Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12034

Protein Details
Accession Q12034    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-126KDTNSKSGKNSKNSKTNKKMKKRGKYNNDINKKDFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-116SGKNSKNSKTNKKMKKRGK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0010494  C:cytoplasmic stress granule  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005844  C:polysome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006878  P:intracellular copper ion homeostasis  
GO:0045727  P:positive regulation of translation  
GO:0006417  P:regulation of translation  
KEGG sce:YDR515W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSSQNLNDNPKNTSSAAEDKKKQTSSLKLAPIPTTSPWKSSSPDSNTVIPVEELRDISKTAKPSKNGSGSIKLTSNTKWTPITPSVIISGSKDTNSKSGKNSKNSKTNKKMKKRGKYNNDINKKDFNGQTNSTSEISNVSNLESKPLDANAKVNIHSSSGATANGNIKRITNNNNSTNGRQSRNYQNRNGKTRYNNNSRHSQAANNAISFPNNYQARPEYIPNASHWLNNNSRNSYKQLSYFRQQQYYNNINYQQQLQTPYYYSMEPIFKSIESIKNQIEFYFSEENLKTDEFLRSKFKKANDGFIPMSLIGKFYRMVNLSLGGDPNLILASMREVLQHKETNHLEIALGSIEGAQKNMADDFNPLENYFIRRENWAEYAMESNFDENDDETEKYNIEKLLGPNDLDNYSYMGYPNFFPSNENGKKSQSYDQGEISRQFEQNLQIND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.37
3 0.44
4 0.49
5 0.54
6 0.57
7 0.65
8 0.64
9 0.63
10 0.61
11 0.62
12 0.62
13 0.63
14 0.64
15 0.6
16 0.62
17 0.59
18 0.54
19 0.47
20 0.42
21 0.43
22 0.36
23 0.35
24 0.35
25 0.36
26 0.37
27 0.4
28 0.46
29 0.44
30 0.5
31 0.5
32 0.5
33 0.48
34 0.46
35 0.41
36 0.31
37 0.25
38 0.2
39 0.18
40 0.16
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.19
45 0.21
46 0.26
47 0.34
48 0.39
49 0.42
50 0.47
51 0.55
52 0.59
53 0.61
54 0.59
55 0.58
56 0.54
57 0.53
58 0.5
59 0.42
60 0.37
61 0.34
62 0.35
63 0.29
64 0.3
65 0.28
66 0.27
67 0.33
68 0.34
69 0.36
70 0.3
71 0.29
72 0.28
73 0.27
74 0.26
75 0.21
76 0.21
77 0.18
78 0.19
79 0.19
80 0.19
81 0.25
82 0.29
83 0.31
84 0.34
85 0.43
86 0.5
87 0.58
88 0.66
89 0.67
90 0.73
91 0.79
92 0.83
93 0.83
94 0.86
95 0.87
96 0.88
97 0.9
98 0.9
99 0.92
100 0.92
101 0.92
102 0.92
103 0.92
104 0.92
105 0.92
106 0.92
107 0.86
108 0.79
109 0.74
110 0.66
111 0.62
112 0.55
113 0.49
114 0.45
115 0.42
116 0.41
117 0.36
118 0.37
119 0.31
120 0.28
121 0.22
122 0.19
123 0.17
124 0.15
125 0.14
126 0.12
127 0.15
128 0.15
129 0.18
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.18
135 0.14
136 0.16
137 0.18
138 0.2
139 0.19
140 0.2
141 0.19
142 0.17
143 0.17
144 0.16
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.16
151 0.17
152 0.19
153 0.18
154 0.18
155 0.2
156 0.23
157 0.29
158 0.32
159 0.37
160 0.39
161 0.46
162 0.47
163 0.47
164 0.51
165 0.49
166 0.43
167 0.39
168 0.4
169 0.44
170 0.52
171 0.56
172 0.56
173 0.62
174 0.66
175 0.72
176 0.7
177 0.66
178 0.63
179 0.67
180 0.68
181 0.68
182 0.69
183 0.65
184 0.69
185 0.64
186 0.6
187 0.52
188 0.44
189 0.38
190 0.38
191 0.35
192 0.27
193 0.27
194 0.22
195 0.21
196 0.2
197 0.17
198 0.16
199 0.15
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.2
204 0.21
205 0.22
206 0.17
207 0.18
208 0.19
209 0.18
210 0.21
211 0.18
212 0.19
213 0.2
214 0.22
215 0.25
216 0.3
217 0.32
218 0.31
219 0.32
220 0.32
221 0.34
222 0.32
223 0.29
224 0.29
225 0.33
226 0.34
227 0.38
228 0.45
229 0.45
230 0.47
231 0.46
232 0.44
233 0.45
234 0.47
235 0.44
236 0.37
237 0.36
238 0.32
239 0.32
240 0.31
241 0.24
242 0.2
243 0.22
244 0.2
245 0.19
246 0.18
247 0.19
248 0.18
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.16
253 0.15
254 0.15
255 0.14
256 0.13
257 0.14
258 0.17
259 0.2
260 0.21
261 0.24
262 0.24
263 0.26
264 0.27
265 0.25
266 0.24
267 0.18
268 0.2
269 0.2
270 0.19
271 0.2
272 0.2
273 0.21
274 0.2
275 0.2
276 0.15
277 0.13
278 0.19
279 0.16
280 0.18
281 0.27
282 0.28
283 0.33
284 0.38
285 0.39
286 0.43
287 0.44
288 0.5
289 0.44
290 0.47
291 0.43
292 0.38
293 0.37
294 0.27
295 0.26
296 0.17
297 0.15
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.13
303 0.14
304 0.15
305 0.14
306 0.16
307 0.17
308 0.17
309 0.17
310 0.13
311 0.12
312 0.1
313 0.1
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.04
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.1
322 0.12
323 0.15
324 0.2
325 0.24
326 0.23
327 0.3
328 0.31
329 0.32
330 0.31
331 0.28
332 0.23
333 0.18
334 0.19
335 0.11
336 0.09
337 0.06
338 0.06
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.11
346 0.1
347 0.08
348 0.1
349 0.12
350 0.15
351 0.17
352 0.16
353 0.16
354 0.17
355 0.2
356 0.22
357 0.22
358 0.2
359 0.22
360 0.25
361 0.27
362 0.28
363 0.27
364 0.24
365 0.22
366 0.25
367 0.22
368 0.21
369 0.18
370 0.16
371 0.14
372 0.14
373 0.14
374 0.1
375 0.13
376 0.14
377 0.14
378 0.15
379 0.16
380 0.16
381 0.16
382 0.19
383 0.16
384 0.16
385 0.2
386 0.21
387 0.26
388 0.28
389 0.28
390 0.26
391 0.28
392 0.27
393 0.23
394 0.21
395 0.17
396 0.16
397 0.15
398 0.14
399 0.13
400 0.14
401 0.14
402 0.19
403 0.19
404 0.19
405 0.2
406 0.25
407 0.35
408 0.4
409 0.43
410 0.41
411 0.44
412 0.48
413 0.51
414 0.53
415 0.51
416 0.51
417 0.51
418 0.55
419 0.55
420 0.56
421 0.55
422 0.5
423 0.46
424 0.41
425 0.38
426 0.35
427 0.36