Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40356

Protein Details
Accession P40356    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-229AAPIAAPKKPRKPRQTKKAKAQAQAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-223APKKPRKPRQTKKAK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020998  Med3  
Gene Ontology GO:0070847  C:core mediator complex  
GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000979  F:RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0061629  F:RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0060261  P:positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG sce:YGL025C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11593  Med3  
Amino Acid Sequences MDSIIPAGVKLDDLQVILAKNENETRDKVCKQINEARDEILPLRLQFNEFIQIMANIDQEGSKQADRMAKYLHIRDKILQLNDRFQTLSSHLEALQPLFSTVPEYLKTADNRDRSFQLLEPLSTYNKNGNAVCSTATVVSTNHSAAASTPTTTATPHANPITHAHSLSNPNSTATMQHNPLAGKRGPKSGSTMGTPTVHNSTAAAPIAAPKKPRKPRQTKKAKAQAQAQAQAQAQVYAQQSTVQTPITASMAAALPNPTPSMINSVSPTNVMGTPLTNMMSPMGNAYSMGAQNQGGQVSMSQFNGSGNGSNPNTNTNSNNTPLQSQLNLNNLTPANILNMSMNNDFQQQQQQQQQQQQPQPQYNMNMGMNNMNNGGKELDSLDLNNLELGGLNMDFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.14
4 0.14
5 0.17
6 0.15
7 0.18
8 0.22
9 0.25
10 0.26
11 0.29
12 0.34
13 0.39
14 0.41
15 0.45
16 0.47
17 0.48
18 0.52
19 0.58
20 0.59
21 0.56
22 0.55
23 0.51
24 0.45
25 0.43
26 0.36
27 0.31
28 0.26
29 0.21
30 0.22
31 0.21
32 0.22
33 0.2
34 0.21
35 0.23
36 0.2
37 0.19
38 0.17
39 0.17
40 0.17
41 0.16
42 0.15
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.11
48 0.13
49 0.12
50 0.13
51 0.17
52 0.22
53 0.24
54 0.26
55 0.26
56 0.29
57 0.34
58 0.42
59 0.45
60 0.43
61 0.44
62 0.45
63 0.49
64 0.5
65 0.5
66 0.48
67 0.44
68 0.47
69 0.46
70 0.44
71 0.37
72 0.3
73 0.28
74 0.24
75 0.25
76 0.19
77 0.19
78 0.18
79 0.2
80 0.2
81 0.18
82 0.16
83 0.12
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.14
93 0.18
94 0.2
95 0.25
96 0.31
97 0.35
98 0.37
99 0.39
100 0.39
101 0.37
102 0.37
103 0.32
104 0.31
105 0.26
106 0.24
107 0.22
108 0.22
109 0.22
110 0.21
111 0.21
112 0.18
113 0.19
114 0.22
115 0.2
116 0.21
117 0.2
118 0.19
119 0.19
120 0.16
121 0.14
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.16
144 0.17
145 0.16
146 0.17
147 0.2
148 0.23
149 0.2
150 0.2
151 0.17
152 0.19
153 0.24
154 0.24
155 0.23
156 0.19
157 0.18
158 0.19
159 0.18
160 0.17
161 0.16
162 0.19
163 0.17
164 0.19
165 0.2
166 0.2
167 0.21
168 0.23
169 0.21
170 0.22
171 0.23
172 0.27
173 0.26
174 0.26
175 0.3
176 0.29
177 0.29
178 0.25
179 0.25
180 0.21
181 0.21
182 0.2
183 0.17
184 0.16
185 0.14
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.09
192 0.07
193 0.1
194 0.13
195 0.14
196 0.17
197 0.22
198 0.31
199 0.41
200 0.51
201 0.58
202 0.67
203 0.76
204 0.83
205 0.89
206 0.88
207 0.9
208 0.91
209 0.87
210 0.82
211 0.78
212 0.74
213 0.68
214 0.64
215 0.54
216 0.47
217 0.39
218 0.36
219 0.28
220 0.22
221 0.16
222 0.16
223 0.16
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.14
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.08
235 0.08
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.08
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.11
286 0.12
287 0.11
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.16
296 0.17
297 0.19
298 0.19
299 0.22
300 0.24
301 0.26
302 0.27
303 0.26
304 0.29
305 0.3
306 0.33
307 0.3
308 0.28
309 0.28
310 0.29
311 0.25
312 0.25
313 0.27
314 0.3
315 0.31
316 0.29
317 0.32
318 0.29
319 0.28
320 0.25
321 0.2
322 0.16
323 0.15
324 0.15
325 0.12
326 0.14
327 0.17
328 0.18
329 0.18
330 0.17
331 0.19
332 0.19
333 0.2
334 0.28
335 0.27
336 0.34
337 0.41
338 0.49
339 0.53
340 0.61
341 0.67
342 0.67
343 0.71
344 0.72
345 0.72
346 0.7
347 0.68
348 0.64
349 0.59
350 0.54
351 0.52
352 0.45
353 0.39
354 0.33
355 0.34
356 0.3
357 0.28
358 0.26
359 0.21
360 0.2
361 0.2
362 0.2
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.15
370 0.15
371 0.15
372 0.14
373 0.12
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.08