FuNGI

Q12420

Protein Details

Accession

Q12420

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
190-214	DREKLRLRQMNKDRRQKKKILNVSS	Hydrophilic
272-298	GGDFKPLKIKKRKIKDPRSTKARKSKI	Basic
544-579	AYKKLSQKFHGTKSNKKKRAKMKSRIEARKNTPENG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
203-207	RRQKK
277-297	PLKIKKRKIKDPRSTKARKSK
549-573	SQKFHGTKSNKKKRAKMKSRIEARK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 15

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000481 P:maturation of 5S rRNA GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	sce:YOR308C -
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MNKTENLSIEETNEIREKLGMKPIPVFQEKNTDHKESLSIEETNELRASLGLKLIPPQQNFNSSPPNVHNTSKIDELREKITKFQKKANAPLRMAHLLEETNVNDDSSWLENMDAIPSSHESKRSSTLPRKGATKEDENIDLHNVQVSYNIEALSPKKDTILTLKESSIFDDTDSTEVLENVKAAEENADREKLRLRQMNKDRRQKKKILNVSSLDIEEEEEGEKHSITTTHLIIGAEQGVMKAPNTISAKPPTGKVKVNFDSANNMSDEDGGDFKPLKIKKRKIKDPRSTKARKSKITDKMEIVKLVDEDESLSWMEEEQPVTIINPRTSSNNELKGPEDLAREIEKARDEEKRRTESILKMREISNSIVVDEKVTFLNTLDTSLSERSATENKVKVHGEGEKNIGDVTNGHTKEGSGNNTLTEAVNNEPNYEGDAENAPNFFSGLASTLGYLRKKSVFTTGDVDLKPGKDVNNSESLRRDVRNKEHTGTGTYTKDKLHGLEQFTSSDSSNANTHSKRQDHYDPDIKLVYRDEKGNRLTTKEAYKKLSQKFHGTKSNKKKRAKMKSRIEARKNTPENGSLFEFDDN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.21
3	0.23
4	0.23
5	0.22
6	0.32
7	0.31
8	0.3
9	0.34
10	0.38
11	0.44
12	0.48
13	0.46
14	0.39
15	0.47
16	0.47
17	0.52
18	0.53
19	0.5
20	0.45
21	0.44
22	0.46
23	0.37
24	0.39
25	0.34
26	0.29
27	0.25
28	0.29
29	0.28
30	0.26
31	0.24
32	0.19
33	0.15
34	0.15
35	0.16
36	0.12
37	0.14
38	0.12
39	0.13
40	0.17
41	0.25
42	0.31
43	0.31
44	0.37
45	0.38
46	0.44
47	0.47
48	0.48
49	0.49
50	0.43
51	0.46
52	0.43
53	0.46
54	0.43
55	0.42
56	0.42
57	0.38
58	0.4
59	0.43
60	0.41
61	0.4
62	0.41
63	0.42
64	0.44
65	0.47
66	0.44
67	0.45
68	0.53
69	0.56
70	0.55
71	0.6
72	0.62
73	0.63
74	0.72
75	0.74
76	0.73
77	0.66
78	0.66
79	0.64
80	0.59
81	0.51
82	0.42
83	0.34
84	0.25
85	0.24
86	0.23
87	0.17
88	0.15
89	0.15
90	0.14
91	0.12
92	0.12
93	0.13
94	0.12
95	0.12
96	0.1
97	0.1
98	0.1
99	0.11
100	0.12
101	0.1
102	0.08
103	0.1
104	0.12
105	0.16
106	0.18
107	0.22
108	0.23
109	0.25
110	0.3
111	0.34
112	0.42
113	0.47
114	0.54
115	0.56
116	0.58
117	0.6
118	0.58
119	0.6
120	0.56
121	0.53
122	0.48
123	0.44
124	0.44
125	0.39
126	0.37
127	0.33
128	0.27
129	0.2
130	0.19
131	0.16
132	0.12
133	0.14
134	0.14
135	0.13
136	0.13
137	0.13
138	0.11
139	0.13
140	0.15
141	0.15
142	0.16
143	0.14
144	0.15
145	0.15
146	0.16
147	0.21
148	0.25
149	0.26
150	0.27
151	0.28
152	0.29
153	0.29
154	0.3
155	0.25
156	0.19
157	0.15
158	0.14
159	0.14
160	0.12
161	0.12
162	0.11
163	0.09
164	0.09
165	0.1
166	0.08
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.06
171	0.06
172	0.09
173	0.09
174	0.12
175	0.15
176	0.18
177	0.18
178	0.19
179	0.24
180	0.25
181	0.32
182	0.35
183	0.36
184	0.44
185	0.54
186	0.65
187	0.69
188	0.75
189	0.77
190	0.81
191	0.86
192	0.84
193	0.83
194	0.82
195	0.82
196	0.79
197	0.77
198	0.69
199	0.63
200	0.56
201	0.46
202	0.36
203	0.26
204	0.19
205	0.12
206	0.1
207	0.08
208	0.06
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.06
213	0.07
214	0.07
215	0.08
216	0.1
217	0.1
218	0.1
219	0.12
220	0.12
221	0.11
222	0.11
