Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53155

Protein Details
Accession P53155    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
337-381NNGRNHQRERFERPEKNSKKNKFLPFNGSNKEKKRDKLKKNCVIMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
348-376ERPEKNSKKNKFLPFNGSNKEKKRDKLKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 10.5, cyto 3, mito 2.5, cyto_pero 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007518  MINDY  
IPR033979  MINDY_domain  
Gene Ontology GO:0071944  C:cell periphery  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005886  C:plasma membrane  
GO:0016807  F:cysteine-type carboxypeptidase activity  
GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:1990380  F:K48-linked deubiquitinase activity  
GO:0071108  P:protein K48-linked deubiquitination  
KEGG sce:YGL082W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04424  MINDY_DUB  
Amino Acid Sequences MDVTFLTKNVQINGTQFKILLQNGQGECALIALANVLLISPAHARYAQEISRLVRGKETVTLNELVQTLADMGVQNPNGTDVDKQQLLQILPQLYSGLNINPEFNGSFEDGVEMSIFRLYNVGIVHGWIIDGDNDPNSYEHVSKYSYMGAQKVLVQSYEIQKNNAQFENSEQIQSDAPYLKSFLARSATQLTEYGLTHLREILVERSYAVLFRNDHFCTLYKNNGELFTLVTDPTYRNRKDINWQSLKSVNGSQDSYYTGNFIPTSLERTETTATGQNESYISNPFSDQNTGHVTSNQVNSGASGVQQIEDDEELARRLQEQEDMRAANNMQNGYANNGRNHQRERFERPEKNSKKNKFLPFNGSNKEKKRDKLKKNCVIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.3
3 0.28
4 0.27
5 0.3
6 0.29
7 0.28
8 0.23
9 0.29
10 0.28
11 0.3
12 0.28
13 0.23
14 0.22
15 0.17
16 0.15
17 0.06
18 0.06
19 0.05
20 0.04
21 0.04
22 0.04
23 0.03
24 0.04
25 0.04
26 0.06
27 0.08
28 0.08
29 0.1
30 0.12
31 0.13
32 0.16
33 0.23
34 0.23
35 0.24
36 0.27
37 0.28
38 0.35
39 0.38
40 0.34
41 0.32
42 0.32
43 0.3
44 0.32
45 0.33
46 0.27
47 0.28
48 0.29
49 0.25
50 0.26
51 0.25
52 0.18
53 0.15
54 0.13
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.06
59 0.06
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.12
69 0.17
70 0.18
71 0.18
72 0.18
73 0.22
74 0.21
75 0.21
76 0.23
77 0.19
78 0.18
79 0.18
80 0.17
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.1
85 0.11
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.13
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.07
106 0.06
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.16
136 0.15
137 0.14
138 0.16
139 0.16
140 0.15
141 0.12
142 0.11
143 0.13
144 0.17
145 0.24
146 0.22
147 0.22
148 0.24
149 0.27
150 0.3
151 0.28
152 0.24
153 0.17
154 0.19
155 0.23
156 0.21
157 0.19
158 0.15
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.14
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.17
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.14
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.09
188 0.11
189 0.11
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.12
200 0.17
201 0.16
202 0.17
203 0.18
204 0.18
205 0.2
206 0.22
207 0.26
208 0.22
209 0.23
210 0.24
211 0.23
212 0.23
213 0.18
214 0.16
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.14
222 0.22
223 0.21
224 0.24
225 0.27
226 0.29
227 0.38
228 0.47
229 0.52
230 0.52
231 0.52
232 0.53
233 0.53
234 0.52
235 0.44
236 0.37
237 0.29
238 0.24
239 0.24
240 0.21
241 0.18
242 0.2
243 0.19
244 0.15
245 0.15
246 0.12
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.15
253 0.14
254 0.16
255 0.15
256 0.18
257 0.2
258 0.17
259 0.19
260 0.21
261 0.21
262 0.21
263 0.21
264 0.19
265 0.18
266 0.18
267 0.17
268 0.14
269 0.13
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.16
274 0.18
275 0.17
276 0.18
277 0.22
278 0.23
279 0.23
280 0.22
281 0.23
282 0.25
283 0.27
284 0.24
285 0.19
286 0.17
287 0.16
288 0.16
289 0.14
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.18
308 0.2
309 0.25
310 0.29
311 0.3
312 0.29
313 0.3
314 0.3
315 0.26
316 0.27
317 0.22
318 0.18
319 0.19
320 0.19
321 0.22
322 0.27
323 0.29
324 0.28
325 0.34
326 0.41
327 0.45
328 0.51
329 0.53
330 0.55
331 0.58
332 0.66
333 0.69
334 0.73
335 0.74
336 0.77
337 0.81
338 0.81
339 0.84
340 0.85
341 0.84
342 0.84
343 0.85
344 0.87
345 0.85
346 0.83
347 0.83
348 0.81
349 0.81
350 0.79
351 0.77
352 0.76
353 0.75
354 0.77
355 0.75
356 0.75
357 0.77
358 0.8
359 0.83
360 0.85
361 0.88