FuNGI

P41812

Protein Details

Accession

P41812

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-35	GKKVLNKNQLLKRNRIRNARSIRAE	Hydrophilic
88-125	IFQALPRKLRRRTASHNVRRIPKRMRNRALREMRKSDQ	Hydrophilic
614-635	FYKKEASKTKWDRKPMGKRINF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
93-121	PRKLRRRTASHNVRRIPKRMRNRALREMR

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito_nucl 13.833, cyto_nucl 9.833, mito 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039182 Pop1 IPR009723 Pop1_N IPR012590 POPLD_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005655 C:nucleolar ribonuclease P complex GO:0000172 C:ribonuclease MRP complex GO:0005697 C:telomerase holoenzyme complex GO:0004526 F:ribonuclease P activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0034965 P:intronic box C/D RNA processing GO:0000460 P:maturation of 5.8S rRNA GO:0000294 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, RNase MRP-dependent GO:0090502 P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic GO:0006364 P:rRNA processing GO:0001682 P:tRNA 5'-leader removal GO:0008033 P:tRNA processing
KEGG	sce:YNL221C -
Pfam	View protein in Pfam PF06978 POP1 PF08170 POPLD

Amino Acid Sequences

MSGSLSRGNGGKKVLNKNQLLKRNRIRNARSIRAEAVAASSTKTGTPSDLSESGSKLNVDQFISSRQFEVKQLQLAMHNSKAASSTRIFQALPRKLRRRTASHNVRRIPKRMRNRALREMRKSDQQDVLKGSSASSRKAHGLNAKQLYKARMSIKLLRLASKSTSMKLSMPPEVTSSNCHVRQKIKTLKRMIKESSTANPNIKLLNNRMGSYDCTGVNELAPIPKGRVKYTKRQKHFAWLPTHIWNAKRSHMMKRWGYQMVWAPTQKCFKLTHRLGGDTCSSDGALCMDSSYIGTIIVKDKSNDSEGDFLKSIIGKLTAERANLRKYREGQVLFQGLIYSFNEENGEDSTKPLGPCDVFWVQKDTAIIRLHPSIYTQVFNILLQHKEKLTVQDCRYSLASVTLKGAKALESLASCLRSTEYSKSFEQFKMVSMITDHNALPQRCTFAFEAIDPRHLAAPKKLNDSQRKTVNSDDILSLHENYPQDEINAVFNELCDPESRTQSYNNQNTLKEISARRYKLLTATPNSINKTTVPFKESDDPSIPLVIIRRLKTRDWIVVLPWFWLLPLWHLLNRIPRMYHIGLRQFQQIQYENKQLYFPDDYPFTQLGYIENSFYKKEASKTKWDRKPMGKRINFEKIKDIHNTKLPAYSGEIGDFFSSDWRFLQILRNGIDYLQRNDKTLELMDSKKTGQFNAQGVRDINCVNDVLEFCKDYEAKTKAMSLSIEENIPVALCKNRKCQFRTPDSISVNSSSFSLTFFPRCIIAVSCTLLERGHPKDNARIYQVPEKDLEHWLQLAKGVYRPNGRKDHDLKIPLPEVHDLIGFITSGTYHLNCGNGMGIGFIDHHAAIRQPTRYVLIRNVGTNTYRLGEWSKISV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.59
3	0.63
4	0.69
5	0.74
6	0.79
7	0.77
8	0.77
9	0.78
10	0.79
11	0.81
12	0.82
13	0.79
14	0.79
15	0.83
16	0.82
17	0.78
18	0.73
19	0.67
20	0.59
21	0.53
22	0.43
23	0.36
24	0.28
25	0.22
26	0.18
27	0.16
28	0.14
29	0.14
30	0.16
31	0.14
32	0.14
33	0.16
34	0.17
35	0.23
36	0.24
37	0.26
38	0.27
39	0.28
40	0.27
41	0.26
