Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40962

Protein Details
Accession P40962    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
206-232QVTFHGNGRVNKKKKKVPPRKDGIKFRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
214-232RVNKKKKKVPPRKDGIKFR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019447  DNA/RNA-bd_Kin17_WH-like_dom  
IPR037321  KIN17-like  
IPR038254  KIN17_WH-like_sf  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0022613  P:ribonucleoprotein complex biogenesis  
KEGG sce:YOR077W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10357  Kin17_mid  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MADYDSAKYWSKQGARRGLQKTRYYCQICQRQCKDANGFQSHNKSPSHLRKISQVTAEDARRYNIQFEKGFLQLLKQRHGEKWIDANKVYNEYVQDRDHVHMNATMHRSLTQFVRYLGRAGKVDVDMDIDDTSENVEGPLLIRIHPSSLSSPSEDGMLRSQQEEQEVIAAELLKRQLNRAKRQTEKVYQPEMKSEISGDSTLKRVQVTFHGNGRVNKKKKKVPPRKDGIKFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.59
3 0.68
4 0.73
5 0.74
6 0.76
7 0.78
8 0.75
9 0.7
10 0.73
11 0.69
12 0.66
13 0.67
14 0.69
15 0.68
16 0.72
17 0.72
18 0.71
19 0.7
20 0.72
21 0.69
22 0.65
23 0.65
24 0.61
25 0.59
26 0.57
27 0.59
28 0.55
29 0.52
30 0.46
31 0.41
32 0.44
33 0.51
34 0.54
35 0.51
36 0.49
37 0.54
38 0.6
39 0.61
40 0.55
41 0.46
42 0.41
43 0.42
44 0.43
45 0.38
46 0.32
47 0.3
48 0.28
49 0.27
50 0.28
51 0.26
52 0.29
53 0.26
54 0.27
55 0.28
56 0.26
57 0.27
58 0.21
59 0.21
60 0.21
61 0.23
62 0.26
63 0.27
64 0.29
65 0.29
66 0.35
67 0.33
68 0.3
69 0.36
70 0.37
71 0.37
72 0.34
73 0.36
74 0.32
75 0.34
76 0.31
77 0.23
78 0.19
79 0.18
80 0.21
81 0.18
82 0.19
83 0.17
84 0.18
85 0.2
86 0.18
87 0.16
88 0.15
89 0.16
90 0.18
91 0.19
92 0.18
93 0.16
94 0.17
95 0.16
96 0.15
97 0.16
98 0.14
99 0.12
100 0.13
101 0.15
102 0.14
103 0.15
104 0.15
105 0.16
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.12
110 0.12
111 0.1
112 0.1
113 0.07
114 0.08
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.1
135 0.13
136 0.15
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.16
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.14
145 0.13
146 0.14
147 0.15
148 0.14
149 0.15
150 0.14
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.09
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.16
163 0.23
164 0.31
165 0.41
166 0.49
167 0.56
168 0.61
169 0.7
170 0.74
171 0.76
172 0.76
173 0.74
174 0.74
175 0.7
176 0.64
177 0.61
178 0.55
179 0.47
180 0.38
181 0.32
182 0.24
183 0.21
184 0.21
185 0.17
186 0.16
187 0.18
188 0.19
189 0.2
190 0.19
191 0.17
192 0.18
193 0.24
194 0.3
195 0.32
196 0.36
197 0.41
198 0.46
199 0.51
200 0.59
201 0.62
202 0.64
203 0.68
204 0.72
205 0.75
206 0.8
207 0.86
208 0.88
209 0.88
210 0.9
211 0.91
212 0.93