FuNGI

P40522

Protein Details

Accession

P40522

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
89-115	VTAAVQSVRRNRKRSKKRYALSIANGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
97-106	RRNRKRSKKR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007147 TF_Vhr
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0000981 F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific GO:0000977 F:RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding GO:0045944 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	sce:YIL056W -
Pfam	View protein in Pfam PF04001 Vhr1

Amino Acid Sequences

MNGPPTFTQYRINKFSGNGATHKIRELLNFNDEKKWKQFSSRRLELIDKFQLSQYKASEQDQNIKQIATILRTEFGYPVSCSKEFEKLVTAAVQSVRRNRKRSKKRYALSIANGSGGNVNNSISSNSTSDDEISPSIYQRSNSDFLPSSNYAADFQFSNKFQPLMSHQSHNGTIFPTVGTQNDSSPSVTSTQQKYNDIVTMLVHDLVTNVVPLSEQALKDPYTGPNLSHFATSSLSQQPNITTNIPIDSTVPFFLREKLLLQIQRSRTCQDISQAAGSIDIYANLEILGEMSIRMSIAFVIERFFSNLVSSSMKYITAKTCSPENLALLSQRLFGAATRHNLSHFPAAQVQLRLLYLVIGGIVKDFGFDPTLYPLSEIIHHIVMVQYPLASSCASEPPSSSPNKRVKRSPPVVSSDVMLNNNNTLSNRATLLTTLPMKPQSANKDVNRRVIIRFNDREQAFTFHQLSNGPPTVSEVLENCKNLFNIINKNKNFGIFHNDNLLNDESLAKLFDSFSTSEIHLVIKDISTIPLQDAKIPVPITLPKMSCIGENPSMPSIPLVPQEKDDPKKSSLTAFDNILNRISKSPMNEENSNTTLNTGTSTSNTNNNDHNESVPAPYVTKNKNSFQNGNLPQPVFQPLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.54
3	0.52
4	0.48
5	0.43
6	0.44
7	0.47
8	0.45
9	0.46
10	0.41
11	0.35
12	0.36
13	0.38
14	0.36
15	0.39
16	0.43
17	0.43
18	0.49
19	0.5
20	0.5
21	0.52
22	0.54
23	0.48
24	0.53
25	0.6
26	0.61
27	0.68
28	0.7
29	0.68
30	0.65
31	0.69
32	0.63
33	0.63
34	0.61
35	0.53
36	0.46
37	0.45
38	0.46
39	0.42
40	0.42
41	0.36
42	0.34
43	0.35
44	0.37
45	0.42
46	0.39
47	0.47
48	0.46
49	0.49
50	0.45
51	0.41
52	0.38
53	0.36
54	0.35
55	0.28
56	0.27
57	0.22
58	0.22
59	0.23
60	0.24
61	0.19
62	0.18
63	0.18
64	0.16
65	0.19
66	0.24
67	0.23
68	0.25
69	0.27
70	0.33
71	0.31
72	0.32
73	0.32
74	0.26
75	0.28
76	0.27
77	0.25
78	0.2
79	0.23
80	0.26
81	0.27
82	0.35
83	0.45
84	0.51
85	0.59
86	0.66
87	0.73
88	0.8
89	0.86
90	0.88
91	0.88
92	0.86
93	0.89
94	0.87
95	0.85
96	0.8
97	0.77
98	0.66
99	0.57
100	0.5
101	0.4
102	0.34
103	0.26
104	0.2
105	0.13
106	0.12
107	0.11
108	0.12
109	0.12
110	0.11
111	0.13
112	0.12
113	0.13
114	0.14
115	0.14
116	0.15
117	0.15
118	0.15
119	0.14
120	0.15
121	0.14
122	0.14
123	0.17
124	0.17
125	0.17
126	0.18
127	0.23
128	0.23
129	0.23
130	0.26
131	0.24
132	0.23
133	0.29
134	0.28
135	0.24
136	0.23
137	0.23
138	0.2
139	0.19
140	0.19
141	0.12
142	0.14
143	0.17
144	0.17
145	0.2
146	0.2
147	0.2
148	0.19
149	0.22
150	0.25
151	0.28
152	0.3
153	0.31
154	0.31
155	0.34
156	0.36
157	0.33
158	0.29
159	0.21
160	0.19
161	0.15
162	0.14
163	0.12
164	0.11
165	0.11
166	0.13
167	0.12
168	0.13
169	0.14
170	0.15
171	0.14
172	0.14
173	0.14
174	0.14
175	0.16
176	0.21
177	0.24
178	0.29
179	0.32
180	0.34
181	0.34
182	0.34
183	0.32
184	0.27
185	0.23
186	0.16
187	0.15
188	0.13
189	0.12
190	0.1
191	0.08
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.05
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.07
201	0.09
202	0.09
203	0.1
204	0.13
205	0.13
206	0.15
207	0.16
208	0.15
209	0.17
210	0.18
211	0.17
212	0.19
213	0.21
214	0.2
215	0.19
216	0.17
217	0.14
218	0.15
219	0.15
220	0.15
221	0.19
222	0.19
223	0.19
224	0.2
225	0.2
226	0.21
227	0.23
228	0.2
229	0.15
230	0.14
231	0.15
232	0.15
233	0.13
234	0.12
235	0.1
236	0.1
237	0.1
238	0.1
239	0.11
240	0.11
241	0.12
242	0.13
243	0.12
244	0.12
245	0.13
246	0.18
247	0.19
248	0.21
249	0.26
250	0.3
251	0.34
252	0.35
253	0.35
254	0.32
255	0.3
256	0.29
257	0.25
258	0.23
259	0.19
260	0.18
261	0.17
262	0.15
263	0.14
264	0.12
265	0.1
266	0.07
267	0.06
268	0.05
269	0.04
270	0.05
271	0.04
272	0.04
273	0.03
274	0.04
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.04
286	0.04
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.09
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.1
300	0.11
301	0.11
302	0.12
303	0.13
304	0.14
305	0.15
306	0.15
307	0.17
308	0.17
309	0.18
310	0.17
311	0.16
312	0.14
313	0.13
314	0.13
315	0.12
316	0.11
317	0.09
318	0.08
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.1
323	0.11
324	0.14
325	0.15
326	0.16
327	0.16
328	0.17
329	0.18
330	0.19
331	0.17
332	0.16
333	0.16
334	0.18
335	0.19
336	0.19
337	0.17
338	0.13
339	0.12
340	0.11
341	0.08
342	0.07
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.09
358	0.1
359	0.1
360	0.1
361	0.1
362	0.09
363	0.11
364	0.11
365	0.1
366	0.09
367	0.09
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.06
373	0.04
374	0.04
375	0.05
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.1
381	0.12
382	0.12
383	0.13
384	0.15
385	0.2
386	0.24
387	0.25
388	0.31
389	0.39
390	0.47
391	0.51
392	0.56
393	0.6
394	0.67
395	0.72
396	0.71
397	0.67
398	0.65
399	0.63
400	0.55
401	0.47
402	0.39
403	0.34
404	0.27
405	0.23
406	0.16
407	0.15
408	0.15
409	0.15
410	0.12
411	0.12
412	0.11
413	0.11
414	0.12
415	0.12
416	0.12
417	0.11
418	0.12
419	0.13
420	0.15
421	0.15
422	0.17
423	0.18
424	0.19
425	0.2
426	0.25
427	0.28
428	0.32
429	0.39
430	0.42
431	0.51
432	0.54
433	0.6
434	0.57
435	0.53
436	0.49
437	0.49
438	0.49
439	0.47
440	0.48
441	0.44
442	0.48
443	0.46
444	0.45
445	0.39
446	0.4
447	0.32
448	0.33
449	0.33
450	0.25
451	0.26
452	0.25
453	0.24
454	0.25
455	0.24
456	0.19
457	0.16
458	0.19
459	0.19
460	0.19
461	0.18
462	0.14
463	0.17
464	0.21
465	0.22
466	0.2
467	0.2
468	0.2
469	0.2
470	0.23
471	0.22
472	0.29
473	0.38
474	0.46
475	0.44
476	0.48
477	0.48
478	0.48
479	0.45
480	0.36
481	0.36
482	0.29
483	0.3
484	0.34
485	0.34
486	0.3
487	0.32
488	0.31
489	0.22
490	0.2
491	0.19
492	0.12
493	0.11
494	0.12
495	0.08
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.11
500	0.11
501	0.11
502	0.13
503	0.14
504	0.14
505	0.14
506	0.14
507	0.11
508	0.12
509	0.12
510	0.09
511	0.1
512	0.1
513	0.11
514	0.11
515	0.11
516	0.12
517	0.16
518	0.16
519	0.18
520	0.19
521	0.19
522	0.23
523	0.23
524	0.21
525	0.19
526	0.22
527	0.24
528	0.28
529	0.28
530	0.24
531	0.27
532	0.27
533	0.25
534	0.25
535	0.27
536	0.25
537	0.26
538	0.28
539	0.27
540	0.27
541	0.26
542	0.23
543	0.19
544	0.17
545	0.22
546	0.23
547	0.23
548	0.25
549	0.33
550	0.41
551	0.46
552	0.5
553	0.48
554	0.47
555	0.5
556	0.49
557	0.47
558	0.44
559	0.43
560	0.4
561	0.37
562	0.4
563	0.39
564	0.39
565	0.37
566	0.32
567	0.28
568	0.27
569	0.28
570	0.25
571	0.26
572	0.32
573	0.36
574	0.41
575	0.43
576	0.45
577	0.48
578	0.48
579	0.45
580	0.38
581	0.31
582	0.25
583	0.21
584	0.2
585	0.15
586	0.14
587	0.14
588	0.18
589	0.2
590	0.27
591	0.3
592	0.31
593	0.36
594	0.39
595	0.43
596	0.4
597	0.38
598	0.34
599	0.32
600	0.31
601	0.28
602	0.24
603	0.21
604	0.25
605	0.32
606	0.34
607	0.42
608	0.46
609	0.5
610	0.58
611	0.64
612	0.64
613	0.61
614	0.66
615	0.62
616	0.65
617	0.65
618	0.56
619	0.49
620	0.46

P40522

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer