Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q04226

Protein Details
Accession Q04226    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-80NQLNKYPKYKYQKTRINQQDPDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YML015C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MTEPQGPLDTIPKVNYPPILTIANYFSTKQMIDQVISEDQDYVTWKLQNLRTGGTSINNQLNKYPKYKYQKTRINQQDPDSINKVPENLIFPQDILQQQTQNSNYEDTNTNEDENEKLAQDEQFKLLVTNLDKDQTNRFEVFHRTSLNKTQVKKLASTVANQTISENIRVFLQAVGKIYAGEIIELAMIVKNKWLTSQMCIEFDKRTKIGYKLKKYLKKLTFSIIENQQYKQDYQSDSVPEDEPDFYFDDEEVDKRETTLGNSLLQSKSLQQSDHNSQDLKLQLIEQYNKLVLQFNKLDVSIEKYNNSPLLPEHIREAWRLYRLQSDTLPNAYWRTQGEGQGSMFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.29
4 0.28
5 0.29
6 0.29
7 0.26
8 0.26
9 0.26
10 0.26
11 0.25
12 0.24
13 0.21
14 0.21
15 0.21
16 0.2
17 0.23
18 0.21
19 0.21
20 0.21
21 0.24
22 0.24
23 0.24
24 0.23
25 0.17
26 0.15
27 0.15
28 0.17
29 0.16
30 0.17
31 0.18
32 0.2
33 0.26
34 0.3
35 0.35
36 0.33
37 0.33
38 0.31
39 0.31
40 0.3
41 0.26
42 0.26
43 0.25
44 0.31
45 0.31
46 0.3
47 0.33
48 0.39
49 0.4
50 0.42
51 0.41
52 0.43
53 0.51
54 0.6
55 0.66
56 0.68
57 0.74
58 0.75
59 0.82
60 0.83
61 0.83
62 0.78
63 0.73
64 0.71
65 0.63
66 0.64
67 0.56
68 0.46
69 0.39
70 0.34
71 0.3
72 0.23
73 0.23
74 0.2
75 0.18
76 0.2
77 0.18
78 0.17
79 0.18
80 0.2
81 0.19
82 0.19
83 0.19
84 0.19
85 0.2
86 0.25
87 0.25
88 0.24
89 0.24
90 0.22
91 0.21
92 0.21
93 0.23
94 0.2
95 0.23
96 0.22
97 0.21
98 0.19
99 0.2
100 0.17
101 0.16
102 0.15
103 0.1
104 0.09
105 0.1
106 0.12
107 0.14
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.13
114 0.14
115 0.13
116 0.14
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.17
121 0.22
122 0.21
123 0.24
124 0.22
125 0.22
126 0.22
127 0.27
128 0.29
129 0.27
130 0.27
131 0.26
132 0.28
133 0.33
134 0.39
135 0.39
136 0.37
137 0.4
138 0.43
139 0.43
140 0.41
141 0.36
142 0.35
143 0.31
144 0.31
145 0.28
146 0.28
147 0.27
148 0.26
149 0.24
150 0.2
151 0.19
152 0.19
153 0.15
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.09
167 0.07
168 0.06
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.11
182 0.11
183 0.14
184 0.2
185 0.21
186 0.22
187 0.24
188 0.25
189 0.24
190 0.26
191 0.27
192 0.21
193 0.22
194 0.22
195 0.28
196 0.36
197 0.42
198 0.49
199 0.54
200 0.63
201 0.68
202 0.72
203 0.75
204 0.72
205 0.67
206 0.61
207 0.57
208 0.53
209 0.47
210 0.47
211 0.43
212 0.44
213 0.4
214 0.39
215 0.37
216 0.34
217 0.32
218 0.29
219 0.27
220 0.22
221 0.23
222 0.26
223 0.24
224 0.23
225 0.25
226 0.23
227 0.19
228 0.18
229 0.17
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.15
244 0.13
245 0.14
246 0.19
247 0.17
248 0.18
249 0.19
250 0.23
251 0.21
252 0.22
253 0.2
254 0.19
255 0.23
256 0.22
257 0.22
258 0.22
259 0.29
260 0.36
261 0.4
262 0.4
263 0.35
264 0.33
265 0.38
266 0.36
267 0.3
268 0.23
269 0.18
270 0.19
271 0.25
272 0.27
273 0.24
274 0.25
275 0.24
276 0.24
277 0.24
278 0.26
279 0.21
280 0.25
281 0.26
282 0.25
283 0.27
284 0.26
285 0.27
286 0.22
287 0.28
288 0.28
289 0.28
290 0.27
291 0.27
292 0.3
293 0.31
294 0.3
295 0.24
296 0.19
297 0.25
298 0.26
299 0.26
300 0.27
301 0.29
302 0.31
303 0.31
304 0.35
305 0.32
306 0.34
307 0.35
308 0.33
309 0.37
310 0.38
311 0.4
312 0.4
313 0.41
314 0.4
315 0.42
316 0.41
317 0.34
318 0.36
319 0.33
320 0.32
321 0.26
322 0.3
323 0.3
324 0.34
325 0.35
326 0.35