Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q06168

Protein Details
Accession Q06168    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
385-422KEEIQKREIEKERNLRRLKRETDRLSRRGRRRLDDLETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
394-416EKERNLRRLKRETDRLSRRGRRR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017393  Sfh1/SNF5  
IPR006939  SNF5  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016586  C:RSC-type complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0031055  P:chromatin remodeling at centromere  
GO:0007059  P:chromosome segregation  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
GO:0006303  P:double-strand break repair via nonhomologous end joining  
GO:0000086  P:G2/M transition of mitotic cell cycle  
GO:0006337  P:nucleosome disassembly  
GO:1900461  P:positive regulation of pseudohyphal growth by positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter  
GO:0033262  P:regulation of nuclear cell cycle DNA replication  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG sce:YLR321C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MSHQNQLIPQAYISNFHNRLTNEDDGIPIFTMAQQTRQHKRAKVVNYAEYDNDLFDEFNMNGSNFNNADTHYKDNAVSHENTPALTNGVTMDGSEYNVLENMNGADSIISNNKYDAGSNMVVESLSGLNSNNNASNGPSNKAQAQDIGNAVLPDLQDQHHNPFNILRYPKIRDTFINGKVVSPYRLNTDQETKANANSGEAIMIPITLDIEHMGHTIKDQFLWNYNDDSISPEEFASIYCKDLDMTSATLQTQIANIIKEQLKDLENIAATEIMSDLHVIINLTCNLQDRFFEDNFQWNLNDKSLTPERFATSIVQDLGLTREFIPLISQSLHETILKIKKDWVDGHLIQDHVPNDAAFGYLSGIRLDIDELGSNWCPRVEILTKEEIQKREIEKERNLRRLKRETDRLSRRGRRRLDDLETTMRM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.31
4 0.36
5 0.32
6 0.37
7 0.39
8 0.39
9 0.32
10 0.31
11 0.31
12 0.26
13 0.27
14 0.22
15 0.16
16 0.13
17 0.11
18 0.17
19 0.16
20 0.22
21 0.28
22 0.36
23 0.45
24 0.52
25 0.59
26 0.58
27 0.66
28 0.68
29 0.68
30 0.7
31 0.68
32 0.68
33 0.64
34 0.61
35 0.54
36 0.48
37 0.41
38 0.31
39 0.25
40 0.18
41 0.13
42 0.11
43 0.13
44 0.1
45 0.11
46 0.13
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.17
51 0.14
52 0.15
53 0.14
54 0.14
55 0.19
56 0.21
57 0.26
58 0.24
59 0.26
60 0.25
61 0.27
62 0.29
63 0.29
64 0.29
65 0.24
66 0.27
67 0.26
68 0.25
69 0.24
70 0.2
71 0.17
72 0.14
73 0.13
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.08
95 0.11
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.06
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.16
123 0.17
124 0.19
125 0.2
126 0.2
127 0.22
128 0.23
129 0.22
130 0.2
131 0.2
132 0.19
133 0.18
134 0.17
135 0.16
136 0.14
137 0.13
138 0.11
139 0.09
140 0.07
141 0.08
142 0.07
143 0.1
144 0.12
145 0.17
146 0.19
147 0.2
148 0.2
149 0.21
150 0.23
151 0.26
152 0.26
153 0.25
154 0.26
155 0.31
156 0.36
157 0.36
158 0.35
159 0.3
160 0.36
161 0.4
162 0.39
163 0.4
164 0.35
165 0.33
166 0.33
167 0.34
168 0.28
169 0.21
170 0.19
171 0.18
172 0.21
173 0.22
174 0.22
175 0.27
176 0.27
177 0.28
178 0.31
179 0.26
180 0.23
181 0.24
182 0.21
183 0.15
184 0.13
185 0.11
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.04
202 0.05
203 0.07
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.13
209 0.16
210 0.16
211 0.16
212 0.17
213 0.16
214 0.15
215 0.17
216 0.13
217 0.11
218 0.11
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.08
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.07
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.13
245 0.15
246 0.15
247 0.16
248 0.16
249 0.16
250 0.16
251 0.17
252 0.15
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.07
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.18
278 0.18
279 0.2
280 0.18
281 0.25
282 0.26
283 0.26
284 0.24
285 0.21
286 0.23
287 0.22
288 0.22
289 0.14
290 0.2
291 0.26
292 0.27
293 0.26
294 0.27
295 0.27
296 0.27
297 0.28
298 0.23
299 0.18
300 0.19
301 0.17
302 0.15
303 0.13
304 0.13
305 0.14
306 0.13
307 0.12
308 0.1
309 0.11
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.15
320 0.14
321 0.14
322 0.19
323 0.25
324 0.26
325 0.25
326 0.29
327 0.31
328 0.36
329 0.37
330 0.34
331 0.35
332 0.35
333 0.39
334 0.37
335 0.34
336 0.3
337 0.31
338 0.28
339 0.21
340 0.2
341 0.15
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.09
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.13
360 0.15
361 0.15
362 0.15
363 0.15
364 0.14
365 0.13
366 0.19
367 0.2
368 0.23
369 0.27
370 0.34
371 0.37
372 0.44
373 0.5
374 0.46
375 0.43
376 0.45
377 0.44
378 0.47
379 0.53
380 0.53
381 0.56
382 0.65
383 0.73
384 0.76
385 0.81
386 0.8
387 0.81
388 0.83
389 0.83
390 0.83
391 0.84
392 0.83
393 0.85
394 0.87
395 0.86
396 0.87
397 0.88
398 0.87
399 0.87
400 0.86
401 0.83
402 0.81
403 0.81
404 0.78
405 0.76
406 0.73