42	0.24
43	0.19
44	0.22
45	0.22
46	0.21
47	0.21
48	0.21
49	0.26
50	0.3
51	0.3
52	0.28
53	0.27
54	0.28
55	0.3
56	0.35
57	0.32
58	0.32
59	0.32
60	0.32
61	0.34
62	0.38
63	0.38
64	0.34
65	0.32
66	0.27
67	0.26
68	0.27
69	0.24
70	0.23
71	0.2
72	0.22
73	0.23
74	0.27
75	0.26
76	0.28
77	0.37
78	0.42
79	0.5
80	0.56
81	0.62
82	0.66
83	0.76
84	0.79
85	0.78
86	0.78
87	0.79
88	0.8
89	0.82
90	0.85
91	0.83
92	0.85
93	0.83
94	0.82
95	0.82
96	0.8
97	0.81
98	0.83
99	0.85
100	0.85
101	0.87
102	0.89
103	0.9
104	0.89
105	0.87
106	0.84
107	0.78
108	0.77
109	0.73
110	0.68
111	0.65
112	0.59
113	0.54
114	0.51
115	0.49
116	0.42
117	0.37
118	0.32
119	0.31
120	0.3
121	0.29
122	0.26
123	0.27
124	0.28
125	0.3
126	0.35
127	0.37
128	0.42
129	0.47
130	0.54
131	0.53
132	0.53
133	0.55
134	0.53
135	0.47
136	0.45
137	0.4
138	0.39
139	0.42
140	0.47
141	0.48
142	0.52
143	0.51
144	0.5
145	0.47
146	0.43
147	0.4
148	0.39
149	0.36
150	0.31
151	0.32
152	0.29
153	0.3
154	0.32
155	0.34
156	0.31
157	0.31
158	0.29
159	0.29
160	0.29
161	0.28
162	0.26
163	0.27
164	0.3
165	0.34
166	0.37
167	0.38
168	0.44
169	0.49
170	0.55
171	0.61
172	0.61
173	0.65
174	0.72
175	0.75
176	0.75
177	0.76
178	0.71
179	0.65
180	0.6
181	0.56
182	0.53
183	0.5
184	0.47
185	0.43
186	0.4
187	0.35
188	0.34
189	0.33
190	0.31
191	0.29
192	0.34
193	0.33
194	0.32
195	0.33
196	0.32
197	0.31
198	0.28
199	0.27
200	0.18
201	0.18
202	0.19
203	0.17
204	0.16
205	0.14
206	0.12
207	0.11
208	0.13
209	0.11
210	0.13
211	0.16
212	0.18
213	0.21
214	0.31
215	0.35
216	0.44
217	0.55
218	0.63
219	0.66
220	0.72
221	0.7
222	0.71
223	0.73
224	0.71
225	0.67
226	0.61
227	0.59
228	0.55
229	0.57
230	0.5
231	0.44
232	0.41
233	0.37
234	0.35
235	0.4
236	0.39
237	0.44
238	0.48
239	0.55
240	0.55
241	0.56
242	0.59
243	0.54
244	0.5
245	0.45
246	0.45
247	0.4
248	0.39
249	0.37
250	0.32
251	0.34
252	0.39
253	0.35
254	0.31
255	0.31
256	0.31
257	0.39
258	0.41
259	0.44
260	0.42
261	0.45
262	0.42
263	0.41
264	0.38
265	0.28
266	0.26
267	0.18
268	0.15
269	0.12
270	0.11
271	0.09
272	0.08
273	0.06
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.06
279	0.05
280	0.04
281	0.04
282	0.05
283	0.08
284	0.11
285	0.12
286	0.12
287	0.14
288	0.16
289	0.18
290	0.18
291	0.16
292	0.2
293	0.2
294	0.22
295	0.21
296	0.19
297	0.18
298	0.17
299	0.16
300	0.11
301	0.11
302	0.08
303	0.08
304	0.14
305	0.15
306	0.16
307	0.19
308	0.22
309	0.29
310	0.32
311	0.35
312	0.35
313	0.37
314	0.42
315	0.45
316	0.43
317	0.38
318	0.39
319	0.38
320	0.32
321	0.28
322	0.22
323	0.15
324	0.15
325	0.13
326	0.11
327	0.09
328	0.09
329	0.1
330	0.09
331	0.1
332	0.11
333	0.13
334	0.09
335	0.1
336	0.12
337	0.14
338	0.14
339	0.13
340	0.13
341	0.12
342	0.12
343	0.17
344	0.19
345	0.17
346	0.18
347	0.23
348	0.2
349	0.22
350	0.22
351	0.17
352	0.19
353	0.19
354	0.18
355	0.16
356	0.17
357	0.16
358	0.16
359	0.16
360	0.14
361	0.15
362	0.15
363	0.12
364	0.13
365	0.12
366	0.12
367	0.14
368	0.13
369	0.14
370	0.14
371	0.15
372	0.14
373	0.15
374	0.16
375	0.19
376	0.21
377	0.26
378	0.27
379	0.32
380	0.32
381	0.32
382	0.32
383	0.26
384	0.23
385	0.2
386	0.2
387	0.14
388	0.16
389	0.16
390	0.16
391	0.16
392	0.16
393	0.1
394	0.1
395	0.09
396	0.09
397	0.06
398	0.08
399	0.09
400	0.1
401	0.09
402	0.09
403	0.1
404	0.1
405	0.12
406	0.15
407	0.17
408	0.2
409	0.21
410	0.23
411	0.25
412	0.24
413	0.24
414	0.19
415	0.17
416	0.17
417	0.16
418	0.14
419	0.12
420	0.13
421	0.11
422	0.13
423	0.11
424	0.12
425	0.17
426	0.17
427	0.17
428	0.17
429	0.19
430	0.17
431	0.2
432	0.17
433	0.14
434	0.14
435	0.14
436	0.19
437	0.17
438	0.18
439	0.15
440	0.15
441	0.16
442	0.17
443	0.18
444	0.17
445	0.24
446	0.25
447	0.31
448	0.36
449	0.42
450	0.5
451	0.55
452	0.57
453	0.57
454	0.57
455	0.53
456	0.51
457	0.46
458	0.38
459	0.32
460	0.26
461	0.19
462	0.18
463	0.16
464	0.15
465	0.12
466	0.13
467	0.12
468	0.12
469	0.13
470	0.11
471	0.1
472	0.1
473	0.1
474	0.09
475	0.09
476	0.09
477	0.08
478	0.07
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.06
483	0.09
484	0.11
485	0.14
486	0.15
487	0.16
488	0.18
489	0.26
490	0.34
491	0.38
492	0.42
493	0.42
494	0.41
495	0.41
496	0.41
497	0.34
498	0.3
499	0.25
500	0.27
501	0.31
502	0.32
503	0.32
504	0.31
505	0.3
506	0.29
507	0.33
508	0.32
509	0.27
510	0.31
511	0.34
512	0.37
513	0.38
514	0.36
515	0.31
516	0.25
517	0.27
518	0.27
519	0.25
520	0.23
521	0.22
522	0.24
523	0.31
524	0.32
525	0.31
526	0.29
527	0.28
528	0.27
529	0.26
530	0.23
531	0.15
532	0.16
533	0.16
534	0.18
535	0.19
536	0.24
537	0.26
538	0.27
539	0.32
540	0.34
541	0.34
542	0.33
543	0.32
544	0.28
545	0.29
546	0.29
547	0.24
548	0.2
549	0.15
550	0.12
551	0.11
552	0.1
553	0.07
554	0.11
555	0.11
556	0.12
557	0.14
558	0.17
559	0.23
560	0.26
561	0.25
562	0.22
563	0.22
564	0.28
565	0.28
566	0.3
567	0.28
568	0.33
569	0.34
570	0.35
571	0.38
572	0.34
573	0.32
574	0.33
575	0.33
576	0.31
577	0.33
578	0.38
579	0.34
580	0.33
581	0.33
582	0.28
583	0.27
584	0.27
585	0.23
586	0.19
587	0.21
588	0.21
589	0.24
590	0.24
591	0.2
592	0.16
593	0.16
594	0.14
595	0.15
596	0.15
597	0.12
598	0.14
599	0.15
600	0.15
601	0.15
602	0.17
603	0.15
604	0.21
605	0.29
606	0.33
607	0.42
608	0.53
609	0.63
610	0.67
611	0.73
612	0.76
613	0.77
614	0.83
615	0.83
616	0.83
617	0.78
618	0.76
619	0.76
620	0.78
621	0.71
622	0.62
623	0.6
624	0.52
625	0.51
626	0.53
627	0.49
628	0.43
629	0.45
630	0.46
631	0.39
632	0.39
633	0.35
634	0.29
635	0.29
636	0.26
637	0.2
638	0.19
639	0.18
640	0.14
641	0.14
642	0.13
643	0.09
644	0.11
645	0.11
646	0.11
647	0.11
648	0.12
649	0.13
650	0.14
651	0.22
652	0.22
653	0.26
654	0.27
655	0.28
656	0.26
657	0.26
658	0.31
659	0.26
660	0.27
661	0.31
662	0.31
663	0.31
664	0.31
665	0.31
666	0.28
667	0.26
668	0.25
669	0.21
670	0.23
671	0.24
672	0.25
673	0.26
674	0.27
675	0.27
676	0.24
677	0.24
678	0.28
679	0.31
680	0.35
681	0.35
682	0.35
683	0.35
684	0.36
685	0.33
686	0.27
687	0.22
688	0.16
689	0.15
690	0.12
691	0.13
692	0.12
693	0.12
694	0.14
695	0.14
696	0.13
697	0.18
698	0.18
699	0.17
700	0.25
701	0.25
702	0.25
703	0.26
704	0.29
705	0.26
706	0.28
707	0.27
708	0.2
709	0.22
710	0.22
711	0.21
712	0.17
713	0.16
714	0.14
715	0.13
716	0.11
717	0.08
718	0.13
719	0.18
720	0.24
721	0.34
722	0.41
723	0.49
724	0.55
725	0.64
726	0.68
727	0.72
728	0.76
729	0.73
730	0.76
731	0.71
732	0.67
733	0.6
734	0.53
735	0.43
736	0.35
737	0.27
738	0.19
739	0.15
740	0.14
741	0.14
742	0.14
743	0.16
744	0.16
745	0.17
746	0.16
747	0.17
748	0.18
749	0.17
750	0.17
751	0.18
752	0.19
753	0.19
754	0.19
755	0.19
756	0.17
757	0.18
758	0.21
759	0.23
760	0.29
761	0.32
762	0.34
763	0.42
764	0.49
765	0.51
766	0.52
767	0.51
768	0.5
769	0.55
770	0.54
771	0.48
772	0.43
773	0.41
774	0.37
775	0.37
776	0.33
777	0.26
778	0.25
779	0.24
780	0.22
781	0.22
782	0.22
783	0.2
784	0.22
785	0.25
786	0.29
787	0.38
788	0.43
789	0.49
790	0.56
791	0.58
792	0.64
793	0.65
794	0.67
795	0.66
796	0.67
797	0.6
798	0.58
799	0.59
800	0.51
801	0.48
802	0.42
803	0.35
804	0.29
805	0.27
806	0.2
807	0.15
808	0.14
809	0.11
810	0.08
811	0.07
812	0.06
813	0.07
814	0.1
815	0.09
816	0.11
817	0.12
818	0.14
819	0.13
820	0.14
821	0.14
822	0.12
823	0.11
824	0.09
825	0.08
826	0.07
827	0.08
828	0.08
829	0.09
830	0.08
831	0.09
832	0.1
833	0.12
834	0.16
835	0.21
836	0.23
837	0.23
838	0.26
839	0.31
840	0.34
841	0.36
842	0.38
843	0.41
844	0.41
845	0.43
846	0.44
847	0.42
848	0.4
849	0.37
850	0.32
851	0.26
852	0.23
853	0.22
854	0.23
855	0.23

P41812

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer