Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53165

Protein Details
Accession P53165    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
202-228TPQTFSSSIKKQKKVKQRNPTEKHLIDHydrophilic
300-320KQIQKEQKKHTQQQKQGQRSKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013243  SCA7_dom  
IPR037804  SGF73  
IPR041251  Znf_C2H2_13  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0071819  C:DUBm complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0008047  F:enzyme activator activity  
GO:0005198  F:structural molecule activity  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0016573  P:histone acetylation  
GO:0016578  P:histone deubiquitination  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0045899  P:positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly  
GO:0065003  P:protein-containing complex assembly  
GO:0046822  P:regulation of nucleocytoplasmic transport  
GO:1905634  P:regulation of protein localization to chromatin  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:1904802  P:RITS complex assembly  
KEGG sce:YGL066W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08313  SCA7  
PF18508  zf_C2H2_13  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51505  SCA7  
Amino Acid Sequences MRSGDAEIKGIKPKVIEEYSLSQGSGPSNDSWKSLMSSAKDTPLQYDHMNRESLKKYFNPNAQLIEDPLDKPIQYRVCEKCGKPLALTAIVDHLENHCAGASGKSSTDPRDESTRETIRNGVESTGRNNNDDDNSNDNNNDDDDDDDNDDNEDDDDADDDDDNSNGANYKKNDSSFNPLKRSTSMESANTPNMDTKRSKTGTPQTFSSSIKKQKKVKQRNPTEKHLIDFNKQCGVELPEGGYCARSLTCKSHSMGAKRAVSGRSKPYDVLLADYHREHQTKIGAAAEKRAKQQELQKLQKQIQKEQKKHTQQQKQGQRSKQRNVNGGKSAKNGGKSTVHNGNNINEIGHVNLTPEEETTQVLNGVSRSFPLPLESTVLSSVRYRTKYFRMREMFASSFSVKPGYTSPGYGAIHSRVGCLDLDRTTDYKFRVRTPQPINHLTNQNLNPKQIQRLQQQRALQAQLLSQQQQQQQQQQQHHSPQAQAQASTQQPTQGMVPNHFPGGATNSSFNANVSSKQIQQQQQQQQHKSQDTGLTPLEIQSQQQKLRQQQLQQQKFEAAASYLANATKLMQESNQDSHLSGTHNNNSSKNGNNNLMTMKASISSPNTSVNSIQSPPSVNSVNGSGQGVSTGINVSGNNGRIEVGIGNSVNPYNGRIN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.33
4 0.31
5 0.35
6 0.38
7 0.38
8 0.35
9 0.27
10 0.26
11 0.26
12 0.22
13 0.2
14 0.17
15 0.21
16 0.22
17 0.23
18 0.23
19 0.22
20 0.23
21 0.24
22 0.27
23 0.25
24 0.3
25 0.32
26 0.36
27 0.38
28 0.36
29 0.37
30 0.34
31 0.34
32 0.33
33 0.38
34 0.38
35 0.38
36 0.42
37 0.39
38 0.43
39 0.45
40 0.45
41 0.43
42 0.42
43 0.47
44 0.52
45 0.58
46 0.57
47 0.55
48 0.56
49 0.52
50 0.48
51 0.42
52 0.38
53 0.33
54 0.26
55 0.25
56 0.22
57 0.19
58 0.19
59 0.25
60 0.26
61 0.27
62 0.35
63 0.38
64 0.44
65 0.53
66 0.52
67 0.55
68 0.57
69 0.56
70 0.49
71 0.48
72 0.45
73 0.41
74 0.41
75 0.31
76 0.26
77 0.24
78 0.23
79 0.2
80 0.16
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.15
92 0.17
93 0.2
94 0.24
95 0.24
96 0.26
97 0.32
98 0.34
99 0.36
100 0.42
101 0.45
102 0.42
103 0.42
104 0.42
105 0.36
106 0.37
107 0.33
108 0.27
109 0.25
110 0.25
111 0.28
112 0.33
113 0.33
114 0.31
115 0.31
116 0.32
117 0.31
118 0.32
119 0.31
120 0.28
121 0.3
122 0.3
123 0.29
124 0.27
125 0.24
126 0.22
127 0.19
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.16
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.13
137 0.12
138 0.1
139 0.09
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.08
153 0.09
154 0.14
155 0.16
156 0.21
157 0.25
158 0.27
159 0.32
160 0.32
161 0.41
162 0.44
163 0.5
164 0.51
165 0.49
166 0.49
167 0.46
168 0.48
169 0.42
170 0.39
171 0.35
172 0.32
173 0.34
174 0.35
175 0.36
176 0.31
177 0.28
178 0.27
179 0.24
180 0.26
181 0.25
182 0.25
183 0.31
184 0.33
185 0.33
186 0.37
187 0.46
188 0.5
189 0.51
190 0.5
191 0.45
192 0.47
193 0.49
194 0.46
195 0.44
196 0.46
197 0.51
198 0.57
199 0.61
200 0.66
201 0.75
202 0.81
203 0.83
204 0.83
205 0.86
206 0.89
207 0.87
208 0.86
209 0.85
210 0.75
211 0.66
212 0.63
213 0.55
214 0.5
215 0.48
216 0.42
217 0.37
218 0.36
219 0.34
220 0.29
221 0.29
222 0.23
223 0.19
224 0.18
225 0.13
226 0.14
227 0.14
228 0.12
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.1
234 0.14
235 0.17
236 0.21
237 0.21
238 0.27
239 0.31
240 0.33
241 0.38
242 0.4
243 0.38
244 0.36
245 0.39
246 0.36
247 0.35
248 0.36
249 0.36
250 0.33
251 0.32
252 0.31
253 0.28
254 0.29
255 0.26
256 0.24
257 0.19
258 0.17
259 0.17
260 0.17
261 0.19
262 0.19
263 0.2
264 0.17
265 0.17
266 0.18
267 0.18
268 0.18
269 0.19
270 0.19
271 0.18
272 0.25
273 0.27
274 0.28
275 0.3
276 0.32
277 0.29
278 0.3
279 0.37
280 0.4
281 0.45
282 0.5
283 0.51
284 0.54
285 0.59
286 0.58
287 0.53
288 0.52
289 0.52
290 0.55
291 0.56
292 0.6
293 0.64
294 0.7
295 0.76
296 0.77
297 0.76
298 0.75
299 0.78
300 0.8
301 0.8
302 0.79
303 0.78
304 0.78
305 0.77
306 0.76
307 0.73
308 0.68
309 0.66
310 0.62
311 0.6
312 0.57
313 0.52
314 0.47
315 0.41
316 0.4
317 0.34
318 0.33
319 0.28
320 0.23
321 0.24
322 0.23
323 0.26
324 0.31
325 0.31
326 0.3
327 0.31
328 0.3
329 0.28
330 0.27
331 0.22
332 0.13
333 0.12
334 0.1
335 0.09
336 0.08
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.12
361 0.11
362 0.11
363 0.12
364 0.12
365 0.11
366 0.11
367 0.14
368 0.17
369 0.19
370 0.21
371 0.24
372 0.33
373 0.41
374 0.43
375 0.5
376 0.49
377 0.49
378 0.5
379 0.52
380 0.44
381 0.36
382 0.36
383 0.28
384 0.24
385 0.22
386 0.2
387 0.13
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.13
392 0.13
393 0.14
394 0.19
395 0.19
396 0.19
397 0.19
398 0.17
399 0.19
400 0.19
401 0.18
402 0.12
403 0.13
404 0.12
405 0.11
406 0.12
407 0.09
408 0.11
409 0.13
410 0.14
411 0.15
412 0.18
413 0.19
414 0.23
415 0.24
416 0.26
417 0.34
418 0.37
419 0.45
420 0.5
421 0.55
422 0.56
423 0.62
424 0.62
425 0.58
426 0.59
427 0.51
428 0.51
429 0.48
430 0.5
431 0.45
432 0.43
433 0.41
434 0.38
435 0.43
436 0.41
437 0.44
438 0.44
439 0.52
440 0.55
441 0.57
442 0.58
443 0.56
444 0.55
445 0.49
446 0.41
447 0.31
448 0.27
449 0.26
450 0.26
451 0.23
452 0.21
453 0.25
454 0.28
455 0.34
456 0.38
457 0.41
458 0.45
459 0.5
460 0.55
461 0.56
462 0.59
463 0.58
464 0.6
465 0.53
466 0.49
467 0.45
468 0.46
469 0.4
470 0.34
471 0.29
472 0.29
473 0.29
474 0.29
475 0.26
476 0.2
477 0.19
478 0.2
479 0.21
480 0.2
481 0.21
482 0.21
483 0.25
484 0.23
485 0.23
486 0.22
487 0.2
488 0.15
489 0.19
490 0.18
491 0.15
492 0.15
493 0.16
494 0.18
495 0.18
496 0.17
497 0.16
498 0.15
499 0.15
500 0.2
501 0.22
502 0.23
503 0.28
504 0.36
505 0.38
506 0.44
507 0.53
508 0.57
509 0.64
510 0.71
511 0.71
512 0.7
513 0.72
514 0.68
515 0.6
516 0.53
517 0.49
518 0.41
519 0.4
520 0.33
521 0.26
522 0.23
523 0.22
524 0.23
525 0.18
526 0.18
527 0.21
528 0.27
529 0.3
530 0.35
531 0.41
532 0.44
533 0.53
534 0.57
535 0.57
536 0.6
537 0.67
538 0.71
539 0.67
540 0.61
541 0.54
542 0.49
543 0.42
544 0.34
545 0.24
546 0.17
547 0.14
548 0.13
549 0.13
550 0.12
551 0.12
552 0.11
553 0.11
554 0.12
555 0.13
556 0.13
557 0.13
558 0.17
559 0.22
560 0.25
561 0.26
562 0.24
563 0.23
564 0.23
565 0.24
566 0.22
567 0.23
568 0.27
569 0.31
570 0.37
571 0.4
572 0.41
573 0.44
574 0.45
575 0.47
576 0.47
577 0.46
578 0.46
579 0.44
580 0.44
581 0.41
582 0.39
583 0.33
584 0.27
585 0.21
586 0.16
587 0.16
588 0.17
589 0.19
590 0.2
591 0.21
592 0.26
593 0.27
594 0.28
595 0.28
596 0.29
597 0.29
598 0.28
599 0.28
600 0.25
601 0.26
602 0.26
603 0.29
604 0.27
605 0.23
606 0.24
607 0.25
608 0.24
609 0.23
610 0.22
611 0.18
612 0.15
613 0.15
614 0.14
615 0.11
616 0.1
617 0.09
618 0.08
619 0.09
620 0.09
621 0.12
622 0.17
623 0.19
624 0.19
625 0.18
626 0.18
627 0.17
628 0.19
629 0.16
630 0.13
631 0.14
632 0.14
633 0.14
634 0.16
635 0.16
636 0.16
637 0.16