Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12530

Protein Details
Accession Q12530    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
171-201ITSIPKPLTENCKKKKKRKKKNKSAIDGIFGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
183-193KKKKKRKKKNK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, cyto 4.5, mito 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047205  RMP1  
IPR047204  RMP1_RBD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000294  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, RNase MRP-dependent  
KEGG sce:YLR145W  -  
CDD cd22573  RMP1_RBD  
Amino Acid Sequences MDEMDNVIRSLEQEYRLILLLNHRNKNQHRAASWYGSFNEMKRNCGQIITLFSSRRLQAKRLKDVEWVKLHRLLQRALFRQLKRWYWQFNGVIALGQFVTLGCTLVTLLANVRALYMRLWEINETEFIRCGCLIKNLPRTKAKSVVNDVEELGEIIDEDIGNNVQENELVITSIPKPLTENCKKKKKRKKKNKSAIDGIFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.19
4 0.18
5 0.16
6 0.21
7 0.28
8 0.36
9 0.42
10 0.43
11 0.52
12 0.56
13 0.65
14 0.64
15 0.61
16 0.54
17 0.56
18 0.58
19 0.56
20 0.53
21 0.47
22 0.39
23 0.37
24 0.36
25 0.3
26 0.34
27 0.28
28 0.31
29 0.3
30 0.33
31 0.29
32 0.28
33 0.28
34 0.22
35 0.26
36 0.27
37 0.28
38 0.25
39 0.27
40 0.29
41 0.3
42 0.34
43 0.31
44 0.32
45 0.37
46 0.45
47 0.53
48 0.53
49 0.53
50 0.54
51 0.56
52 0.57
53 0.57
54 0.51
55 0.44
56 0.45
57 0.46
58 0.42
59 0.41
60 0.35
61 0.33
62 0.37
63 0.38
64 0.4
65 0.45
66 0.41
67 0.46
68 0.51
69 0.48
70 0.46
71 0.48
72 0.45
73 0.41
74 0.48
75 0.41
76 0.35
77 0.33
78 0.28
79 0.23
80 0.18
81 0.15
82 0.08
83 0.06
84 0.05
85 0.03
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.03
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.09
119 0.14
120 0.18
121 0.25
122 0.35
123 0.39
124 0.44
125 0.51
126 0.55
127 0.54
128 0.57
129 0.55
130 0.52
131 0.54
132 0.54
133 0.49
134 0.45
135 0.4
136 0.33
137 0.27
138 0.2
139 0.13
140 0.07
141 0.05
142 0.04
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.06
156 0.07
157 0.06
158 0.08
159 0.09
160 0.13
161 0.13
162 0.12
163 0.14
164 0.2
165 0.31
166 0.39
167 0.49
168 0.55
169 0.67
170 0.77
171 0.85
172 0.91
173 0.92
174 0.93
175 0.94
176 0.96
177 0.96
178 0.97
179 0.97
180 0.95
181 0.94