Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38789

Protein Details
Accession P38789    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAKRRQKKRTHAQLTPEQEQHydrophilic
367-416LEKRHAAKMRLKEQRKKEQEENIAKKKAVKDAKKQRKLERRKARAAEGGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
368-411EKRHAAKMRLKEQRKKEQEENIAKKKAVKDAKKQRKLERRKARA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0008361  P:regulation of cell size  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG sce:YHR066W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAKRRQKKRTHAQLTPEQEQGIPKSMVIRVGQTSLANHSLNQLVKDFRQIMQPHTAIKLKERKSNKLKDFVVMCGPLGVTHLFMFTQSEKTGNVSLKIARTPQGPTVTFQVLDYSLGRDIKKFLKRPKSLNNDDVLNPPLLVLNGFSTSKRSGEDDQDVNVEKVIVSMFQNIFPPLNPARTSLNSIKRVFMINKDRETGEISMRHYFIDIREVEISRNLKRLYKAKNNLSKTVPNLHRKEDISSLILDHDLGAYTSESEIEDDAIVRVVDNQDVKAKHSQSLKSQRTPVEKKDNKEREKETEEEDVEMEEPKPSENLQPTPRKKAIKLTELGPRLTLKLVKIEEGICSGKVLHHEFVQKSSEEIKALEKRHAAKMRLKEQRKKEQEENIAKKKAVKDAKKQRKLERRKARAAEGGEGQGKDDAMSDDESSSSDSEHYGSVPEDLDSDLFSEVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.78
3 0.69
4 0.58
5 0.5
6 0.46
7 0.4
8 0.36
9 0.28
10 0.24
11 0.26
12 0.26
13 0.29
14 0.26
15 0.27
16 0.23
17 0.25
18 0.26
19 0.23
20 0.23
21 0.23
22 0.27
23 0.24
24 0.22
25 0.22
26 0.26
27 0.26
28 0.26
29 0.25
30 0.24
31 0.24
32 0.31
33 0.31
34 0.27
35 0.34
36 0.34
37 0.35
38 0.4
39 0.41
40 0.37
41 0.39
42 0.42
43 0.35
44 0.42
45 0.47
46 0.44
47 0.51
48 0.55
49 0.61
50 0.67
51 0.77
52 0.75
53 0.75
54 0.72
55 0.7
56 0.65
57 0.58
58 0.53
59 0.43
60 0.35
61 0.26
62 0.24
63 0.17
64 0.17
65 0.14
66 0.09
67 0.08
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.11
72 0.11
73 0.14
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.17
78 0.22
79 0.21
80 0.21
81 0.2
82 0.23
83 0.24
84 0.26
85 0.26
86 0.24
87 0.24
88 0.26
89 0.29
90 0.33
91 0.31
92 0.3
93 0.33
94 0.32
95 0.3
96 0.27
97 0.22
98 0.16
99 0.16
100 0.15
101 0.12
102 0.13
103 0.16
104 0.17
105 0.16
106 0.19
107 0.26
108 0.34
109 0.4
110 0.47
111 0.55
112 0.61
113 0.68
114 0.75
115 0.77
116 0.76
117 0.74
118 0.67
119 0.6
120 0.55
121 0.5
122 0.41
123 0.31
124 0.23
125 0.17
126 0.15
127 0.11
128 0.1
129 0.07
130 0.06
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.12
135 0.13
136 0.14
137 0.14
138 0.17
139 0.18
140 0.22
141 0.28
142 0.26
143 0.25
144 0.27
145 0.27
146 0.24
147 0.21
148 0.15
149 0.1
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.17
162 0.14
163 0.17
164 0.17
165 0.18
166 0.21
167 0.22
168 0.28
169 0.3
170 0.37
171 0.41
172 0.41
173 0.4
174 0.37
175 0.39
176 0.35
177 0.35
178 0.36
179 0.35
180 0.36
181 0.36
182 0.35
183 0.33
184 0.35
185 0.28
186 0.23
187 0.2
188 0.2
189 0.21
190 0.21
191 0.2
192 0.17
193 0.16
194 0.13
195 0.16
196 0.14
197 0.13
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.19
202 0.21
203 0.17
204 0.21
205 0.2
206 0.21
207 0.25
208 0.31
209 0.35
210 0.43
211 0.5
212 0.54
213 0.62
214 0.62
215 0.63
216 0.6
217 0.54
218 0.47
219 0.48
220 0.47
221 0.47
222 0.46
223 0.45
224 0.46
225 0.44
226 0.43
227 0.37
228 0.31
229 0.23
230 0.21
231 0.18
232 0.14
233 0.13
234 0.1
235 0.07
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.13
260 0.14
261 0.17
262 0.22
263 0.22
264 0.25
265 0.3
266 0.33
267 0.37
268 0.48
269 0.52
270 0.51
271 0.55
272 0.56
273 0.6
274 0.63
275 0.61
276 0.62
277 0.61
278 0.61
279 0.67
280 0.71
281 0.67
282 0.69
283 0.66
284 0.62
285 0.62
286 0.59
287 0.52
288 0.48
289 0.43
290 0.36
291 0.32
292 0.24
293 0.2
294 0.19
295 0.15
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.09
300 0.1
301 0.14
302 0.18
303 0.24
304 0.31
305 0.41
306 0.46
307 0.54
308 0.59
309 0.59
310 0.57
311 0.61
312 0.6
313 0.58
314 0.56
315 0.51
316 0.53
317 0.51
318 0.49
319 0.41
320 0.34
321 0.27
322 0.27
323 0.25
324 0.18
325 0.21
326 0.22
327 0.21
328 0.22
329 0.21
330 0.2
331 0.21
332 0.21
333 0.15
334 0.14
335 0.13
336 0.13
337 0.17
338 0.2
339 0.18
340 0.21
341 0.27
342 0.28
343 0.31
344 0.32
345 0.27
346 0.26
347 0.27
348 0.25
349 0.2
350 0.2
351 0.25
352 0.29
353 0.3
354 0.34
355 0.36
356 0.38
357 0.47
358 0.53
359 0.51
360 0.52
361 0.59
362 0.64
363 0.69
364 0.75
365 0.75
366 0.77
367 0.83
368 0.85
369 0.84
370 0.81
371 0.81
372 0.82
373 0.84
374 0.84
375 0.82
376 0.77
377 0.7
378 0.68
379 0.62
380 0.61
381 0.6
382 0.59
383 0.61
384 0.68
385 0.78
386 0.82
387 0.87
388 0.88
389 0.89
390 0.91
391 0.91
392 0.91
393 0.9
394 0.9
395 0.88
396 0.84
397 0.81
398 0.73
399 0.67
400 0.6
401 0.55
402 0.49
403 0.42
404 0.36
405 0.29
406 0.26
407 0.2
408 0.18
409 0.14
410 0.11
411 0.13
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.14
416 0.14
417 0.13
418 0.12
419 0.1
420 0.1
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.11
425 0.12
426 0.13
427 0.13
428 0.12
429 0.12
430 0.12
431 0.12
432 0.11
433 0.11