Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q08816

Protein Details
Accession Q08816    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-78IDNVIWQRNCNKKRRYHTPEFNDVYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031349  Tfb6  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG sce:YOR352W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17110  TFB6  
Amino Acid Sequences MSEPNTPLHAQPNEQLDLNNLNDLDEKDIDDLNLDPNSDVEISADSGDVVNSNIDNVIWQRNCNKKRRYHTPEFNDVYNETNNTINDVTMLDDVDDFQPRINVSSPFSSATKLSELLPNDHNGTSHPRRLSMSQQSKFISYVDDQLLQIQRKFVQSRGLNIKNGYASLTPLLQDLKTLVDFVWYSIAHVPNSDYLLQSEEKRHCPDSRNPKDTCGYSSYFGQGSYLIKIADDLIDYVEKFTFKNMEDSEINDTLSKLFKLFFILDRIFVILTDDNDNCKEVPKTSSASKNIAGLNGTDIVRLKGIAERTRVRLPIFLESQGIHGYHYELSKIYEGFLDHANSF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.28
4 0.3
5 0.28
6 0.26
7 0.2
8 0.19
9 0.2
10 0.21
11 0.22
12 0.17
13 0.17
14 0.16
15 0.17
16 0.16
17 0.15
18 0.15
19 0.14
20 0.14
21 0.14
22 0.12
23 0.11
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.1
31 0.1
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.09
44 0.17
45 0.17
46 0.21
47 0.29
48 0.39
49 0.48
50 0.56
51 0.63
52 0.64
53 0.73
54 0.81
55 0.83
56 0.84
57 0.86
58 0.84
59 0.86
60 0.79
61 0.71
62 0.62
63 0.53
64 0.45
65 0.37
66 0.29
67 0.2
68 0.2
69 0.18
70 0.18
71 0.17
72 0.14
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.09
77 0.09
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.09
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.15
91 0.17
92 0.18
93 0.19
94 0.19
95 0.19
96 0.17
97 0.17
98 0.16
99 0.14
100 0.14
101 0.16
102 0.17
103 0.19
104 0.2
105 0.2
106 0.21
107 0.2
108 0.19
109 0.17
110 0.24
111 0.25
112 0.29
113 0.28
114 0.27
115 0.29
116 0.32
117 0.38
118 0.4
119 0.45
120 0.42
121 0.46
122 0.45
123 0.44
124 0.42
125 0.35
126 0.26
127 0.17
128 0.19
129 0.15
130 0.15
131 0.14
132 0.17
133 0.21
134 0.2
135 0.19
136 0.17
137 0.17
138 0.21
139 0.22
140 0.2
141 0.24
142 0.24
143 0.3
144 0.38
145 0.4
146 0.37
147 0.36
148 0.36
149 0.28
150 0.27
151 0.22
152 0.13
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.12
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.11
178 0.13
179 0.12
180 0.09
181 0.08
182 0.11
183 0.12
184 0.13
185 0.18
186 0.2
187 0.24
188 0.27
189 0.3
190 0.31
191 0.35
192 0.43
193 0.48
194 0.54
195 0.57
196 0.55
197 0.56
198 0.56
199 0.52
200 0.46
201 0.39
202 0.31
203 0.26
204 0.26
205 0.24
206 0.2
207 0.19
208 0.16
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.1
228 0.12
229 0.12
230 0.18
231 0.18
232 0.22
233 0.22
234 0.25
235 0.29
236 0.26
237 0.26
238 0.2
239 0.19
240 0.16
241 0.17
242 0.15
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.12
247 0.14
248 0.15
249 0.2
250 0.2
251 0.2
252 0.2
253 0.21
254 0.17
255 0.15
256 0.16
257 0.11
258 0.12
259 0.15
260 0.15
261 0.17
262 0.18
263 0.19
264 0.16
265 0.18
266 0.18
267 0.17
268 0.2
269 0.21
270 0.24
271 0.3
272 0.39
273 0.4
274 0.42
275 0.41
276 0.43
277 0.4
278 0.37
279 0.31
280 0.23
281 0.21
282 0.21
283 0.19
284 0.16
285 0.16
286 0.15
287 0.15
288 0.14
289 0.13
290 0.13
291 0.2
292 0.24
293 0.3
294 0.34
295 0.4
296 0.45
297 0.48
298 0.45
299 0.42
300 0.4
301 0.41
302 0.39
303 0.35
304 0.31
305 0.28
306 0.29
307 0.27
308 0.25
309 0.17
310 0.15
311 0.15
312 0.16
313 0.16
314 0.15
315 0.14
316 0.16
317 0.19
318 0.19
319 0.18
320 0.17
321 0.17
322 0.18
323 0.21