FuNGI

P12868

Protein Details

Accession

P12868

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
896-917	ESYDKELKEKNKKLKNTINSDQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 4, plas 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000547 Clathrin_H-chain/VPS_repeat IPR016528 VPS11 IPR024763 VPS11_C IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf IPR001965 Znf_PHD IPR001841 Znf_RING IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0033263 C:CORVET complex GO:0005829 C:cytosol GO:0031901 C:early endosome membrane GO:0005768 C:endosome GO:0000329 C:fungal-type vacuole membrane GO:0030897 C:HOPS complex GO:0046872 F:metal ion binding GO:0030674 F:protein-macromolecule adaptor activity GO:0061630 F:ubiquitin protein ligase activity GO:0007032 P:endosome organization GO:0006895 P:Golgi to endosome transport GO:0036205 P:histone catabolic process GO:0006886 P:intracellular protein transport GO:0045324 P:late endosome to vacuole transport GO:0048284 P:organelle fusion GO:0035542 P:regulation of SNARE complex assembly GO:0032889 P:regulation of vacuole fusion, non-autophagic GO:0042144 P:vacuole fusion, non-autophagic GO:0007033 P:vacuole organization GO:0006904 P:vesicle docking involved in exocytosis GO:0099022 P:vesicle tethering
KEGG	sce:YMR231W -
Pfam	View protein in Pfam PF12451 VPS11_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS50236 CHCR PS50089 ZF_RING_2
CDD	cd16688 RING-H2_Vps11

Amino Acid Sequences

MSLSSWRQFQLFENIPIRDPNFGGDSLLYSDPTLCAATIVDPQTLIIAVNSNIIKVVKLNQSQVIHEFQSFPHDFQITFLKVINGEFLVALAESIGKPSLIRVYKLEKLPNREQLYHSQVELKNGNNTYPISVVSISNDLSCIVVGFINGKIILIRGDISRDRGSQQRIIYEDPSKEPITALFLNNDATACFAATTSRILLFNTTGRNRGRPSLVLNSKNGLDLNCGSFNPATNEFICCLSNFIEFFSSSGKKHQFAFDLSLRKRIFCVDKDHILIVTEETGVPTTSISVNELSPTIINRIFIIDAKNKIISLNFVVSSAIIDIFSTSQSGKNITYLLTSEGVMHRITPKSLENQINIIIQKELYPFALQLAKQHSLSPLDVQEIHKKYGDYLFKKGLRKEATDQYIQCLDVVETSEIISKFGVKEVPDPESMRNLADYLWSLIKNSISQRDHVTLLLIVLIKLKDVEGIDTFIQHFDRKGIWNEGVVMDDMDDVTFFYSDNDFFDLDLILELMKESDFKRLSYRLAKKYSKDSLIIVDILLNLLHNPVKAIKYIKSLPIDETLRCLVTYSKKLLEESPNETNALLIEVFTGKFKPSTFEVDLDRRDTTGDFSENIRTVFYSYKTFFNYMNSNGTSDAMSESSEASHEHEEPTYHPPKPSIVFSSFVTKPFEFVVFLEACLACYQQYEGFDEDRQVILTTLYDLYLNLAQNDVPERIDDWRSRATGVLRESNKLVYSAASNNTSKRVDNSIMLLISHMDQSSASAKDKTKIDIASFANDNPEMDLLSTFRAMTLNEEPSTCLKFLEKYGTEEPKLLQVALSYFVSNKLIFKEMGGNEVLKEKVLRPIIEGERMPLLDIIKALSRTNVAHFGLIQDIIIDHVKTEDTEIKRNEKLIESYDKELKEKNKKLKNTINSDQPLHVPLKNQTCFMCRLTLDIPVVFFKCGHIYHQHCLNEEEDTLESERKLFKCPKCLVDLETSNKLFEAQHEVVEKNDLLNFALNSEEGSRDRFKVITEFLGRGAISYSDITI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.43
3	0.46
4	0.43
5	0.37
6	0.32
7	0.27
8	0.24
9	0.23
10	0.22
11	0.18
12	0.19
13	0.19
14	0.2
15	0.17
16	0.14
17	0.15
18	0.13
19	0.15
20	0.13
21	0.09
22	0.09
23	0.09
24	0.11
25	0.16
26	0.18
27	0.16
28	0.16
29	0.16
30	0.16
31	0.15
32	0.14
33	0.08
34	0.09
35	0.09
36	0.14
37	0.14
38	0.14
39	0.15
40	0.15
41	0.15
42	0.15
43	0.21
44	0.25
45	0.29
46	0.32
47	0.38
48	0.4
49	0.42
50	0.44
51	0.41
52	0.34
53	0.32
54	0.29
55	0.23
56	0.3
57	0.29
58	0.26
59	0.26
60	0.26
61	0.24
62	0.25
63	0.33
64	0.26
65	0.25
66	0.25
67	0.22
68	0.22
69	0.22
70	0.22
71	0.14
72	0.12
73	0.11
74	0.1
75	0.09
76	0.08
77	0.07
78	0.05
79	0.06
80	0.06
81	0.07
82	0.07
83	0.07
84	0.07
85	0.09
86	0.18
87	0.19
88	0.21
89	0.25
90	0.32
91	0.39
92	0.45
93	0.52
94	0.5
95	0.56
96	0.62
97	0.67
98	0.67
99	0.63
100	0.61
101	0.6
102	0.61
103	0.55
104	0.48
105	0.46
106	0.42
107	0.45
108	0.44
109	0.38
110	0.38
111	0.37
112	0.37
113	0.31
114	0.3
115	0.26
116	0.23
117	0.21
118	0.16
119	0.16
120	0.16
121	0.15
122	0.16
123	0.15
124	0.14
125	0.14
126	0.12
127	0.11
128	0.1
129	0.08
130	0.06
131	0.06
132	0.06
133	0.07
134	0.07
135	0.09
136	0.09
137	0.08
138	0.08
139	0.08
140	0.09
141	0.08
142	0.09
143	0.08
144	0.14
145	0.16
146	0.21
147	0.23
148	0.24
149	0.27
150	0.32
151	0.36
152	0.37
153	0.38
154	0.38
155	0.37
156	0.39
157	0.41
158	0.39
159	0.37
160	0.35
161	0.37
162	0.33
163	0.3
164	0.27
165	0.23
166	0.23
167	0.23
168	0.21
169	0.18
170	0.18
171	0.19
172	0.19
173	0.18
174	0.12
175	0.1
176	0.09
177	0.08
178	0.07
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.09
183	0.09
184	0.11
185	0.11
186	0.12
187	0.13
188	0.15
189	0.18
190	0.24
191	0.25
192	0.29
193	0.31
194	0.36
195	0.37
196	0.4
197	0.4
198	0.35
199	0.38
200	0.43
201	0.49
202	0.48
203	0.47
204	0.44
205	0.41
206	0.4
207	0.35
208	0.25
209	0.2
210	0.18
211	0.2
212	0.19
213	0.18
214	0.19
215	0.18
216	0.2
217	0.21
218	0.21
219	0.19
220	0.18
221	0.2
222	0.19
223	0.2
224	0.19
225	0.14
226	0.14
227	0.13
228	0.14
229	0.13
230	0.13
231	0.13
232	0.12
233	0.13
234	0.16
235	0.17
236	0.16
237	0.24
238	0.27
239	0.27
240	0.29
241	0.33
242	0.31
243	0.31
244	0.36
245	0.35
246	0.4
247	0.4
248	0.46
249	0.43
250	0.4
251	0.38
252	0.37
253	0.37
254	0.31
255	0.39
256	0.36
257	0.4
258	0.42
259	0.42
260	0.36
261	0.31
262	0.28
263	0.19
264	0.15
265	0.1
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.07
270	0.07
271	0.06
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.1
279	0.1
280	0.09
281	0.09
282	0.1
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.11
287	0.12
288	0.12
289	0.13
290	0.16
291	0.18
292	0.2
293	0.22
294	0.22
295	0.21
296	0.21
297	0.19
298	0.17
299	0.15
300	0.15
301	0.13
302	0.13
303	0.13
304	0.12
305	0.12
306	0.1
307	0.07
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.06
315	0.08
316	0.09
317	0.11
318	0.11
319	0.12
320	0.12
321	0.12
322	0.12
323	0.11
324	0.12
325	0.11
326	0.1
327	0.11
328	0.11
329	0.12
330	0.11
331	0.11
332	0.13
333	0.13
334	0.13
335	0.14
336	0.15
337	0.19
338	0.27
339	0.3
340	0.27
341	0.28
342	0.29
343	0.3
344	0.28
345	0.24
346	0.17
347	0.13
348	0.13
349	0.12
350	0.11
351	0.09
352	0.09
353	0.09
354	0.1
355	0.13
356	0.12
357	0.15
358	0.19
359	0.2
360	0.2
361	0.21
362	0.21
363	0.2
364	0.21
365	0.19
366	0.15
367	0.15
368	0.16
369	0.18
370	0.25
371	0.25
372	0.26
373	0.25
374	0.24
375	0.24
376	0.29
377	0.35
378	0.29
379	0.32
380	0.38
381	0.42
382	0.47
383	0.47
384	0.48
385	0.43
386	0.44
387	0.45
388	0.45
389	0.44
390	0.43
391	0.42
392	0.37
393	0.35
394	0.3
395	0.25
396	0.18
397	0.13
398	0.1
399	0.11
400	0.08
401	0.06
402	0.07
403	0.1
404	0.1
405	0.1
406	0.09
407	0.09
408	0.09
409	0.1
410	0.11
411	0.09
412	0.13
413	0.14
414	0.17
415	0.19
416	0.2
417	0.2
418	0.21
419	0.21
420	0.17
421	0.15
422	0.13
423	0.11
424	0.1
425	0.09
426	0.08
427	0.09
428	0.09
429	0.09
430	0.1
431	0.11
432	0.12
433	0.14
434	0.2
435	0.2
436	0.21
437	0.24
438	0.25
439	0.25
440	0.23
441	0.21
442	0.13
443	0.12
444	0.12
445	0.09
446	0.06
447	0.07
448	0.07
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.08
455	0.07
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.1
462	0.09
463	0.08
464	0.08
465	0.1
466	0.12
467	0.14
468	0.16
469	0.16
470	0.16
471	0.16
472	0.15
473	0.14
474	0.12
475	0.09
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.03
482	0.03
483	0.03
484	0.03
485	0.04
486	0.05
487	0.05
488	0.06
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.07
493	0.06
494	0.06
495	0.05
496	0.05
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.03
501	0.03
502	0.04
503	0.05
504	0.11
505	0.12
506	0.13
507	0.16
508	0.18
509	0.22
510	0.3
511	0.38
512	0.39
513	0.47
514	0.5
515	0.5
516	0.55
517	0.56
518	0.49
519	0.42
520	0.35
521	0.29
522	0.26
523	0.24
524	0.16
525	0.12
526	0.09
527	0.08
528	0.07
529	0.05
530	0.03
531	0.04
532	0.05
533	0.04
534	0.05
535	0.07
536	0.08
537	0.1
538	0.12
539	0.13
540	0.17
541	0.19
542	0.24
543	0.25
544	0.25
545	0.24
546	0.27
547	0.27
548	0.23
549	0.23
550	0.19
551	0.17
552	0.16
553	0.15
554	0.12
555	0.16
556	0.19
557	0.19
558	0.21
559	0.22
560	0.23
561	0.26
562	0.29
563	0.28
564	0.3
565	0.31
566	0.28
567	0.28
568	0.27
569	0.23
570	0.17
571	0.14
572	0.09
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.07
581	0.07
582	0.1
583	0.11
584	0.18
585	0.19
586	0.21
587	0.24
588	0.28
589	0.29
590	0.29
591	0.27
592	0.21
593	0.2
594	0.18
595	0.16
596	0.13
597	0.13
598	0.11
599	0.13
600	0.15
601	0.16
602	0.15
603	0.13
604	0.11
605	0.12
606	0.13
607	0.13
608	0.15
609	0.16
610	0.19
611	0.21
612	0.22
613	0.21
614	0.23
615	0.24
616	0.22
617	0.25
618	0.22
619	0.21
620	0.2
621	0.2
622	0.16
623	0.13
624	0.12
625	0.08
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.06
630	0.07
631	0.07
632	0.08
633	0.09
634	0.1
635	0.1
636	0.11
637	0.12
638	0.14
639	0.21
640	0.24
641	0.23
642	0.24
643	0.24
644	0.26
645	0.28
646	0.28
647	0.26
648	0.23
649	0.24
650	0.24
651	0.29
652	0.27
653	0.27
654	0.29
655	0.24
656	0.23
657	0.22
658	0.21
659	0.15
660	0.14
661	0.17
662	0.12
663	0.12
664	0.13
665	0.12
666	0.12
667	0.11
668	0.11
669	0.07
670	0.07
671	0.08
672	0.08
673	0.09
674	0.11
675	0.12
676	0.14
677	0.14
678	0.15
679	0.15
680	0.13
681	0.13
682	0.11
683	0.09
684	0.08
685	0.08
686	0.08
687	0.07
688	0.07
689	0.07
690	0.06
691	0.08
692	0.1
693	0.11
694	0.09
695	0.09
696	0.09
697	0.1
698	0.12
699	0.11
700	0.09
701	0.09
702	0.1
703	0.13
704	0.17
705	0.18
706	0.2
707	0.23
708	0.23
709	0.23
710	0.25
711	0.24
712	0.25
713	0.28
714	0.32
715	0.29
716	0.31
717	0.31
718	0.3
719	0.28
720	0.24
721	0.2
722	0.13
723	0.14
724	0.15
725	0.17
726	0.19
727	0.2
728	0.21
729	0.26
730	0.26
731	0.24
732	0.24
733	0.26
734	0.24
735	0.24
736	0.25
737	0.23
738	0.22
739	0.21
740	0.18
741	0.14
742	0.12
743	0.12
744	0.09
745	0.07
746	0.06
747	0.08
748	0.11
749	0.13
750	0.14
751	0.17
752	0.19
753	0.24
754	0.27
755	0.27
756	0.29
757	0.28
758	0.28
759	0.3
760	0.3
761	0.29
762	0.28
763	0.26
764	0.24
765	0.22
766	0.21
767	0.15
768	0.13
769	0.09
770	0.09
771	0.09
772	0.07
773	0.08
774	0.09
775	0.08
776	0.08
777	0.08
778	0.08
779	0.12
780	0.16
781	0.19
782	0.19
783	0.2
784	0.21
785	0.23
786	0.26
787	0.21
788	0.17
789	0.15
790	0.16
791	0.18
792	0.25
793	0.24
794	0.28
795	0.35
796	0.4
797	0.39
798	0.39
799	0.37
800	0.34
801	0.33
802	0.27
803	0.19
804	0.15
805	0.15
806	0.16
807	0.16
808	0.11
809	0.11
810	0.12
811	0.14
812	0.14
813	0.14
814	0.14
815	0.16
816	0.15
817	0.16
818	0.22
819	0.2
820	0.22
821	0.22
822	0.2
823	0.19
824	0.22
825	0.21
826	0.14
827	0.15
828	0.14
829	0.2
830	0.24
831	0.23
832	0.22
833	0.3
834	0.33
835	0.37
836	0.36
837	0.3
838	0.29
839	0.29
840	0.27
841	0.2
842	0.18
843	0.13
844	0.13
845	0.12
846	0.13
847	0.14
848	0.14
849	0.14
850	0.15
851	0.16
852	0.19
853	0.23
854	0.21
855	0.2
856	0.2
857	0.2
858	0.19
859	0.18
860	0.14
861	0.09
862	0.08
863	0.09
864	0.1
865	0.09
866	0.07
867	0.08
868	0.09
869	0.09
870	0.13
871	0.19
872	0.21
873	0.29
874	0.33
875	0.39
876	0.41
877	0.43
878	0.43
879	0.39
880	0.39
881	0.36
882	0.41
883	0.39
884	0.42
885	0.46
886	0.44
887	0.42
888	0.45
889	0.49
890	0.51
891	0.57
892	0.62
893	0.65
894	0.71
895	0.79
896	0.83
897	0.83
898	0.81
899	0.79
900	0.79
901	0.75
902	0.7
903	0.62
904	0.54
905	0.48
906	0.42
907	0.36
908	0.3
909	0.32
910	0.39
911	0.39
912	0.39
913	0.38
914	0.39
915	0.41
916	0.39
917	0.37
918	0.27
919	0.3
920	0.29
921	0.31
922	0.29
923	0.26
924	0.25
925	0.24
926	0.25
927	0.21
928	0.2
929	0.17
930	0.19
931	0.19
932	0.22
933	0.28
934	0.32
935	0.37
936	0.46
937	0.47
938	0.44
939	0.45
940	0.42
941	0.35
942	0.3
943	0.26
944	0.19
945	0.18
946	0.19
947	0.19
948	0.18
949	0.19
950	0.26
951	0.24
952	0.32
953	0.38
954	0.42
955	0.5
956	0.57
957	0.59
958	0.58
959	0.6
960	0.57
961	0.56
962	0.58
963	0.54
964	0.56
965	0.51
966	0.45
967	0.42
968	0.39
969	0.3
970	0.25
971	0.28
972	0.21
973	0.24
974	0.27
975	0.28
976	0.28
977	0.31
978	0.28
979	0.21
980	0.22
981	0.18
982	0.16
983	0.19
984	0.18
985	0.14
986	0.15
987	0.13
988	0.13
989	0.14
990	0.16
991	0.14
992	0.19
993	0.22
994	0.23
995	0.26
996	0.25
997	0.26
998	0.28
999	0.31
1000	0.34
1001	0.34
1002	0.33
1003	0.32
1004	0.34
1005	0.32
1006	0.26
1007	0.24
1008	0.16
1009	0.14

P12868

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer