FuNGI

P39112

Protein Details

Accession

P39112

Localization Confidence

Low

Confidence Score

5.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
18-47	SYTPCFRVTTRGKRQRSKSKQQAKVELDHT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 24, nucl 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR001900 RNase_II/R IPR022966 RNase_II/R_CS
Gene Ontology	GO:0000178 C:exosome (RNase complex) GO:0045025 C:mitochondrial degradosome GO:0005759 C:mitochondrial matrix GO:0005739 C:mitochondrion GO:0000932 C:P-body GO:0000175 F:3'-5'-RNA exonuclease activity GO:0008859 F:exoribonuclease II activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000957 P:mitochondrial RNA catabolic process GO:0006402 P:mRNA catabolic process
KEGG	sce:YMR287C -
Pfam	View protein in Pfam PF00773 RNB
PROSITE	View protein in PROSITE PS01175 RIBONUCLEASE_II

Amino Acid Sequences

MVVRRKVHVLLIARSFHSYTPCFRVTTRGKRQRSKSKQQAKVELDHTRELDNDQATETVVDRSVGPEKDIESINKDFLQRTKGLEPDIELKQLPQIKQEFNQRYKDRYVKPSEDWYVNSWRSLTKPKIPLYKLINSDFQLITKLKAPNPMEFQPVQLMESPLNVGDFVLLKMRPNELAMCVSLPSSTMDPRYTFVTIDGTMCFATKNRVLLRIPHKLPAGIHSLIQPESHHKHLPIGTVKNFSNQTNILPIVARQLITSRYPAQISKLAWKDLPITTKKLQLLHRSLQNYMGPWQIPFFTLVGLVQKLDLNKALDDKNGINYLTSLVNNYHTVNDIPINSPTFVSTYWAIMQQQESNLWGEIHLNTALLSPISVTIIPLKSQHLYYAQVIEKLEANSYREVNKFVKLVNERKYRDISALYPSVIQLLKDFAAGNFHNNGIIVALISKIFRKIERYKDCDITRDICQDLINEITPNSIPNPLLLNMDLALPASSKLVKWQQKLYDLTNIEELQWKKSGTDDDRYDFGDLRVFCIDSETAHEIDDGVSVKNYGRDGLYTLYIHIADPTSMFPESTNVDIEGISTDILNVALKRSFTTYLPDTVVPMLPQSICHLSDLGKQGQRTKTISFSVDVKITSKCSGKSIEIMYDSFKIRKGIVSNFPKATYEDVDRILGTPNSEASPVKKDLESLSMISKLLREQRIKNSNAVIFGEGFNKGLVMLNADSEGELTEVTFSDQEETLSTILVSEMMILANTLTGRYFAENKIGGVFRCYKQLPLGEVAQQQYDSMITSTKKGIFPKLKDIVKLSSLLNSSFYTGRPFRHEMIGAKQYLTVTSPLRRFPDLINHLQIHRHLQKKPLCFNQTQIDSLIWPIQSRADILKRASRNSSTYWTLNYLKKLTKLEPERTFDVMVTSVPQNGFTGCVFPDLSFARGTLKLHPSSMHYPMIGDIVKNCKISKIDCLEGMLELEKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.4
3	0.35
4	0.35
5	0.32
6	0.31
7	0.35
8	0.36
9	0.35
10	0.35
11	0.43
12	0.47
13	0.55
14	0.61
15	0.64
16	0.72
17	0.79
18	0.89
19	0.91
20	0.91
21	0.91
22	0.91
23	0.92
24	0.91
25	0.91
26	0.91
27	0.86
28	0.83
29	0.79
30	0.75
31	0.69
32	0.64
33	0.55
34	0.46
35	0.41
36	0.36
37	0.34
38	0.28
39	0.24
40	0.2
41	0.19
42	0.18
43	0.18
44	0.17
45	0.13
46	0.12
47	0.12
48	0.11
49	0.14
50	0.2
51	0.2
52	0.2
53	0.2
54	0.21
55	0.24
56	0.27
57	0.26
58	0.25
59	0.27
60	0.29
61	0.3
62	0.31
63	0.3
64	0.31
65	0.35
66	0.32
67	0.35
68	0.37
69	0.37
70	0.37
71	0.35
72	0.35
73	0.35
74	0.35
75	0.32
76	0.27
77	0.24
78	0.28
79	0.33
80	0.3
81	0.31
82	0.35
83	0.36
84	0.42
85	0.52
86	0.56
87	0.57
88	0.66
89	0.63
90	0.63
91	0.68