223	0.1
224	0.07
225	0.07
226	0.06
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.06
231	0.05
232	0.12
233	0.14
234	0.15
235	0.18
236	0.22
237	0.25
238	0.24
239	0.28
240	0.27
241	0.29
242	0.34
243	0.33
244	0.38
245	0.37
246	0.4
247	0.38
248	0.33
249	0.34
250	0.3
251	0.29
252	0.2
253	0.18
254	0.14
255	0.13
256	0.13
257	0.08
258	0.08
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.13
264	0.16
265	0.24
266	0.33
267	0.42
268	0.5
269	0.6
270	0.7
271	0.75
272	0.84
273	0.85
274	0.86
275	0.87
276	0.88
277	0.85
278	0.84
279	0.83
280	0.8
281	0.76
282	0.72
283	0.72
284	0.72
285	0.71
286	0.66
287	0.59
288	0.57
289	0.52
290	0.46
291	0.37
292	0.27
293	0.21
294	0.18
295	0.14
296	0.08
297	0.07
298	0.06
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.07
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.11
312	0.12
313	0.11
314	0.12
315	0.13
316	0.15
317	0.18
318	0.23
319	0.24
320	0.28
321	0.29
322	0.28
323	0.28
324	0.27
325	0.26
326	0.23
327	0.19
328	0.14
329	0.15
330	0.15
331	0.15
332	0.14
333	0.15
334	0.14
335	0.14
336	0.17
337	0.23
338	0.26
339	0.33
340	0.4
341	0.44
342	0.43
343	0.45
344	0.47
345	0.47
346	0.52
347	0.51
348	0.45
349	0.42
350	0.41
351	0.4
352	0.37
353	0.31
354	0.25
355	0.18
356	0.17
357	0.17
358	0.16
359	0.15
360	0.12
361	0.12
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.1
367	0.09
368	0.1
369	0.09
370	0.09
371	0.11
372	0.11
373	0.12
374	0.09
375	0.1
376	0.12
377	0.16
378	0.18
379	0.22
380	0.26
381	0.27
382	0.32
383	0.32
384	0.3
385	0.29
386	0.33
387	0.31
388	0.29
389	0.31
390	0.26
391	0.26
392	0.25
393	0.21
394	0.14
395	0.11
396	0.13
397	0.18
398	0.18
399	0.18
400	0.18
401	0.18
402	0.23
403	0.26
404	0.25
405	0.2
406	0.2
407	0.2
408	0.21
409	0.21
410	0.17
411	0.13
412	0.12
413	0.1
414	0.15
415	0.15
416	0.15
417	0.14
418	0.14
419	0.16
420	0.16
421	0.14
422	0.11
423	0.13
424	0.13
425	0.13
426	0.13
427	0.12
428	0.1
429	0.1
430	0.08
431	0.06
432	0.05
433	0.06
434	0.07
435	0.07
436	0.08
437	0.1
438	0.15
439	0.16
440	0.17
441	0.18
442	0.21
443	0.22
444	0.23
445	0.29
446	0.27
447	0.28
448	0.32
449	0.32
450	0.35
451	0.34
452	0.34
453	0.28
454	0.27
455	0.25
456	0.23
457	0.21
458	0.2
459	0.23
460	0.25
461	0.32
462	0.33
463	0.34
464	0.36
465	0.38
466	0.38
467	0.38
468	0.42
469	0.41
470	0.49
471	0.56
472	0.57
473	0.56
474	0.57
475	0.56
476	0.53
477	0.48
478	0.45
479	0.4
480	0.38
481	0.38
482	0.33
483	0.34
484	0.31
485	0.29
486	0.29
487	0.3
488	0.32
489	0.33
490	0.34
491	0.32
492	0.32
493	0.31
494	0.26
495	0.21
496	0.17
497	0.15
498	0.16
499	0.18
500	0.24
501	0.24
502	0.31
503	0.38
504	0.43
505	0.43
506	0.48
507	0.54
508	0.53
509	0.61
510	0.62
511	0.55
512	0.54
513	0.56
514	0.49
515	0.42
516	0.4
517	0.36
518	0.31
519	0.36
520	0.37
521	0.4
522	0.44
523	0.5
524	0.49
525	0.47
526	0.49
527	0.48
528	0.54
529	0.55
530	0.57
531	0.55
532	0.61
533	0.66
534	0.7
535	0.74
536	0.69
537	0.71
538	0.73
539	0.76
540	0.78
541	0.76
542	0.78
543	0.8
544	0.85
545	0.84
546	0.85
547	0.86
548	0.86
549	0.9
550	0.91
551	0.9
552	0.9
553	0.91
554	0.93
555	0.94
556	0.92
557	0.91
558	0.89
559	0.89
560	0.83
561	0.77
562	0.7
563	0.65
564	0.58
565	0.52
566	0.47
567	0.38

Q12420

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer