Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q04461

Protein Details
Accession Q04461    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
415-438EDYSLTLKRRGKPRRIFLLEEREAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
424-426RGK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022210  TF_GCR1-like  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0060963  P:positive regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II  
GO:0031503  P:protein-containing complex localization  
KEGG sce:YMR111C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12550  GCR1_C  
Amino Acid Sequences MPAREYNYVEGFGGYGSLDDDDSDRDSERRNHDLGQRTITTSPTGVSRHAALNRYMIPGRINPLFRPTDAAQPPIVSTSTSASATEPTNRIGPGRIKETPETNFNAFLIAQLTRMEEQNANLKEEISLMKKEQELFFLENQKKLEKGFKDINKYVEDVSAMKEVFKEVVGIMTGERIRFIDHTGENVTPQEAARVGNPSTSTQAHQSQSRSTNWQEYSMHASILAGDPRIKPEPGLSDFENGEYDGNESDENATTRNLPLNNPDSVSNADDSNNQLDGTGNENDIRNRRGCVGTSYKLNRAIQNVTDAAREYFEGLPGQPSVLSLERRYGSTWRRSAKERTLFTKRMTIIKRIIDIKDDPSKYGLSLPENKISRNQAIKVVENIRLGNNTFKGHHCRLSMSQLYEYFSKKMDKLEDYSLTLKRRGKPRRIFLLEEREARLSLQQPHSIPNSSTGTPEHDQDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.07
3 0.06
4 0.07
5 0.06
6 0.07
7 0.08
8 0.1
9 0.12
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.21
14 0.29
15 0.35
16 0.39
17 0.39
18 0.44
19 0.5
20 0.58
21 0.56
22 0.55
23 0.51
24 0.48
25 0.47
26 0.42
27 0.36
28 0.27
29 0.24
30 0.21
31 0.21
32 0.19
33 0.2
34 0.21
35 0.26
36 0.3
37 0.32
38 0.29
39 0.32
40 0.33
41 0.36
42 0.34
43 0.29
44 0.27
45 0.27
46 0.3
47 0.31
48 0.31
49 0.28
50 0.34
51 0.35
52 0.32
53 0.36
54 0.33
55 0.37
56 0.37
57 0.38
58 0.32
59 0.3
60 0.3
61 0.26
62 0.24
63 0.14
64 0.13
65 0.13
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.15
71 0.17
72 0.21
73 0.2
74 0.19
75 0.21
76 0.21
77 0.21
78 0.24
79 0.29
80 0.28
81 0.34
82 0.36
83 0.37
84 0.4
85 0.44
86 0.42
87 0.41
88 0.41
89 0.36
90 0.33
91 0.29
92 0.27
93 0.21
94 0.19
95 0.16
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.11
100 0.11
101 0.12
102 0.14
103 0.13
104 0.15
105 0.22
106 0.23
107 0.24
108 0.23
109 0.22
110 0.2
111 0.21
112 0.22
113 0.17
114 0.17
115 0.16
116 0.19
117 0.21
118 0.23
119 0.22
120 0.22
121 0.22
122 0.23
123 0.26
124 0.32
125 0.32
126 0.33
127 0.34
128 0.33
129 0.3
130 0.29
131 0.33
132 0.25
133 0.29
134 0.35
135 0.39
136 0.47
137 0.49
138 0.51
139 0.44
140 0.44
141 0.38
142 0.3
143 0.25
144 0.17
145 0.16
146 0.16
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.08
160 0.09
161 0.08
162 0.09
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.11
167 0.13
168 0.13
169 0.15
170 0.17
171 0.17
172 0.16
173 0.16
174 0.15
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.14
187 0.15
188 0.15
189 0.16
190 0.21
191 0.22
192 0.24
193 0.25
194 0.27
195 0.3
196 0.31
197 0.31
198 0.28
199 0.33
200 0.3
201 0.32
202 0.27
203 0.25
204 0.3
205 0.26
206 0.24
207 0.17
208 0.16
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.11
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.12
220 0.16
221 0.18
222 0.21
223 0.18
224 0.19
225 0.19
226 0.2
227 0.18
228 0.14
229 0.11
230 0.08
231 0.08
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.09
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.16
247 0.19
248 0.19
249 0.19
250 0.19
251 0.17
252 0.18
253 0.19
254 0.15
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.12
269 0.13
270 0.16
271 0.19
272 0.21
273 0.18
274 0.18
275 0.21
276 0.21
277 0.21
278 0.24
279 0.28
280 0.27
281 0.34
282 0.37
283 0.38
284 0.43
285 0.44
286 0.4
287 0.37
288 0.37
289 0.3
290 0.3
291 0.27
292 0.22
293 0.2
294 0.19
295 0.16
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.08
307 0.08
308 0.1
309 0.12
310 0.14
311 0.13
312 0.18
313 0.19
314 0.2
315 0.22
316 0.26
317 0.3
318 0.37
319 0.43
320 0.44
321 0.48
322 0.52
323 0.58
324 0.62
325 0.63
326 0.6
327 0.61
328 0.64
329 0.64
330 0.61
331 0.61
332 0.53
333 0.53
334 0.51
335 0.49
336 0.46
337 0.46
338 0.48
339 0.45
340 0.44
341 0.4
342 0.38
343 0.38
344 0.41
345 0.38
346 0.34
347 0.32
348 0.31
349 0.27
350 0.29
351 0.26
352 0.23
353 0.31
354 0.33
355 0.39
356 0.4
357 0.4
358 0.42
359 0.44
360 0.45
361 0.42
362 0.41
363 0.4
364 0.42
365 0.44
366 0.45
367 0.43
368 0.41
369 0.38
370 0.37
371 0.32
372 0.31
373 0.29
374 0.28
375 0.28
376 0.26
377 0.26
378 0.3
379 0.37
380 0.39
381 0.43
382 0.39
383 0.41
384 0.42
385 0.48
386 0.49
387 0.43
388 0.43
389 0.4
390 0.41
391 0.39
392 0.38
393 0.31
394 0.28
395 0.29
396 0.27
397 0.31
398 0.34
399 0.35
400 0.37
401 0.43
402 0.43
403 0.42
404 0.46
405 0.46
406 0.44
407 0.46
408 0.48
409 0.49
410 0.56
411 0.62
412 0.68
413 0.72
414 0.79
415 0.83
416 0.83
417 0.83
418 0.81
419 0.82
420 0.78
421 0.72
422 0.65
423 0.56
424 0.5
425 0.43
426 0.4
427 0.34
428 0.36
429 0.37
430 0.4
431 0.39
432 0.44
433 0.47
434 0.46
435 0.41
436 0.39
437 0.38
438 0.33
439 0.34
440 0.31
441 0.33
442 0.32