92	0.71
93	0.68
94	0.68
95	0.71
96	0.67
97	0.67
98	0.7
99	0.67
100	0.62
101	0.56
102	0.51
103	0.51
104	0.46
105	0.42
106	0.35
107	0.31
108	0.32
109	0.39
110	0.41
111	0.41
112	0.48
113	0.54
114	0.63
115	0.63
116	0.66
117	0.64
118	0.65
119	0.62
120	0.57
121	0.55
122	0.47
123	0.49
124	0.41
125	0.35
126	0.32
127	0.27
128	0.25
129	0.26
130	0.29
131	0.27
132	0.35
133	0.37
134	0.39
135	0.44
136	0.45
137	0.45
138	0.4
139	0.4
140	0.36
141	0.34
142	0.28
143	0.24
144	0.23
145	0.17
146	0.18
147	0.17
148	0.12
149	0.12
150	0.1
151	0.08
152	0.07
153	0.08
154	0.08
155	0.11
156	0.11
157	0.13
158	0.15
159	0.17
160	0.16
161	0.17
162	0.18
163	0.17
164	0.18
165	0.17
166	0.16
167	0.14
168	0.13
169	0.12
170	0.11
171	0.11
172	0.11
173	0.12
174	0.15
175	0.17
176	0.18
177	0.19
178	0.22
179	0.21
180	0.19
181	0.18
182	0.18
183	0.17
184	0.17
185	0.16
186	0.13
187	0.12
188	0.12
189	0.12
190	0.09
191	0.13
192	0.14
193	0.2
194	0.21
195	0.27
196	0.28
197	0.36
198	0.44
199	0.49
200	0.48
201	0.47
202	0.46
203	0.43
204	0.42
205	0.37
206	0.35
207	0.25
208	0.24
209	0.21
210	0.23
211	0.21
212	0.21
213	0.19
214	0.21
215	0.24
216	0.28
217	0.28
218	0.27
219	0.31
220	0.32
221	0.38
222	0.37
223	0.4
224	0.39
225	0.41
226	0.41
227	0.41
228	0.42
229	0.35
230	0.33
231	0.27
232	0.25
233	0.24
234	0.24
235	0.19
236	0.17
237	0.16
238	0.16
239	0.16
240	0.15
241	0.11
242	0.13
243	0.15
244	0.16
245	0.2
246	0.18
247	0.19
248	0.21
249	0.21
250	0.23
251	0.26
252	0.26
253	0.31
254	0.31
255	0.31
256	0.3
257	0.3
258	0.3
259	0.29
260	0.34
261	0.29
262	0.32
263	0.32
264	0.38
265	0.39
266	0.41
267	0.44
268	0.46
269	0.49
270	0.49
271	0.53
272	0.5
273	0.48
274	0.46
275	0.41
276	0.34
277	0.29
278	0.26
279	0.2
280	0.18
281	0.18
282	0.14
283	0.13
284	0.13
285	0.11
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.13
297	0.12
298	0.12
299	0.16
300	0.16
301	0.15
302	0.17
303	0.17
304	0.17
305	0.18
306	0.17
307	0.14
308	0.13
309	0.14
310	0.13
311	0.12
312	0.11
313	0.1
314	0.12
315	0.13
316	0.13
317	0.12
318	0.12
319	0.12
320	0.12
321	0.13
322	0.12
323	0.12
324	0.14
325	0.15
326	0.14
327	0.14
328	0.13
329	0.12
330	0.11
331	0.12
332	0.11
333	0.1
334	0.11
335	0.12
336	0.12
337	0.13
338	0.14
339	0.13
340	0.13
341	0.12
342	0.12
343	0.12
344	0.12
345	0.11
346	0.1
347	0.09
348	0.09
349	0.1
350	0.09
351	0.08
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.05
357	0.04
358	0.04
359	0.05
360	0.04
361	0.05
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.11
366	0.12
367	0.13
368	0.13
369	0.15
370	0.13
371	0.15
372	0.15
373	0.19
374	0.18
375	0.19
376	0.19
377	0.18
378	0.18
379	0.16
380	0.17
381	0.13
382	0.14
383	0.14
384	0.15
385	0.18
386	0.17
387	0.2
388	0.2
389	0.21
390	0.2
391	0.19
392	0.25
393	0.28
394	0.34
395	0.39
396	0.46
397	0.46
398	0.49
399	0.51
400	0.45
401	0.41
402	0.36
403	0.28
404	0.24
405	0.23
406	0.2
407	0.17
408	0.16
409	0.16
410	0.14
411	0.13
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.09
416	0.09
417	0.06
418	0.1
419	0.11
420	0.12
421	0.12
422	0.12
423	0.11
424	0.11
425	0.11
426	0.06
427	0.06
428	0.04
429	0.03
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.05
434	0.06
435	0.07
436	0.08
437	0.15
438	0.22
439	0.32
440	0.4
441	0.45
442	0.48
443	0.54
444	0.54
445	0.5
446	0.46
447	0.39
448	0.33
449	0.3
450	0.26
451	0.19
452	0.19
453	0.16
454	0.14
455	0.12
456	0.1
457	0.08
458	0.08
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.08
464	0.07
465	0.08
466	0.09
467	0.09
468	0.1
469	0.1
470	0.09
471	0.08
472	0.08
473	0.07
474	0.05
475	0.05
476	0.04
477	0.04
478	0.05
479	0.05
480	0.04
481	0.08
482	0.17
483	0.22
484	0.24
485	0.29
486	0.32
487	0.37
488	0.4
489	0.38
490	0.37
491	0.33
492	0.31
493	0.29
494	0.26
495	0.2
496	0.23
497	0.22
498	0.17
499	0.18
500	0.17
501	0.15
502	0.16
503	0.21
504	0.19
505	0.25
506	0.26
507	0.26
508	0.27
509	0.28
510	0.27
511	0.22
512	0.19
513	0.17
514	0.14
515	0.14
516	0.13
517	0.12
518	0.11
519	0.12
520	0.12
521	0.08
522	0.12
523	0.12
524	0.11
525	0.11
526	0.11
527	0.1
528	0.1
529	0.11
530	0.08
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.07
535	0.08
536	0.08
537	0.08
538	0.07
539	0.07
540	0.09
541	0.1
542	0.11
543	0.1
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.1
548	0.09
549	0.07
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.08
558	0.1
559	0.1
560	0.1
561	0.08
562	0.09
563	0.09
564	0.09
565	0.07
566	0.06
567	0.05
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.05
573	0.04
574	0.05
575	0.07
576	0.07
577	0.08
578	0.1
579	0.11
580	0.11
581	0.16
582	0.17
583	0.18
584	0.2
585	0.19
586	0.18
587	0.17
588	0.17
589	0.12
590	0.11
591	0.09
592	0.08
593	0.08
594	0.1
595	0.11
596	0.11
597	0.12
598	0.12
599	0.12
600	0.17
601	0.21
602	0.23
603	0.23
604	0.24
605	0.3
606	0.33
607	0.36
608	0.34
609	0.32
610	0.3
611	0.3
612	0.3
613	0.25
614	0.24
615	0.22
616	0.21
617	0.2
618	0.18
619	0.17
620	0.17
621	0.19
622	0.19
623	0.18
624	0.19
625	0.21
626	0.21
627	0.23
628	0.23
629	0.23
630	0.22
631	0.21
632	0.21
633	0.21
634	0.21
635	0.18
636	0.18
637	0.17
638	0.16
639	0.18
640	0.2
641	0.23
642	0.31
643	0.38
644	0.41
645	0.41
646	0.41
647	0.39
648	0.37
649	0.34
650	0.27
651	0.23
652	0.2
653	0.2
654	0.2
655	0.19
656	0.18
657	0.18
658	0.15
659	0.13
660	0.11
661	0.11
662	0.11
663	0.12
664	0.12
665	0.12
