Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P23179

Protein Details
Accession P23179    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-22ALEGLRKKYKTRQELVKALTPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002815  Spo11/TopoVI_A  
IPR013049  Spo11/TopoVI_A_N  
IPR036078  Spo11/TopoVI_A_sf  
IPR034136  TOPRIM_Topo6A/Spo11  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000794  C:condensed nuclear chromosome  
GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0045027  F:DNA end binding  
GO:0003918  F:DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0007129  P:homologous chromosome pairing at meiosis  
GO:0042138  P:meiotic DNA double-strand break formation  
GO:0000706  P:meiotic DNA double-strand break processing  
GO:0007131  P:reciprocal meiotic recombination  
GO:0030435  P:sporulation resulting in formation of a cellular spore  
GO:0007130  P:synaptonemal complex assembly  
KEGG sce:YHL022C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04406  TP6A_N  
CDD cd00223  TOPRIM_TopoIIB_SPO  
Amino Acid Sequences MALEGLRKKYKTRQELVKALTPKRRSIHLNSNGHSNGTPCSNADVLAHIKHFLSLAANSLEQHQQPISIVFQNKKKKGDTSSPDIHTTLDFPLNGPHLCTHQFKLKRCAILLNLLKVVMEKLPLGKNTTVRDIFYSNVELFQRQANVVQWLDVIRFNFKLSPRKSLNIIPAQKGLVYSPFPIDIYDNILTCENEPKMQKQTIFPGKPCLIPFFQDDAVIKLGTTSMCNIVIVEKEAVFTKLVNNYHKLSTNTMLITGKGFPDFLTRLFLKKLEQYCSKLISDCSIFTDADPYGISIALNYTHSNERNAYICTMANYKGIRITQVLAQNNEVHNKSIQLLSLNQRDYSLAKNLIASLTANSWDIATSPLKNVIIECQREIFFQKKAEMNEIDARIFEYK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.8
3 0.8
4 0.79
5 0.77
6 0.75
7 0.75
8 0.68
9 0.66
10 0.61
11 0.62
12 0.6
13 0.61
14 0.64
15 0.65
16 0.7
17 0.63
18 0.68
19 0.62
20 0.57
21 0.49
22 0.39
23 0.32
24 0.25
25 0.25
26 0.17
27 0.2
28 0.18
29 0.18
30 0.17
31 0.19
32 0.19
33 0.21
34 0.21
35 0.18
36 0.18
37 0.18
38 0.17
39 0.14
40 0.13
41 0.11
42 0.13
43 0.14
44 0.15
45 0.14
46 0.17
47 0.21
48 0.18
49 0.2
50 0.17
51 0.16
52 0.16
53 0.18
54 0.18
55 0.19
56 0.24
57 0.28
58 0.36
59 0.46
60 0.51
61 0.55
62 0.55
63 0.56
64 0.58
65 0.63
66 0.61
67 0.6
68 0.62
69 0.6
70 0.59
71 0.53
72 0.47
73 0.37
74 0.31
75 0.25
76 0.19
77 0.16
78 0.14
79 0.16
80 0.18
81 0.18
82 0.18
83 0.16
84 0.16
85 0.2
86 0.23
87 0.23
88 0.29
89 0.36
90 0.4
91 0.48
92 0.5
93 0.5
94 0.47
95 0.49
96 0.42
97 0.44
98 0.43
99 0.37
100 0.32
101 0.28
102 0.27
103 0.23
104 0.22
105 0.13
106 0.1
107 0.08
108 0.11
109 0.14
110 0.16
111 0.19
112 0.21
113 0.25
114 0.27
115 0.33
116 0.3
117 0.27
118 0.28
119 0.26
120 0.24
121 0.21
122 0.22
123 0.15
124 0.17
125 0.17
126 0.14
127 0.14
128 0.15
129 0.14
130 0.12
131 0.13
132 0.12
133 0.15
134 0.14
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.1
142 0.11
143 0.12
144 0.15
145 0.18
146 0.27
147 0.27
148 0.35
149 0.36
150 0.38
151 0.4
152 0.41
153 0.44
154 0.44
155 0.45
156 0.39
157 0.37
158 0.35
159 0.32
160 0.28
161 0.21
162 0.14
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.08
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.15
179 0.11
180 0.13
181 0.14
182 0.16
183 0.2
184 0.22
185 0.23
186 0.22
187 0.3
188 0.36
189 0.37
190 0.35
191 0.37
192 0.36
193 0.37
194 0.36
195 0.31
196 0.22
197 0.21
198 0.23
199 0.2
200 0.19
201 0.18
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.11
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.14
228 0.18
229 0.2
230 0.23
231 0.24
232 0.26
233 0.3
234 0.29
235 0.27
236 0.25
237 0.25
238 0.22
239 0.22
240 0.2
241 0.16
242 0.16
243 0.14
244 0.12
245 0.1
246 0.1
247 0.08
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.16
252 0.16
253 0.18
254 0.19
255 0.2
256 0.18
257 0.24
258 0.28
259 0.29
260 0.34
261 0.36
262 0.38
263 0.4
264 0.39
265 0.34
266 0.3
267 0.27
268 0.24
269 0.2
270 0.2
271 0.18
272 0.17
273 0.16
274 0.18
275 0.14
276 0.14
277 0.13
278 0.1
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.08
286 0.08
287 0.11
288 0.16
289 0.18
290 0.2
291 0.21
292 0.22
293 0.23
294 0.24
295 0.22
296 0.18
297 0.18
298 0.17
299 0.19
300 0.18
301 0.2
302 0.19
303 0.19
304 0.21
305 0.21
306 0.21
307 0.2
308 0.2
309 0.21
310 0.27
311 0.31
312 0.28
313 0.3
314 0.33
315 0.34
316 0.38
317 0.34
318 0.29
319 0.25
320 0.25
321 0.24
322 0.21
323 0.2
324 0.17
325 0.21
326 0.26
327 0.33
328 0.33
329 0.31
330 0.31
331 0.31
332 0.3
333 0.29
334 0.28
335 0.24
336 0.23
337 0.23
338 0.23
339 0.22
340 0.21
341 0.18
342 0.13
343 0.12
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.12
351 0.14
352 0.14
353 0.16
354 0.21
355 0.21
356 0.22
357 0.22
358 0.27
359 0.32
360 0.34
361 0.34
362 0.33
363 0.33
364 0.35
365 0.39
366 0.35
367 0.32
368 0.33
369 0.37
370 0.38
371 0.41
372 0.46
373 0.43
374 0.44
375 0.47
376 0.46
377 0.4
378 0.34