Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53927

Protein Details
Accession P53927    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-87QSGTHKIKRLNPKKQANEKKSKDKKTLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-84KIKRLNPKKQANEKKSKDKK
177-213YKYKKRVLVEKGITKPVKQLKDNMKQKHEERIKKLAK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, mito_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034469  Nop15_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
KEGG sce:YNL110C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12552  RRM_Nop15p  
Amino Acid Sequences MVKSTSKTSTKETVTKQPTEEKPIQEKEELALETSSSSSDEEDEKDEDEIEGLAASDDEQSGTHKIKRLNPKKQANEKKSKDKKTLEEYSGIIYVSRLPHGFHEKELSKYFAQFGDLKEVRLARNKKTGNSRHYGFLEFVNKEDAMIAQESMNNYLLMGHLLQVRVLPKGAKIEKLYKYKKRVLVEKGITKPVKQLKDNMKQKHEERIKKLAKSGIEFKW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.61
3 0.59
4 0.61
5 0.59
6 0.6
7 0.6
8 0.57
9 0.59
10 0.61
11 0.61
12 0.53
13 0.49
14 0.41
15 0.4
16 0.33
17 0.26
18 0.2
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.13
23 0.09
24 0.09
25 0.07
26 0.09
27 0.1
28 0.11
29 0.14
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.11
36 0.1
37 0.07
38 0.06
39 0.05
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.04
44 0.04
45 0.04
46 0.05
47 0.07
48 0.1
49 0.13
50 0.15
51 0.19
52 0.24
53 0.32
54 0.43
55 0.52
56 0.59
57 0.67
58 0.74
59 0.8
60 0.86
61 0.89
62 0.88
63 0.88
64 0.85
65 0.86
66 0.86
67 0.84
68 0.82
69 0.77
70 0.74
71 0.72
72 0.72
73 0.63
74 0.55
75 0.48
76 0.4
77 0.35
78 0.27
79 0.18
80 0.11
81 0.11
82 0.09
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.12
87 0.18
88 0.19
89 0.17
90 0.22
91 0.23
92 0.26
93 0.27
94 0.27
95 0.21
96 0.21
97 0.21
98 0.15
99 0.16
100 0.15
101 0.14
102 0.2
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.21
107 0.21
108 0.27
109 0.3
110 0.24
111 0.33
112 0.35
113 0.38
114 0.47
115 0.53
116 0.51
117 0.54
118 0.52
119 0.48
120 0.48
121 0.44
122 0.35
123 0.3
124 0.3
125 0.24
126 0.23
127 0.21
128 0.19
129 0.17
130 0.16
131 0.13
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.2
157 0.22
158 0.25
159 0.29
160 0.37
161 0.43
162 0.53
163 0.61
164 0.62
165 0.68
166 0.71
167 0.74
168 0.73
169 0.74
170 0.71
171 0.72
172 0.71
173 0.72
174 0.69
175 0.71
176 0.65
177 0.57
178 0.58
179 0.56
180 0.55
181 0.49
182 0.53
183 0.55
184 0.64
185 0.73
186 0.74
187 0.73
188 0.73
189 0.74
190 0.76
191 0.75
192 0.74
193 0.72
194 0.74
195 0.74
196 0.7
197 0.73
198 0.68
199 0.63
200 0.6