666	0.17
667	0.19
668	0.2
669	0.19
670	0.2
671	0.2
672	0.23
673	0.22
674	0.18
675	0.18
676	0.17
677	0.17
678	0.16
679	0.15
680	0.15
681	0.21
682	0.26
683	0.29
684	0.34
685	0.44
686	0.52
687	0.53
688	0.53
689	0.51
690	0.46
691	0.43
692	0.39
693	0.3
694	0.22
695	0.21
696	0.19
697	0.14
698	0.13
699	0.1
700	0.09
701	0.08
702	0.08
703	0.07
704	0.08
705	0.08
706	0.08
707	0.09
708	0.09
709	0.08
710	0.07
711	0.08
712	0.05
713	0.05
714	0.04
715	0.04
716	0.05
717	0.06
718	0.06
719	0.06
720	0.08
721	0.08
722	0.08
723	0.09
724	0.1
725	0.09
726	0.09
727	0.09
728	0.07
729	0.06
730	0.06
731	0.05
732	0.04
733	0.04
734	0.04
735	0.04
736	0.04
737	0.04
738	0.04
739	0.05
740	0.05
741	0.04
742	0.05
743	0.06
744	0.09
745	0.12
746	0.12
747	0.18
748	0.19
749	0.19
750	0.22
751	0.23
752	0.21
753	0.22
754	0.27
755	0.22
756	0.28
757	0.28
758	0.26
759	0.29
760	0.32
761	0.3
762	0.28
763	0.3
764	0.28
765	0.31
766	0.31
767	0.27
768	0.24
769	0.21
770	0.18
771	0.16
772	0.11
773	0.08
774	0.11
775	0.11
776	0.13
777	0.17
778	0.21
779	0.25
780	0.27
781	0.36
782	0.41
783	0.45
784	0.52
785	0.57
786	0.56
787	0.55
788	0.56
789	0.5
790	0.43
791	0.41
792	0.32
793	0.28
794	0.27
795	0.24
796	0.23
797	0.2
798	0.2
799	0.19
800	0.19
801	0.21
802	0.23
803	0.25
804	0.3
805	0.34
806	0.34
807	0.38
808	0.41
809	0.37
810	0.43
811	0.46
812	0.4
813	0.36
814	0.35
815	0.3
816	0.27
817	0.25
818	0.21
819	0.18
820	0.24
821	0.28
822	0.31
823	0.35
824	0.36
825	0.36
826	0.35
827	0.42
828	0.42
829	0.44
830	0.46
831	0.45
832	0.44
833	0.45
834	0.44
835	0.43
836	0.44
837	0.45
838	0.42
839	0.49
840	0.54
841	0.6
842	0.67
843	0.67
844	0.66
845	0.61
846	0.63
847	0.64
848	0.6
849	0.53
850	0.45
851	0.36
852	0.3
853	0.3
854	0.28
855	0.19
856	0.15
857	0.15
858	0.15
859	0.15
860	0.16
861	0.21
862	0.23
863	0.28
864	0.31
865	0.39
866	0.42
867	0.46
868	0.5
869	0.48
870	0.46
871	0.47
872	0.49
873	0.46
874	0.44
875	0.42
876	0.42
877	0.44
878	0.45
879	0.46
880	0.45
881	0.44
882	0.48
883	0.5
884	0.49
885	0.53
886	0.56
887	0.6
888	0.63
889	0.64
890	0.62
891	0.6
892	0.56
893	0.46
894	0.4
895	0.3
896	0.23
897	0.2
898	0.17
899	0.17
900	0.17
901	0.17
902	0.16
903	0.15
904	0.17
905	0.14
906	0.15
907	0.12
908	0.14
909	0.14
910	0.13
911	0.18
912	0.18
913	0.19
914	0.17
915	0.17
916	0.19
917	0.21
918	0.22
919	0.26
920	0.32
921	0.32
922	0.33
923	0.35
924	0.37
925	0.41
926	0.44
927	0.39
928	0.32
929	0.3
930	0.29
931	0.32
932	0.26
933	0.21
934	0.21
935	0.25
936	0.29
937	0.31
938	0.31
939	0.31
940	0.34
941	0.35
942	0.41
943	0.41
944	0.4
945	0.39
946	0.41
947	0.37
948	0.34
949	0.33

P39112

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer