0.41
167	0.41
168	0.43
169	0.41
170	0.44
171	0.41
172	0.44
173	0.44
174	0.43
175	0.41
176	0.43
177	0.39
178	0.35
179	0.32
180	0.25
181	0.2
182	0.18
183	0.16
184	0.16
185	0.17
186	0.2
187	0.2
188	0.19
189	0.2
190	0.18
191	0.18
192	0.13
193	0.15
194	0.13
195	0.13
196	0.14
197	0.13
198	0.16
199	0.18
200	0.19
201	0.17
202	0.16
203	0.19
204	0.2
205	0.2
206	0.18
207	0.18
208	0.17
209	0.22
210	0.24
211	0.24
212	0.23
213	0.22
214	0.23
215	0.21
216	0.21
217	0.15
218	0.15
219	0.12
220	0.12
221	0.12
222	0.13
223	0.14
224	0.14
225	0.16
226	0.16
227	0.15
228	0.16
229	0.16
230	0.19
231	0.18
232	0.18
233	0.16
234	0.13
235	0.13
236	0.11
237	0.11
238	0.07
239	0.05
240	0.04
241	0.05
242	0.06
243	0.07
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.09
248	0.13
249	0.13
250	0.14
251	0.14
252	0.16
253	0.17
254	0.17
255	0.15
256	0.11
257	0.1
258	0.09
259	0.08
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.07
268	0.08
269	0.1
270	0.1
271	0.11
272	0.13
273	0.15
274	0.15
275	0.16
276	0.18
277	0.16
278	0.16
279	0.17
280	0.14
281	0.12
282	0.12
283	0.11
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.1
291	0.09
292	0.08
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.08
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.07
304	0.08
305	0.08
306	0.11
307	0.12
308	0.14
309	0.16
310	0.22
311	0.3
312	0.37
313	0.45
314	0.5
315	0.56
316	0.61
317	0.69
318	0.68
319	0.68
320	0.66
321	0.64
322	0.6
323	0.53
324	0.46
325	0.36
326	0.31
327	0.23
328	0.17
329	0.1
330	0.06
331	0.04
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.02
337	0.02
338	0.03
339	0.02
340	0.02
341	0.04
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.09
349	0.1
350	0.12
351	0.12
352	0.14
353	0.15
354	0.16
355	0.16
356	0.16
357	0.14
358	0.11
359	0.1
360	0.11
361	0.1
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.06
375	0.07
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.04
384	0.04
385	0.05
386	0.05
387	0.06
388	0.06
389	0.07
390	0.12
391	0.22
392	0.27
393	0.3
394	0.35
395	0.38
396	0.39
397	0.4
398	0.43
399	0.35
400	0.32
401	0.29
402	0.24
403	0.2
404	0.18
405	0.17
406	0.1
407	0.08
408	0.07
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.06
413	0.06
414	0.05
415	0.04
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.06
425	0.07
426	0.1
427	0.11
428	0.12
429	0.15
430	0.16
431	0.17
432	0.18
433	0.21
434	0.21
435	0.21
436	0.26
437	0.25
438	0.24
439	0.22
440	0.21
441	0.18
442	0.14
443	0.14
444	0.1
445	0.12
446	0.14
447	0.15
448	0.17
449	0.17
450	0.17
451	0.17
452	0.15
453	0.1
454	0.1
455	0.13
456	0.13
457	0.17
458	0.17
459	0.17
460	0.17
461	0.17
462	0.18
463	0.13
464	0.16
465	0.14
466	0.17
467	0.17
468	0.18
469	0.18
470	0.17
471	0.19
472	0.18
473	0.17
474	0.16
475	0.22
476	0.21
477	0.22
478	0.28
479	0.3
480	0.35
481	0.4
482	0.39
483	0.39
484	0.41
485	0.39
486	0.33
487	0.28
488	0.21
489	0.18
490	0.18
491	0.13
492	0.12
493	0.17
494	0.17
495	0.18
496	0.19
497	0.16
498	0.15
499	0.15
500	0.14
501	0.1
502	0.13
503	0.15
504	0.18
505	0.2
506	0.2
507	0.19
508	0.21
509	0.23
510	0.2
511	0.19
512	0.16
513	0.14
514	0.14
515	0.15
516	0.15
517	0.16
518	0.16
519	0.15
520	0.14
521	0.13
522	0.12
523	0.13
524	0.12
525	0.09
526	0.09
527	0.11
528	0.1
529	0.11
530	0.11
531	0.09
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.05
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.07
544	0.07
545	0.06
546	0.06
547	0.07
548	0.07
549	0.07
550	0.07
551	0.06
552	0.05
553	0.06
554	0.05
555	0.04
556	0.04
557	0.04
558	0.05
559	0.06
560	0.06
561	0.07
562	0.07
563	0.08
564	0.08
565	0.09
566	0.09
567	0.08
568	0.08
569	0.08
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.07
574	0.08
575	0.08
576	0.08
577	0.09
578	0.08
579	0.08
580	0.08
581	0.09
582	0.08
583	0.08
584	0.09
585	0.09
586	0.09
587	0.09
588	0.12
589	0.12
590	0.12
591	0.14
592	0.17
593	0.19
594	0.2
595	0.21
596	0.21
597	0.23
598	0.28
599	0.31
600	0.33
601	0.4
602	0.47
603	0.5
604	0.47
605	0.52
606	0.5
607	0.45
608	0.38
609	0.29
610	0.2
611	0.15
612	0.15
613	0.08
614	0.07
615	0.06
616	0.07
617	0.09
618	0.1
619	0.12
620	0.13
621	0.15
622	0.15
623	0.15
624	0.15
625	0.24
626	0.24
627	0.23
628	0.22
629	0.2
630	0.19
631	0.19
632	0.18
633	0.08
634	0.07
635	0.07
636	0.08
637	0.08
638	0.07
639	0.07
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.04
644	0.04
645	0.03
646	0.03
647	0.03
648	0.04
649	0.04
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.05
656	0.04
657	0.04
658	0.04
659	0.05
660	0.07
661	0.07
662	0.1
663	0.13
664	0.15
665	0.16
666	0.17
667	0.18
668	0.21
669	0.23
670	0.21
671	0.18
672	0.18
673	0.18
674	0.18
675	0.18
676	0.15
677	0.18
678	0.21
679	0.29
680	0.36
681	0.45
682	0.48
683	0.55
684	0.61
685	0.64
686	0.67
687	0.7
688	0.71
689	0.68
690	0.66
691	0.57
692	0.5
693	0.42
694	0.35
695	0.26
696	0.16
697	0.11
698	0.09
699	0.09
700	0.08
701	0.09
702	0.08
703	0.09
704	0.13
705	0.14
706	0.15
707	0.18
708	0.21
709	0.27
710	0.31
711	0.32
712	0.34
713	0.35
714	0.35
715	0.32
716	0.29
717	0.28
718	0.24
719	0.23
720	0.17
721	0.15
722	0.17
723	0.17
724	0.2
725	0.21
726	0.24
727	0.27
728	0.31
729	0.37
730	0.42
731	0.45
732	0.44
733	0.48
734	0.44
735	0.42
736	0.37
737	0.3
738	0.23
739	0.19
740	0.18
741	0.09
742	0.08
743	0.07
744	0.07
745	0.06
746	0.06
747	0.06
748	0.05
749	0.05
750	0.06
751	0.05
752	0.06
753	0.07
754	0.08
755	0.08
756	0.09
757	0.1
758	0.1
759	0.15
760	0.22
761	0.25
762	0.3
763	0.33
764	0.35
765	0.35
766	0.35
767	0.31
768	0.23
769	0.19
770	0.14
771	0.11
772	0.08
773	0.08
774	0.07
775	0.06
776	0.06
777	0.06
778	0.07
779	0.07
780	0.09
781	0.09
782	0.13
783	0.14
784	0.14
785	0.14
786	0.14
787	0.19
788	0.17
789	0.16
790	0.13
791	0.16
792	0.17
793	0.18
794	0.19
795	0.16
796	0.17
797	0.18
798	0.2
799	0.18
800	0.2
801	0.19
802	0.18
803	0.16
804	0.15
805	0.14
806	0.13
807	0.13
808	0.09
809	0.09
810	0.08
811	0.09
812	0.09
813	0.11
814	0.15
815	0.14
816	0.14
817	0.15
818	0.14
819	0.14
820	0.16
821	0.15
822	0.12
823	0.12
824	0.12
825	0.13
826	0.12
827	0.13
828	0.12
829	0.11
830	0.1
831	0.11
832	0.13
833	0.12
834	0.12
835	0.11
836	0.13
837	0.16
838	0.18
839	0.21
840	0.2
841	0.2
842	0.23
843	0.28
844	0.26
845	0.24
846	0.23
847	0.2
848	0.19
849	0.19
850	0.17
851	0.14
852	0.13
853	0.12
854	0.12
855	0.11
856	0.11
857	0.13
858	0.14
859	0.12
860	0.13
861	0.13
862	0.14
863	0.14
864	0.14
865	0.12
866	0.1
867	0.09
868	0.08
869	0.09
870	0.09
871	0.07
872	0.07
873	0.08
874	0.1
875	0.1
876	0.1
877	0.13
878	0.19
879	0.21
880	0.22
881	0.21
882	0.2
883	0.2
884	0.23
885	0.21
886	0.16
887	0.12
888	0.12
889	0.12
890	0.11
891	0.11
892	0.08
893	0.05
894	0.05
895	0.05
896	0.05
897	0.05
898	0.05
899	0.05
900	0.06
901	0.06
902	0.06
903	0.08
904	0.08
905	0.08
906	0.08
907	0.08
908	0.08
909	0.14
910	0.18
911	0.16
912	0.24
913	0.32
914	0.38
915	0.47
916	0.49
917	0.47
918	0.53
919	0.6
920	0.61
921	0.63
922	0.65
923	0.61
924	0.65
925	0.68
926	0.6
927	0.55
928	0.46
929	0.37
930	0.3
931	0.26
932	0.2
933	0.14
934	0.13
935	0.12
936	0.12
937	0.13
938	0.11
939	0.11
940	0.13
941	0.13
942	0.16
943	0.2
944	0.23
945	0.27
946	0.28
947	0.28
948	0.26
949	0.28
950	0.26
951	0.21

P49955

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer