FuNGI

P29056

Protein Details

Accession

P29056

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
283-307	GEARPPSFVKNRKKERKIKDSLDKE	Basic
509-536	IATGNTSVKKKRTRRRNNTRSDEPTKTV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
292-299	KNRKKERK
517-524	KKKRTRRR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, mito_nucl 10.5, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011665 BRF1_TBP-bd_dom IPR013763 Cyclin-like_dom IPR036915 Cyclin-like_sf IPR000812 TFIIB IPR023486 TFIIB_CS IPR013150 TFIIB_cyclin IPR013137 Znf_TFIIB
Gene Ontology	GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0000126 C:transcription factor TFIIIB complex GO:0097550 C:transcription preinitiation complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:0000994 F:RNA polymerase III core binding GO:0000995 F:RNA polymerase III general transcription initiation factor activity GO:0001006 F:RNA polymerase III type 3 promoter sequence-specific DNA binding GO:0017025 F:TBP-class protein binding GO:0001156 F:TFIIIC-class transcription factor complex binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation GO:0001112 P:DNA-templated transcription open complex formation GO:0006359 P:regulation of transcription by RNA polymerase III GO:0070898 P:RNA polymerase III preinitiation complex assembly GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	sce:YGR246C -
Pfam	View protein in Pfam PF07741 BRF1 PF08271 TF_Zn_Ribbon PF00382 TFIIB
PROSITE	View protein in PROSITE PS00782 TFIIB PS51134 ZF_TFIIB
CDD	cd20553 CYCLIN_TFIIIB90_rpt1 cd20554 CYCLIN_TFIIIB90_rpt2

Amino Acid Sequences

MPVCKNCHGTEFERDLSNANNDLVCKACGVVSEDNPIVSEVTFGETSAGAAVVQGSFIGAGQSHAAFGGSSALESREATLNNARRKLRAVSYALHIPEYITDAAFQWYKLALANNFVQGRRSQNVIASCLYVACRKEKTHHMLIDFSSRLQVSVYSIGATFLKMVKKLHITELPLADPSLFIQHFAEKLDLADKKIKVVKDAVKLAQRMSKDWMFEGRRPAGIAGACILLACRMNNLRRTHTEIVAVSHVAEETLQQRLNEFKNTKAAKLSVQKFRENDVEDGEARPPSFVKNRKKERKIKDSLDKEEMFQTSEEALNKNPILTQVLGEQELSSKEVLFYLKQFSERRARVVERIKATNGIDGENIYHEGSENETRKRKLSEVSIQNEHVEGEDKETEGTEEKVKKVKTKTSEEKKENESGHFQDAIDGYSLETDPYCPRNLHLLPTTDTYLSKVSDDPDNLEDVDDEELNAHLLNEEASKLKERIWIGLNADFLLEQESKRLKQEADIATGNTSVKKKRTRRRNNTRSDEPTKTVDAAAAIGLMSDLQDKSGLHAALKAAEESGDFTTADSVKNMLQKASFSKKINYDAIDGLFR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.39
3	0.37
4	0.36
5	0.29
6	0.24
7	0.23
8	0.21
9	0.22
10	0.23
11	0.19
12	0.15
13	0.14
14	0.13
15	0.13
16	0.18
17	0.21
18	0.21
19	0.26
20	0.26
21	0.26
22	0.26
23	0.25
24	0.2
25	0.15
26	0.14
27	0.08
28	0.12
29	0.12
30	0.11
31	0.11
32	0.11
33	0.11
34	0.1
35	0.1
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.05
40	0.05
41	0.05
42	0.04
43	0.04
44	0.04
45	0.05
46	0.04
47	0.05
48	0.07
49	0.07
50	0.07
51	0.07
52	0.07
53	0.07
54	0.07
55	0.09
56	0.07
57	0.07
58	0.08
59	0.09
60	0.1
61	0.1
62	0.12
63	0.14
64	0.14
65	0.18
66	0.26
67	0.33
68	0.39
69	0.47
70	0.46
71	0.45
72	0.48
73	0.51
74	0.48
75	0.48
76	0.44
77	0.4
78	0.43
79	0.47
80	0.44
81	0.39
82	0.32
83	0.25
84	0.21
85	0.21
86	0.17
87	0.11
88	0.1
89	0.11
90	0.14
91	0.14
92	0.13
93	0.11
94	0.11
95	0.11
96	0.12
97	0.16
98	0.13
99	0.17
100	0.19
101	0.24
102	0.26
103	0.26
104	0.26
105	0.24
106	0.29
107	0.28
108	0.29
109	0.24
110	0.26
111	0.29
112	0.3
113	0.28
114	0.23
115	0.21
116	0.19
117	0.19
118	0.18
119	0.17
120	0.19
121	0.23
122	0.24
123	0.3
124	0.38
125	0.44
126	0.49
127	0.51
128	0.49
129	0.48
130	0.47
131	0.48
132	0.39
133	0.32
134	0.26
135	0.22
136	0.19
137	0.16
138	0.15
139	0.11
140	0.13
141	0.12
142	0.1
143	0.1
144	0.11
145	0.11
146	0.11
147	0.09
148	0.1
149	0.12
150	0.14
151	0.15
152	0.18
153	0.23
154	0.25
155	0.29
156	0.3
157	0.31
158	0.33
159	0.34
160	0.31
161	0.26
162	0.25
163	0.19
164	0.15
165	0.12
166	0.13
167	0.11
168	0.1
169	0.11
170	0.12
171	0.13
172	0.14
173	0.14
174	0.09
175	0.1
176	0.15
177	0.15
178	0.16
179	0.22
180	0.21
181	0.25
182	0.29
183	0.29
184	0.26
185	0.32
186	0.35
187	0.36
188	0.4
189	0.4
190	0.41
191	0.42
192	0.41
193	0.38
194	0.32
195	0.27
196	0.28
197	0.26
198	0.22
199	0.22
200	0.29
201	0.29
202	0.31
203	0.36
204	0.32
205	0.3
206	0.3
207	0.29
208	0.23
209	0.2
210	0.17
211	0.11
212	0.09
213	0.08
214	0.07
215	0.07
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.07
220	0.11
221	0.15
222	0.22
223	0.26
224	0.29
225	0.32
226	0.4
227	0.41
228	0.38
229	0.37
230	0.31
231	0.29
232	0.26
233	0.22
234	0.14
235	0.11
236	0.1
237	0.07
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.08
242	0.09
243	0.09
244	0.1
245	0.14
246	0.16
247	0.22
248	0.22
249	0.21
250	0.29
251	0.3
252	0.31
253	0.29
254	0.28
255	0.27
256	0.34
257	0.39
258	0.39
259	0.42
260	0.45
261	0.44
262	0.45
263	0.45
264	0.38
265	0.33
266	0.26
267	0.24
268	0.21
269	0.21
270	0.19
271	0.14
272	0.12
273	0.11
274	0.09
275	0.1
276	0.17
277	0.25
278	0.34
279	0.44
280	0.55
281	0.65
282	0.75
283	0.82
284	0.84
285	0.86
286	0.84
287	0.82
288	0.82
289	0.78
290	0.74
291	0.71
292	0.61
293	0.51
294	0.46
295	0.38
296	0.29
297	0.21
298	0.17
299	0.11
300	0.12
301	0.12
302	0.1
303	0.1
304	0.12
305	0.12
306	0.11
307	0.1
308	0.09
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.09
313	0.1
314	0.11
315	0.1
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.07
321	0.06
322	0.06
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.11
328	0.12
329	0.17
330	0.18
331	0.21
332	0.3
333	0.31
334	0.33
335	0.34
336	0.35
337	0.38
338	0.45
339	0.46
340	0.41
341	0.43
342	0.4
343	0.38
344	0.37
345	0.32
346	0.25
347	0.19
348	0.15
349	0.13
350	0.13
351	0.1
352	0.11
353	0.08
354	0.07
355	0.06
356	0.07
357	0.09
358	0.15
359	0.18
360	0.23
361	0.29
362	0.3
363	0.33
364	0.35
365	0.35
366	0.33
367	0.37
368	0.4
369	0.43
370	0.48
371	0.48
372	0.47
373	0.45
374	0.4
375	0.33
376	0.24
377	0.18
378	0.12
379	0.12
380	0.12
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.12
385	0.1
386	0.12
387	0.15
388	0.17
389	0.19
390	0.25
391	0.27
392	0.33
393	0.37
394	0.43
395	0.45
396	0.53
397	0.61
398	0.66
399	0.75
400	0.74
401	0.74
402	0.71
403	0.7
404	0.62
405	0.55
406	0.49
407	0.42
408	0.4
409	0.35
410	0.3
411	0.25
412	0.23
413	0.21
414	0.16
415	0.13
416	0.09
417	0.09
418	0.1
419	0.07
420	0.07
421	0.08
422	0.11
423	0.13
424	0.16
425	0.15
426	0.16
427	0.24
428	0.25
429	0.29
430	0.3
431	0.31
432	0.31
433	0.34
434	0.35
435	0.27
436	0.26
437	0.23
438	0.2
439	0.18
440	0.16
441	0.15
442	0.15
443	0.18
444	0.19
445	0.2
446	0.19
447	0.2
448	0.19
449	0.18
450	0.16
451	0.12
452	0.13
453	0.1
454	0.09
455	0.08
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.06
460	0.04
461	0.05
462	0.05
463	0.06
464	0.07
465	0.08
466	0.1
467	0.14
468	0.15
469	0.16
470	0.21
471	0.22
472	0.25
473	0.27
474	0.3
475	0.29
476	0.31
477	0.3
478	0.25
479	0.24
480	0.19
481	0.15
482	0.15
483	0.13
484	0.1
485	0.16
486	0.21
487	0.22
488	0.25
489	0.29
490	0.25
491	0.28
492	0.37
493	0.35
494	0.36
495	0.36
496	0.34
497	0.31
498	0.33
499	0.3
500	0.25
501	0.26
502	0.26
503	0.32
504	0.42
505	0.51
506	0.6
507	0.71
508	0.77
509	0.84
510	0.9
511	0.93
512	0.94
513	0.93
514	0.93
515	0.91
516	0.88
517	0.83
518	0.75
519	0.69
520	0.6
521	0.52
522	0.42
523	0.33
524	0.26
525	0.19
526	0.15
527	0.11
528	0.08
529	0.06
530	0.06
531	0.05
532	0.05
533	0.06
534	0.06
535	0.07
536	0.09
537	0.09
538	0.12
539	0.18
540	0.19
541	0.17
542	0.19
543	0.2
544	0.22
545	0.23
546	0.2
547	0.14
548	0.14
549	0.14
550	0.14
551	0.14
552	0.12
553	0.11
554	0.11
555	0.15
556	0.16
557	0.16
558	0.14
559	0.15
560	0.17
561	0.22
562	0.23
563	0.21
564	0.22
565	0.25
566	0.32
567	0.4
568	0.44
569	0.43
570	0.49
571	0.53
572	0.59
573	0.61
574	0.55
575	0.5
576	0.46

P29056

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer