FuNGI

P38088

Protein Details

Accession

P38088

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
159-186	NAAAKDDAEKKKRKKKVKQIKAVKLDDD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
167-179	EKKKRKKKVKQIK

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 8.5, cyto_mito 7, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006195 aa-tRNA-synth_II IPR045864 aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL IPR004154 Anticodon-bd IPR036621 Anticodon-bd_dom_sf IPR027031 Gly-tRNA_synthase/POLG2 IPR033731 GlyRS-like_core IPR002315 tRNA-synt_gly
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005759 C:mitochondrial matrix GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005524 F:ATP binding GO:0004820 F:glycine-tRNA ligase activity GO:0046983 F:protein dimerization activity GO:0016740 F:transferase activity GO:0015966 P:diadenosine tetraphosphate biosynthetic process GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006426 P:glycyl-tRNA aminoacylation GO:0070150 P:mitochondrial glycyl-tRNA aminoacylation
KEGG	sce:YBR121C -
Pfam	View protein in Pfam PF03129 HGTP_anticodon
PROSITE	View protein in PROSITE PS50862 AA_TRNA_LIGASE_II
CDD	cd00774 GlyRS-like_core cd00858 GlyRS_anticodon

Amino Acid Sequences

MSFFNISRRFYSQIVKKSVKIKRMSVEDIKKARAAVPFNREQLESVLRGRFFYAPAFDLYGGVSGLYDYGPPGCAFQNNIIDAWRKHFILEEDMLEVDCTMLTPYEVLKTSGHVDKFSDWMCRDLKTGEIFRADHLVEEVLEARLKGDQEARGLVEDANAAAKDDAEKKKRKKKVKQIKAVKLDDDVVKEYEEILAKIDGYSGPELGELMEKYDIGNPVTGETLESPRAFNLMFETAIGPSGQLKGYLRPETAQGQFLNFNKLLEFNNSKTPFASASIGKSFRNEISPRAGLLRVREFLMAEIEHFVDPLDKSHPKFNEIKDIKLSFLPRDVQEAGSTEPIVKTVGEAVASRMVDNETLGYFIARIYQFLMKIGVDESKLRFRQHMANEMAHYAADCWDGELKTSYGWIECVGCADRSAYDLTVHSKKTKEKLVVRQKLDNPIEVTKWEIDLTKKLFGPKFRKDAPKVESHLLNMSQDDLASKAELLKANGKFTIKVDGVDGEVELDDKLVKIEQRTKVEHVREYVPSVIEPSFGIGRIIYSVFEHSFWNRPEDNARSVLSFPPLVAPTKVLLVPLSNHKDLVPVTTEVAKILRKSQIPFKIDDSGVSIGKRYARNDELGTPFGVTIDFESAKDHSVTLRERDSTKQVRGSVENVIKAIRDITYNGASWEEGTKDLTPFIAQAEAEAETD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.59
3	0.6
4	0.66
5	0.7
6	0.69
7	0.67
8	0.65
9	0.64
10	0.67
11	0.69
12	0.7
13	0.71
14	0.72
15	0.71
16	0.67
17	0.61
18	0.55
19	0.51
20	0.47
21	0.44
22	0.43
23	0.46
24	0.5
25	0.51
26	0.53
27	0.49
28	0.44
29	0.42
30	0.39
31	0.33
32	0.31
33	0.32
34	0.3
35	0.3
36	0.31
37	0.28
38	0.25
39	0.25
40	0.23
41	0.2
42	0.21
43	0.23
44	0.2
45	0.19
46	0.18
47	0.16
48	0.12
49	0.1
50	0.08
51	0.06
52	0.06
53	0.06
54	0.05
55	0.05
56	0.06
57	0.08
58	0.08
59	0.1
60	0.11
61	0.13
62	0.15
63	0.2
64	0.25
65	0.25
66	0.25
67	0.26
68	0.3
69	0.3
70	0.33
71	0.31
72	0.25
73	0.24
74	0.27
75	0.27
76	0.28
77	0.29
78	0.25
79	0.22
80	0.22
81	0.22
82	0.18
83	0.16
84	0.1
85	0.07
86	0.06
87	0.05
88	0.05
89	0.05
90	0.06
91	0.07
92	0.1
93	0.11
94	0.13
95	0.13
96	0.15
97	0.19
98	0.25
99	0.25
100	0.23
101	0.24
102	0.23
103	0.27
104	0.26
105	0.29
106	0.24
107	0.28
108	0.28
109	0.27
110	0.28
111	0.25
112	0.27
113	0.26
114	0.28
115	0.27
116	0.29
117	0.28
118	0.28
119	0.31
120	0.26
121	0.21
122	0.19
123	0.16
124	0.12
125	0.12
126	0.12
127	0.09
128	0.09
129	0.09
130	0.08
131	0.1
132	0.1
133	0.11
134	0.14
135	0.16
136	0.17
137	0.19
138	0.19
139	0.18
140	0.19
141	0.17
142	0.13
143	0.11
144	0.09
145	0.09
146	0.09
147	0.08
148	0.07
149	0.07
150	0.1
151	0.17
152	0.26
153	0.33
154	0.43
155	0.52
156	0.62
157	0.72
158	0.8
159	0.83
160	0.86
161	0.89
162	0.9
163	0.91
164	0.92
165	0.93
166	0.92
167	0.85
168	0.75
169	0.65
170	0.58
171	0.49
172	0.4
173	0.32
174	0.23
175	0.2
176	0.18
177	0.16
178	0.15
179	0.14
180	0.11
181	0.1
182	0.1
183	0.09
184	0.09
185	0.1
186	0.08
187	0.09
188	0.1
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.07
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.11
201	0.12
202	0.11
203	0.12
204	0.11
205	0.11
206	0.12
207	0.11
208	0.09
209	0.09
210	0.11
211	0.13
212	0.13
213	0.13
214	0.12
215	0.13
216	0.13
217	0.11
218	0.11
219	0.1
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.09
224	0.1
225	0.1
226	0.07
227	0.06
228	0.08
229	0.07
230	0.08
231	0.09
232	0.13
233	0.18
234	0.21
235	0.2
236	0.2
237	0.22
238	0.25
239	0.26
240	0.25
241	0.2
242	0.19
243	0.23
244	0.23
245	0.26
246	0.21
247	0.2
248	0.16
249	0.18
250	0.17
251	0.19
252	0.21
253	0.18
254	0.28
255	0.29
256	0.29
257	0.27
258	0.27
259	0.23
260	0.21
261	0.22
262	0.14
263	0.15
264	0.2
265	0.21
266	0.2
267	0.2
268	0.2
269	0.19
270	0.24
271	0.22
272	0.2
273	0.24
274	0.24
275	0.23
276	0.23
277	0.24
278	0.19
279	0.21
280	0.22
281	0.17
282	0.18
283	0.17
284	0.16
285	0.15
286	0.15
287	0.12
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.08
297	0.12
298	0.14
299	0.15
300	0.21
301	0.22
302	0.25
303	0.3
304	0.3
305	0.37
306	0.35
307	0.36
308	0.35
309	0.35
310	0.32
311	0.29
312	0.29
313	0.19
314	0.2
315	0.2
316	0.15
317	0.18
318	0.18
319	0.16
320	0.15
321	0.16
322	0.14
323	0.12
324	0.12
325	0.09
326	0.08
327	0.08
328	0.07
329	0.06
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.04
345	0.05
346	0.05
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.08
351	0.07
352	0.07
353	0.09
354	0.1
355	0.11
356	0.11
357	0.12
358	0.08
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.11
365	0.17
366	0.2
367	0.2
368	0.2
369	0.22
370	0.29
371	0.3
372	0.36
373	0.33
374	0.32
375	0.32
376	0.32
377	0.29
378	0.21
379	0.18
380	0.1
381	0.07
382	0.06
383	0.05
384	0.06
385	0.08
386	0.08
387	0.09
388	0.1
389	0.09
390	0.08
391	0.09
392	0.09
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.08
404	0.09
405	0.1
406	0.08
407	0.08
408	0.09
409	0.14
410	0.17
411	0.19
412	0.21
413	0.24
414	0.28
415	0.32
416	0.38
417	0.41
418	0.45
419	0.54
420	0.63
421	0.68
422	0.67
423	0.69
424	0.67
425	0.68
426	0.61
427	0.54
428	0.45
429	0.38
430	0.35
431	0.28
432	0.27
433	0.17
434	0.17
435	0.14
436	0.13
437	0.13
438	0.18
439	0.2
440	0.21
441	0.22
442	0.27
443	0.3
444	0.37
445	0.43
446	0.45
447	0.5
448	0.54
449	0.62
450	0.61
451	0.66
452	0.62
453	0.61
454	0.58
455	0.55
456	0.49
457	0.41
458	0.4
459	0.32
460	0.29
461	0.21
462	0.18
463	0.14
464	0.12
465	0.11
466	0.08
467	0.08
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.1
472	0.12
473	0.14
474	0.2
475	0.21
476	0.23
477	0.25
478	0.25
479	0.23
480	0.23
481	0.28
482	0.21
483	0.2
484	0.19
485	0.17
486	0.17
487	0.15
488	0.14
489	0.08
490	0.07
491	0.07
492	0.06
493	0.05
494	0.05
495	0.05
496	0.05
497	0.07
498	0.08
499	0.13
500	0.21
501	0.28
502	0.34
503	0.37
504	0.42
505	0.49
506	0.52
507	0.51
508	0.47
509	0.44
510	0.4
511	0.39
512	0.36
513	0.28
514	0.23
515	0.22
516	0.18
517	0.15
518	0.13
519	0.12
520	0.11
521	0.11
522	0.11
523	0.08
524	0.08
525	0.09
526	0.09
527	0.08
528	0.08
529	0.11
530	0.11
531	0.12
532	0.14
533	0.15
534	0.22
535	0.23
536	0.28
537	0.25
538	0.27
539	0.33
540	0.35
541	0.37
542	0.33
543	0.33
544	0.29
545	0.3
546	0.29
547	0.25
548	0.21
549	0.17
550	0.18
551	0.19
552	0.19
553	0.18
554	0.17
555	0.15
556	0.18
557	0.18
558	0.14
559	0.13
560	0.13
561	0.15
562	0.23
563	0.29
564	0.27
565	0.27
566	0.26
567	0.29
568	0.27
569	0.28
570	0.22
571	0.17
572	0.18
573	0.2
574	0.2
575	0.18
576	0.21
577	0.21
578	0.19
579	0.23
580	0.27
581	0.29
582	0.33
583	0.41
584	0.47
585	0.47
586	0.49
587	0.48
588	0.48
589	0.44
590	0.41
591	0.36
592	0.3
593	0.29
594	0.26
595	0.23
596	0.19
597	0.25
598	0.29
599	0.27
600	0.32
601	0.33
602	0.37
603	0.39
604	0.43
605	0.42
606	0.39
607	0.37
608	0.3
609	0.26
610	0.22
611	0.19
612	0.13
613	0.1
614	0.13
615	0.13
616	0.12
617	0.15
618	0.15
619	0.18
620	0.18
621	0.17
622	0.14
623	0.2
624	0.24
625	0.27
626	0.31
627	0.33
628	0.35
629	0.4
630	0.48
631	0.49
632	0.52
633	0.53
634	0.52
635	0.53
636	0.54
637	0.51
638	0.51
639	0.48
640	0.44
641	0.38
642	0.35
643	0.3
644	0.27
645	0.26
646	0.18
647	0.14
648	0.14
649	0.18
650	0.21
651	0.21
652	0.21
653	0.21
654	0.2
655	0.19
656	0.2
657	0.16
658	0.14
659	0.17
660	0.18
661	0.18
662	0.18
663	0.18
664	0.16
665	0.15
666	0.15
667	0.15
668	0.12
669	0.12
670	0.14

P38088

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer