Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q04740

Protein Details
Accession Q04740    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-91GQVSKPHTTQKRVHRRNRPLHYSSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009027  Ribosomal_L9/RNase_H1_N  
IPR017067  RNase_H1_euk  
IPR011320  RNase_H1_N  
IPR037056  RNase_H1_N_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR002156  RNaseH_domain  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000287  F:magnesium ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
GO:0043137  P:DNA replication, removal of RNA primer  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
GO:0090502  P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  
KEGG sce:YMR234W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01693  Cauli_VI  
PF00075  RNase_H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50879  RNASE_H_1  
CDD cd09280  RNase_HI_eukaryote_like  
Amino Acid Sequences MARQGNFYAVRKGRETGIYNTWNECKNQVDGYGGAIYKKFNSYEQAKSFLGQPNTTSNYGSSTHAGGQVSKPHTTQKRVHRRNRPLHYSSLTSSSACSSLSSANTNTFYSVKSNVPNIESKIFNNWKDCQAYVKHKRGITFKKFEDQLAAENFISGMSAHDYKLMNISKESFESKYKLSSNTMYNKSMNVYCDGSSFGNGTSSSRAGYGAYFEGAPEENISEPLLSGAQTNNRAEIEAVSEALKKIWEKLTNEKEKVNYQIKTDSEYVTKLLNDRYMTYDNKKLEGLPNSDLIVPLVQRFVKVKKYYELNKECFKNNGKFQIEWVKGHDGDPGNEMADFLAKKGASRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.45
3 0.41
4 0.45
5 0.47
6 0.46
7 0.49
8 0.49
9 0.45
10 0.42
11 0.39
12 0.33
13 0.31
14 0.3
15 0.27
16 0.25
17 0.22
18 0.23
19 0.24
20 0.21
21 0.19
22 0.18
23 0.18
24 0.18
25 0.2
26 0.19
27 0.17
28 0.24
29 0.29
30 0.37
31 0.39
32 0.43
33 0.4
34 0.39
35 0.43
36 0.42
37 0.41
38 0.33
39 0.31
40 0.33
41 0.37
42 0.37
43 0.32
44 0.25
45 0.25
46 0.25
47 0.25
48 0.2
49 0.18
50 0.18
51 0.21
52 0.21
53 0.19
54 0.2
55 0.25
56 0.27
57 0.27
58 0.26
59 0.32
60 0.39
61 0.44
62 0.5
63 0.53
64 0.61
65 0.7
66 0.79
67 0.81
68 0.86
69 0.89
70 0.91
71 0.89
72 0.81
73 0.78
74 0.71
75 0.64
76 0.55
77 0.49
78 0.41
79 0.32
80 0.28
81 0.22
82 0.19
83 0.15
84 0.14
85 0.1
86 0.11
87 0.13
88 0.15
89 0.14
90 0.17
91 0.18
92 0.18
93 0.18
94 0.17
95 0.16
96 0.16
97 0.18
98 0.17
99 0.18
100 0.21
101 0.21
102 0.23
103 0.25
104 0.26
105 0.26
106 0.24
107 0.23
108 0.29
109 0.32
110 0.32
111 0.34
112 0.33
113 0.34
114 0.35
115 0.34
116 0.3
117 0.31
118 0.39
119 0.45
120 0.5
121 0.51
122 0.51
123 0.55
124 0.59
125 0.63
126 0.61
127 0.59
128 0.52
129 0.54
130 0.53
131 0.49
132 0.43
133 0.34
134 0.29
135 0.24
136 0.24
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.12
141 0.11
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.16
151 0.17
152 0.15
153 0.15
154 0.17
155 0.14
156 0.16
157 0.18
158 0.14
159 0.15
160 0.17
161 0.17
162 0.19
163 0.2
164 0.2
165 0.21
166 0.22
167 0.26
168 0.31
169 0.34
170 0.33
171 0.32
172 0.3
173 0.3
174 0.28
175 0.24
176 0.18
177 0.16
178 0.14
179 0.14
180 0.15
181 0.13
182 0.12
183 0.11
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.11
216 0.15
217 0.15
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.15
223 0.13
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.09
232 0.12
233 0.17
234 0.22
235 0.25
236 0.36
237 0.46
238 0.53
239 0.55
240 0.55
241 0.53
242 0.5
243 0.55
244 0.52
245 0.44
246 0.38
247 0.41
248 0.39
249 0.4
250 0.39
251 0.32
252 0.26
253 0.26
254 0.24
255 0.2
256 0.2
257 0.18
258 0.18
259 0.2
260 0.2
261 0.2
262 0.24
263 0.27
264 0.31
265 0.34
266 0.39
267 0.36
268 0.37
269 0.36
270 0.33
271 0.35
272 0.37
273 0.36
274 0.31
275 0.32
276 0.31
277 0.3
278 0.28
279 0.22
280 0.17
281 0.13
282 0.12
283 0.14
284 0.13
285 0.14
286 0.18
287 0.22
288 0.3
289 0.34
290 0.38
291 0.41
292 0.5
293 0.56
294 0.64
295 0.68
296 0.65
297 0.69
298 0.69
299 0.65
300 0.64
301 0.64
302 0.61
303 0.6
304 0.64
305 0.59
306 0.55
307 0.58
308 0.61
309 0.57
310 0.51
311 0.48
312 0.44
313 0.41
314 0.41
315 0.42
316 0.34
317 0.31
318 0.32
319 0.28
320 0.22
321 0.21
322 0.21
323 0.14
324 0.16
325 0.14
326 0.12
327 0.17
328 0.16