FuNGI

Q04377

Protein Details

Accession

Q04377

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
169-189	AKPQSPQSKKRKISDNLLKKN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5, mito 1, plas 1, pero 1, E.R. 1, golg 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR018622 DNA_damage_chkpnt_Lcd1
Gene Ontology	GO:0070310 C:ATR-ATRIP complex GO:0005737 C:cytoplasm GO:0000228 C:nuclear chromosome GO:0005634 C:nucleus GO:0003684 F:damaged DNA binding GO:0006325 P:chromatin organization GO:0000077 P:DNA damage checkpoint signaling GO:0006281 P:DNA repair GO:0045184 P:establishment of protein localization GO:0006139 P:nucleobase-containing compound metabolic process GO:2000779 P:regulation of double-strand break repair GO:0007004 P:telomere maintenance via telomerase
KEGG	sce:YDR499W -
Pfam	View protein in Pfam PF09798 LCD1

Amino Acid Sequences

MRRETVGEFSSDDDDDILLELGTRPPRFTQIPPSSAALQTQIPTTLEVTTTTLNNKQSKNDNQLVNQLNKAQGEASMLRDKINFLNIEREKEKNIQAVKVNELQVKHLQELAKLKQELQKLEDEKKFLQMEARGKSKREVITNVKPPSTTLSTNTNTITPDSSSVAIEAKPQSPQSKKRKISDNLLKKNMVPLNPNRIIPDETSLFLESILLHQIIGADLSTIEILNRLKLDYITEFKFKNFVIAKGAPIGKSIVSLLLRCKKTLTLDRFIDTLLEDIAVLIKEISVHPNESKLAVPFLVALMYQIVQFRPSATHNLALKDCFLFICDLIRIYHHVLKVPIHESNMNLHVEPQIFQYELIDYLIISYSFDLLEGILRVLQSHPKQTYMEFFDENILKSFEFVYKLALTISYKPMVNVIFSAVEVVNIITSIILNMDNSSDLKSLISGSWWRDCITRLYALLEKEIKSGDVYNENVDTTTLHMSKYHDFFGLIRNIGDNELGGLISKLIYTDRLQSVPRVISKEDIGMDSDKFTAPIIGYKMEKWLLKLKDEVLNIFENLLMIYGDDATIVNGEMLIHSSKFLSREQALMIERYVGQDSPNLDLRCHLIEHTLTIIYRLWKDHFKQLREEQIKQVESQLIMSLWRFLVCQTETVTANEREMRDHRHLVDSLHDLTIKDQASYYEDAFEDLPEYIEEELKMQLNKRTGRIMQVKYDEKFQEMARTILESKSFDLTTLEEADSLYISMGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.12
3	0.12
4	0.1
5	0.06
6	0.07
7	0.08
8	0.13
9	0.19
10	0.2
11	0.21
12	0.23
13	0.3
14	0.33
15	0.37
16	0.43
17	0.45
18	0.48
19	0.48
20	0.5
21	0.47
22	0.44
23	0.41
24	0.32
25	0.26
26	0.24
27	0.22
28	0.2
29	0.18
30	0.18
31	0.18
32	0.16
33	0.14
34	0.14
35	0.15
36	0.15
37	0.16
38	0.19
39	0.24
40	0.3
41	0.37
42	0.38
43	0.42
44	0.49
45	0.56
46	0.61
47	0.64
48	0.62
49	0.58
50	0.64
51	0.65
52	0.59
53	0.53
54	0.47
55	0.43
56	0.37
57	0.35
58	0.26
59	0.2
60	0.21
61	0.2
62	0.22
63	0.25
64	0.25
65	0.26
66	0.26
67	0.28
68	0.25
69	0.29
70	0.26
71	0.22
72	0.32
73	0.33
74	0.4
75	0.41
76	0.41
77	0.4
78	0.43
79	0.46
80	0.43
81	0.43
82	0.42
83	0.45
84	0.46
85	0.46
86	0.47
87	0.46
88	0.42
89	0.4
90	0.38
91	0.38
92	0.38
93	0.33
94	0.32
95	0.28
96	0.3
97	0.36
98	0.37
99	0.39
100	0.37
101	0.39
102	0.4
103	0.45
104	0.43
105	0.39
106	0.43
107	0.4
108	0.48
109	0.48
110	0.47
111	0.43
112	0.47
113	0.45
114	0.37
115	0.37
116	0.35
117	0.39
118	0.4
119	0.48
120	0.44
121	0.45
122	0.48
123	0.5
124	0.48
125	0.46
126	0.48
127	0.48
128	0.55
129	0.62
130	0.63
131	0.57
132	0.52
133	0.48
134	0.46
135	0.42
136	0.34
137	0.28
138	0.32
139	0.32
140	0.35
141	0.35
142	0.3
143	0.26
144	0.25
145	0.23
146	0.16
147	0.16
148	0.16
149	0.16
150	0.14
151	0.14
152	0.14
153	0.12
154	0.16
155	0.17
156	0.16
157	0.18
158	0.21
159	0.28
160	0.35
161	0.45
162	0.51
163	0.59
164	0.66
165	0.71
166	0.77
167	0.76
168	0.79
169	0.8
170	0.8
171	0.79
172	0.77
173	0.71
174	0.61
175	0.63
176	0.56
177	0.48
178	0.43
179	0.4
180	0.44
181	0.46
182	0.46
183	0.4
184	0.39
185	0.38
186	0.32
187	0.31
188	0.22
189	0.2
190	0.21
191	0.2
192	0.17
193	0.15
194	0.14
195	0.09
196	0.09
197	0.1
198	0.08
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.1
218	0.12
219	0.13
220	0.17
221	0.18
222	0.21
223	0.22
224	0.21
225	0.24
226	0.22
227	0.26
228	0.23
229	0.22
230	0.25
231	0.26
232	0.26
233	0.28
234	0.3
235	0.22
236	0.21
237	0.21
238	0.14
239	0.13
240	0.13
241	0.11
242	0.1
243	0.11
244	0.17
245	0.25
246	0.26
247	0.25
248	0.26
249	0.25
250	0.3
251	0.39
252	0.38
253	0.38
254	0.39
255	0.4
256	0.4
257	0.37
258	0.32
259	0.22
260	0.17
261	0.09
262	0.06
263	0.05
264	0.04
265	0.05
266	0.05
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.05
272	0.08
273	0.08
274	0.1
275	0.1
276	0.12
277	0.13
278	0.13
279	0.14
280	0.12
281	0.12
282	0.1
283	0.1
284	0.08
285	0.08
286	0.07
287	0.05
288	0.05
289	0.04
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.07
297	0.09
298	0.1
299	0.14
300	0.15
301	0.2
302	0.21
303	0.24
304	0.24
305	0.23
306	0.22
307	0.18
308	0.16
309	0.11
310	0.09
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.1
319	0.12
320	0.16
321	0.15
322	0.16
323	0.17
324	0.18
325	0.2
326	0.2
327	0.18
328	0.16
329	0.17
330	0.16
331	0.17
332	0.19
333	0.17
334	0.14
335	0.13
336	0.14
337	0.14
338	0.13
339	0.12
340	0.1
341	0.09
342	0.09
343	0.09
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.05
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.03
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.05
366	0.11
367	0.12
368	0.17
369	0.17
370	0.19
371	0.19
372	0.2
373	0.23
374	0.22
375	0.23
376	0.18
377	0.18
378	0.19
379	0.19
380	0.19
381	0.16
382	0.13
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.09
387	0.1
388	0.09
389	0.11
390	0.1
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.11
396	0.13
397	0.12
398	0.12
399	0.12
400	0.14
401	0.13
402	0.12
403	0.1
404	0.09
405	0.08
406	0.07
407	0.09
408	0.07
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.03
416	0.03
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.04
422	0.04
423	0.05
424	0.05
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.08
433	0.09
434	0.12
435	0.14
436	0.15
437	0.16
438	0.16
439	0.17
440	0.19
441	0.19
442	0.18
443	0.16
444	0.18
445	0.2
446	0.19
447	0.21
448	0.21
449	0.19
450	0.18
451	0.18
452	0.15
453	0.13
454	0.14
455	0.12
456	0.13
457	0.14
458	0.14
459	0.15
460	0.14
461	0.13
462	0.12
463	0.1
464	0.09
465	0.12
466	0.11
467	0.11
468	0.13
469	0.15
470	0.19
471	0.21
472	0.21
473	0.17
474	0.17
475	0.18
476	0.21
477	0.23
478	0.19
479	0.17
480	0.16
481	0.16
482	0.16
483	0.15
484	0.09
485	0.06
486	0.06
487	0.05
488	0.05
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.07
496	0.08
497	0.13
498	0.15
499	0.17
500	0.18
501	0.19
502	0.22
503	0.24
504	0.26
505	0.24
506	0.23
507	0.22
508	0.22
509	0.23
510	0.21
511	0.18
512	0.16
513	0.15
514	0.15
515	0.14
516	0.14
517	0.12
518	0.11
519	0.1
520	0.09
521	0.08
522	0.11
523	0.12
524	0.13
525	0.14
526	0.15
527	0.18
528	0.2
529	0.21
530	0.21
531	0.27
532	0.27
533	0.29
534	0.31
535	0.31
536	0.33
537	0.33
538	0.31
539	0.26
540	0.25
541	0.23
542	0.2
543	0.17
544	0.11
545	0.1
546	0.09
547	0.06
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.04
555	0.04
556	0.05
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.06
562	0.07
563	0.07
564	0.07
565	0.08
566	0.1
567	0.12
568	0.13
569	0.17
570	0.17
571	0.18
572	0.19
573	0.23
574	0.23
575	0.22
576	0.21
577	0.18
578	0.17
579	0.17
580	0.18
581	0.13
582	0.12
583	0.13
584	0.15
585	0.17
586	0.24
587	0.23
588	0.22
589	0.22
590	0.25
591	0.23
592	0.23
593	0.19
594	0.15
595	0.15
596	0.16
597	0.17
598	0.16
599	0.14
600	0.14
601	0.16
602	0.16
603	0.18
604	0.2
605	0.21
606	0.28
607	0.31
608	0.4
609	0.46
610	0.46
611	0.53
612	0.57
613	0.64
614	0.63
615	0.64
616	0.61
617	0.61
618	0.59
619	0.51
620	0.48
621	0.39
622	0.33
623	0.3
624	0.24
625	0.16
626	0.16
627	0.15
628	0.14
629	0.11
630	0.11
631	0.11
632	0.1
633	0.16
634	0.15
635	0.17
636	0.18
637	0.21
638	0.22
639	0.24
640	0.3
641	0.24
642	0.27
643	0.29
644	0.27
645	0.29
646	0.31
647	0.36
648	0.38
649	0.42
650	0.42
651	0.43
652	0.44
653	0.4
654	0.41
655	0.38
656	0.33
657	0.29
658	0.28
659	0.23
660	0.22
661	0.27
662	0.23
663	0.18
664	0.17
665	0.16
666	0.19
667	0.22
668	0.21
669	0.18
670	0.18
671	0.18
672	0.18
673	0.17
674	0.14
675	0.12
676	0.12
677	0.09
678	0.1
679	0.1
680	0.11
681	0.11
682	0.11
683	0.13
684	0.16
685	0.19
686	0.21
687	0.26
688	0.32
689	0.37
690	0.39
691	0.44
692	0.43
693	0.5
694	0.57
695	0.56
696	0.56
697	0.61
698	0.64
699	0.58
700	0.64
701	0.55
702	0.48
703	0.46
704	0.39
705	0.39
706	0.34
707	0.34
708	0.27
709	0.3
710	0.29
711	0.29
712	0.31
713	0.23
714	0.24
715	0.27
716	0.26
717	0.22
718	0.22
719	0.21
720	0.21
721	0.22
722	0.2
723	0.16
724	0.16
725	0.16
726	0.15
727	0.13

Q04377

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer