FuNGI

P38687

Protein Details

Accession

P38687

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-47	DFAKYHAKLNKKLQHLRSRCHLVT	Hydrophilic
90-111	ETLKLRARQRGKLKKSEEKVLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
95-105	RARQRGKLKKS

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026258 SRP68 IPR034652 SRP68-RBD IPR038253 SRP68_N_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0034399 C:nuclear periphery GO:0005730 C:nucleolus GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0030942 F:endoplasmic reticulum signal peptide binding GO:0005047 F:signal recognition particle binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane GO:0006617 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition
KEGG	sce:YPL243W -
Pfam	View protein in Pfam PF16969 SRP68
CDD	cd15481 SRP68-RBD

Amino Acid Sequences

MVAYSPIIATYGNRAEQFLETDSDFAKYHAKLNKKLQHLRSRCHLVTKDTKKYSSKNKYGEINSEDYDNKTKLIGVLILLHAERDLALAETLKLRARQRGKLKKSEEKVLSTRLKKACKTADKLVNVTQNEQQWITRAQYLAFAKLVHSEYLINGKRFKRKDNAKISNNLALVFAALEHLKNLSLLAEEVVDNIVNKYQYSLKQYAGNLITTPEINNFIVERVQSDENKDDELVKLLLDNGFNMKKITTSTEDQKVTTNINWRSFNAKIIDAEVAQFLEQGLSIHPTQITQYTQRLSKLEKALDRHEFFIANHDDQDDIDEMVENSSENNQIILAYIKYNILLTSISRERDLFTHLWNQWLKLNTSLPSKLTKYKEMERIVKNLTKYLSDIMELPGVYSDDELLSQLDLCKLYFQLFLNTGCLSVLYQSKGRYMEALALYVDAYRRLENKLSEIESLDEILLPANLLSLNSVRSLQKRIENGGNSVITLAEYEKRNHGGSLGKYDLTVIEKLDSKKILPTDIQLKNLFPLKPKMLPIPSKPTLFDLAFNYITYDKQEPSASQVKDSVTETESISQTPISNEQTEGEPKKKRGFLGLFGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.25
3	0.26
4	0.28
5	0.23
6	0.21
7	0.18
8	0.19
9	0.19
10	0.2
11	0.18
12	0.17
13	0.2
14	0.19
15	0.25
16	0.31
17	0.39
18	0.45
19	0.55
20	0.62
21	0.66
22	0.75
23	0.78
24	0.82
25	0.82
26	0.8
27	0.79
28	0.8
29	0.72
30	0.72
31	0.66
32	0.63
33	0.67
34	0.7
35	0.7
36	0.67
37	0.72
38	0.69
39	0.74
40	0.76
41	0.76
42	0.76
43	0.73
44	0.73
45	0.76
46	0.73
47	0.73
48	0.67
49	0.6
50	0.51
51	0.48
52	0.42
53	0.37
54	0.38
55	0.31
56	0.26
57	0.22
58	0.22
59	0.19
60	0.2
61	0.17
62	0.12
63	0.14
64	0.14
65	0.16
66	0.15
67	0.13
68	0.11
69	0.1
70	0.09
71	0.06
72	0.07
73	0.06
74	0.06
75	0.07
76	0.08
77	0.1
78	0.12
79	0.15
80	0.2
81	0.22
82	0.31
83	0.37
84	0.45
85	0.54
86	0.64
87	0.69
88	0.74
89	0.8
90	0.81
91	0.8
92	0.8
93	0.75
94	0.71
95	0.67
96	0.66
97	0.66
98	0.6
99	0.63
100	0.6
101	0.62
102	0.58
103	0.62
104	0.62
105	0.62
106	0.65
107	0.66
108	0.68
109	0.65
110	0.65
111	0.63
112	0.6
113	0.52
114	0.48
115	0.43
116	0.37
117	0.35
118	0.32
119	0.26
120	0.22
121	0.24
122	0.23
123	0.22
124	0.19
125	0.17
126	0.23
127	0.24
128	0.23
129	0.22
130	0.19
131	0.17
132	0.2
133	0.22
134	0.15
135	0.15
136	0.13
137	0.13
138	0.22
139	0.26
140	0.25
141	0.3
142	0.35
143	0.43
144	0.46
145	0.51
146	0.52
147	0.58
148	0.66
149	0.71
150	0.76
151	0.73
152	0.77
153	0.74
154	0.7
155	0.6
156	0.5
157	0.39
158	0.28
159	0.22
160	0.15
161	0.11
162	0.06
163	0.06
164	0.05
165	0.05
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.07
182	0.07
183	0.07
184	0.08
185	0.12
186	0.16
187	0.22
188	0.24
189	0.24
190	0.29
191	0.29
192	0.34
193	0.31
194	0.28
195	0.21
196	0.2
197	0.19
198	0.14
199	0.14
200	0.09
201	0.11
202	0.1
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.1
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.13
211	0.13
212	0.16
213	0.19
214	0.18
215	0.19
216	0.19
217	0.16
218	0.14
219	0.15
220	0.12
221	0.09
222	0.08
223	0.08
224	0.09
225	0.08
226	0.08
227	0.1
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.11
232	0.1
233	0.11
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.23
238	0.29
239	0.3
240	0.3
241	0.31
242	0.29
243	0.26
244	0.25
245	0.28
246	0.26
247	0.3
248	0.31
249	0.3
250	0.33
251	0.32
252	0.33
253	0.27
254	0.23
255	0.18
256	0.18
257	0.18
258	0.13
259	0.13
260	0.1
261	0.08
262	0.06
263	0.06
264	0.05
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.06
270	0.06
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.09
276	0.11
277	0.11
278	0.14
279	0.15
280	0.17
281	0.19
282	0.2
283	0.2
284	0.24
285	0.26
286	0.27
287	0.28
288	0.29
289	0.33
290	0.38
291	0.37
292	0.32
293	0.29
294	0.26
295	0.23
296	0.26
297	0.24
298	0.18
299	0.17
300	0.16
301	0.15
302	0.14
303	0.15
304	0.1
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.06
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.07
326	0.07
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.1
332	0.13
333	0.14
334	0.14
335	0.15
336	0.15
337	0.15
338	0.2
339	0.15
340	0.15
341	0.22
342	0.22
343	0.28
344	0.27
345	0.28
346	0.27
347	0.28
348	0.26
349	0.22
350	0.24
351	0.2
352	0.24
353	0.24
354	0.22
355	0.24
356	0.26
357	0.3
358	0.32
359	0.36
360	0.37
361	0.42
362	0.49
363	0.51
364	0.57
365	0.53
366	0.54
367	0.52
368	0.51
369	0.44
370	0.39
371	0.34
372	0.26
373	0.24
374	0.21
375	0.17
376	0.14
377	0.14
378	0.12
379	0.13
380	0.12
381	0.11
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.07
386	0.06
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.08
398	0.08
399	0.09
400	0.12
401	0.12
402	0.14
403	0.16
404	0.17
405	0.18
406	0.17
407	0.16
408	0.13
409	0.12
410	0.09
411	0.09
412	0.11
413	0.11
414	0.14
415	0.15
416	0.19
417	0.2
418	0.2
419	0.19
420	0.16
421	0.2
422	0.18
423	0.18
424	0.14
425	0.13
426	0.13
427	0.13
428	0.13
429	0.08
430	0.09
431	0.1
432	0.12
433	0.15
434	0.19
435	0.19
436	0.23
437	0.26
438	0.26
439	0.26
440	0.25
441	0.23
442	0.2
443	0.19
444	0.16
445	0.11
446	0.09
447	0.08
448	0.07
449	0.05
450	0.05
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.06
455	0.06
456	0.07
457	0.08
458	0.11
459	0.14
460	0.17
461	0.21
462	0.24
463	0.29
464	0.32
465	0.37
466	0.42
467	0.41
468	0.4
469	0.41
470	0.37
471	0.31
472	0.27
473	0.22
474	0.14
475	0.13
476	0.12
477	0.12
478	0.14
479	0.16
480	0.2
481	0.23
482	0.24
483	0.24
484	0.25
485	0.27
486	0.27
487	0.33
488	0.31
489	0.28
490	0.27
491	0.27
492	0.27
493	0.23
494	0.21
495	0.14
496	0.14
497	0.19
498	0.21
499	0.26
500	0.26
501	0.24
502	0.28
503	0.29
504	0.3
505	0.26
506	0.3
507	0.35
508	0.38
509	0.43
510	0.39
511	0.38
512	0.39
513	0.43
514	0.39
515	0.34
516	0.37
517	0.37
518	0.4
519	0.43
520	0.47
521	0.49
522	0.55
523	0.57
524	0.59
525	0.59
526	0.57
527	0.55
528	0.5
529	0.48
530	0.41
531	0.37
532	0.31
533	0.32
534	0.3
535	0.29
536	0.28
537	0.23
538	0.22
539	0.23
540	0.23
541	0.18
542	0.2
543	0.23
544	0.21
545	0.27
546	0.35
547	0.32
548	0.31
549	0.34
550	0.32
551	0.32
552	0.34
553	0.3
554	0.23
555	0.24
556	0.23
557	0.25
558	0.24
559	0.22
560	0.21
561	0.19
562	0.19
563	0.2
564	0.24
565	0.23
566	0.24
567	0.24
568	0.25
569	0.28
570	0.36
571	0.39
572	0.41
573	0.45
574	0.5
575	0.58
576	0.61
577	0.58
578	0.6
579	0.59

P38687

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer