Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38833

Protein Details
Accession P38833    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MARNRTTSKKNVQSKRLIDRVVHydrophilic
70-94DKRTNVSQRNRKKGIKNNRPHKDINHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-85RKKGIK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 11, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000022  P:mitotic spindle elongation  
KEGG sce:YHR127W  -  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MARNRTTSKKNVQSKRLIDRVVPMDKIKKVGVAKKKTVEHTKEGFSVVNGKLVSSNDVGVLLREAQGAIDKRTNVSQRNRKKGIKNNRPHKDINSSPDWGNAHRGTDWQSEKANGMNRAKNSRNFTTNIKLQRQHFGEEIQGGSQLVISTNSDASDKLLMLFNLTLGVNQENLKNVLENISQVQIAQIRVRDLPSGSATAKVRLAYPTTQSLEKVRKLFHGALVDGRRIQVVIASDESSHLSY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.84
3 0.8
4 0.72
5 0.64
6 0.62
7 0.6
8 0.55
9 0.49
10 0.44
11 0.44
12 0.43
13 0.45
14 0.38
15 0.37
16 0.38
17 0.44
18 0.5
19 0.52
20 0.57
21 0.61
22 0.67
23 0.69
24 0.73
25 0.7
26 0.67
27 0.63
28 0.6
29 0.53
30 0.49
31 0.41
32 0.32
33 0.32
34 0.24
35 0.24
36 0.2
37 0.18
38 0.19
39 0.19
40 0.21
41 0.15
42 0.15
43 0.11
44 0.12
45 0.12
46 0.1
47 0.1
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.11
54 0.13
55 0.14
56 0.17
57 0.17
58 0.18
59 0.24
60 0.29
61 0.31
62 0.4
63 0.47
64 0.54
65 0.64
66 0.71
67 0.73
68 0.77
69 0.8
70 0.81
71 0.81
72 0.82
73 0.83
74 0.84
75 0.82
76 0.76
77 0.7
78 0.67
79 0.6
80 0.55
81 0.49
82 0.43
83 0.37
84 0.38
85 0.35
86 0.27
87 0.28
88 0.23
89 0.2
90 0.17
91 0.18
92 0.18
93 0.24
94 0.24
95 0.21
96 0.21
97 0.21
98 0.21
99 0.23
100 0.24
101 0.24
102 0.26
103 0.27
104 0.29
105 0.35
106 0.38
107 0.4
108 0.41
109 0.38
110 0.37
111 0.36
112 0.38
113 0.37
114 0.39
115 0.4
116 0.39
117 0.41
118 0.39
119 0.44
120 0.42
121 0.39
122 0.34
123 0.28
124 0.24
125 0.21
126 0.19
127 0.12
128 0.11
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.13
164 0.12
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.13
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.14
175 0.15
176 0.16
177 0.18
178 0.18
179 0.16
180 0.17
181 0.17
182 0.19
183 0.17
184 0.22
185 0.22
186 0.22
187 0.24
188 0.21
189 0.21
190 0.2
191 0.23
192 0.21
193 0.23
194 0.27
195 0.28
196 0.29
197 0.3
198 0.35
199 0.39
200 0.42
201 0.43
202 0.39
203 0.4
204 0.45
205 0.45
206 0.43
207 0.4
208 0.36
209 0.39
210 0.41
211 0.4
212 0.34
213 0.32
214 0.27
215 0.22
216 0.21
217 0.16
218 0.15
219 0.15
220 0.16
221 0.17
222 0.17
223 0.18