Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38852

Protein Details
Accession P38852    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MKYTQYPNSSKLKRNSDRREHDEKLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-87KRKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0005682  C:U5 snRNP  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG sce:YHR156C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MKYTQYPNSSKLKRNSDRREHDEKLSDELHNQSTIYEDEELSRAEYDSDSDSSVEDSTDNENSGKEMDEKSYEKNEDHVEDHRKRKKSKIQLLDIAEFKKENLADLDYQIGNSESKVEKGVNIEPFNIDDEIKHGVFDKDGNYIKTENATENDQQDNEEWMNDVINTEEVNRLEKEQSVKTQNSRHYMVHEALNLLKFFLVDENETVLESLGRLNKLRKIAISKKNKSLKYVIHGIELLSDLINILEKKGFSEVYEYNRLKVQDAIEEEIFDDSSRIVNHKTKLWGFKWLNKLDEYHGLYTNYEMSYWQKSYFKNSVIVKFHSEPDRDENWIHVSCLSFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.85
3 0.86
4 0.88
5 0.87
6 0.87
7 0.81
8 0.79
9 0.76
10 0.67
11 0.61
12 0.55
13 0.47
14 0.41
15 0.41
16 0.35
17 0.28
18 0.26
19 0.2
20 0.19
21 0.19
22 0.18
23 0.15
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.16
28 0.15
29 0.15
30 0.12
31 0.12
32 0.11
33 0.11
34 0.13
35 0.14
36 0.13
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.09
43 0.09
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.13
50 0.14
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.19
56 0.21
57 0.24
58 0.3
59 0.31
60 0.29
61 0.31
62 0.32
63 0.3
64 0.31
65 0.34
66 0.38
67 0.43
68 0.53
69 0.58
70 0.62
71 0.64
72 0.71
73 0.74
74 0.75
75 0.78
76 0.78
77 0.77
78 0.77
79 0.78
80 0.72
81 0.65
82 0.55
83 0.46
84 0.36
85 0.27
86 0.23
87 0.18
88 0.14
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.18
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.12
98 0.1
99 0.09
100 0.12
101 0.09
102 0.1
103 0.12
104 0.11
105 0.12
106 0.15
107 0.2
108 0.22
109 0.23
110 0.22
111 0.21
112 0.22
113 0.22
114 0.2
115 0.15
116 0.09
117 0.1
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.11
126 0.14
127 0.16
128 0.16
129 0.17
130 0.17
131 0.17
132 0.18
133 0.18
134 0.14
135 0.13
136 0.16
137 0.16
138 0.18
139 0.19
140 0.17
141 0.17
142 0.16
143 0.16
144 0.13
145 0.11
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.07
156 0.07
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.13
162 0.15
163 0.15
164 0.2
165 0.23
166 0.26
167 0.29
168 0.34
169 0.38
170 0.39
171 0.4
172 0.36
173 0.33
174 0.34
175 0.31
176 0.27
177 0.23
178 0.19
179 0.17
180 0.18
181 0.15
182 0.12
183 0.1
184 0.08
185 0.07
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.05
197 0.07
198 0.08
199 0.1
200 0.12
201 0.14
202 0.18
203 0.22
204 0.23
205 0.24
206 0.3
207 0.39
208 0.47
209 0.55
210 0.57
211 0.64
212 0.71
213 0.7
214 0.65
215 0.62
216 0.57
217 0.51
218 0.54
219 0.45
220 0.39
221 0.37
222 0.33
223 0.27
224 0.23
225 0.17
226 0.09
227 0.07
228 0.05
229 0.05
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.11
237 0.12
238 0.1
239 0.15
240 0.18
241 0.22
242 0.32
243 0.32
244 0.31
245 0.34
246 0.35
247 0.3
248 0.3
249 0.26
250 0.21
251 0.23
252 0.26
253 0.23
254 0.23
255 0.22
256 0.19
257 0.18
258 0.13
259 0.1
260 0.06
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.15
265 0.21
266 0.23
267 0.28
268 0.35
269 0.39
270 0.47
271 0.46
272 0.52
273 0.51
274 0.57
275 0.61
276 0.59
277 0.56
278 0.5
279 0.5
280 0.44
281 0.47
282 0.43
283 0.37
284 0.35
285 0.33
286 0.31
287 0.3
288 0.29
289 0.21
290 0.17
291 0.15
292 0.16
293 0.21
294 0.22
295 0.25
296 0.28
297 0.29
298 0.38
299 0.43
300 0.42
301 0.44
302 0.49
303 0.53
304 0.53
305 0.55
306 0.54
307 0.5
308 0.53
309 0.53
310 0.49
311 0.44
312 0.46
313 0.46
314 0.42
315 0.4
316 0.37
317 0.36
318 0.35
319 0.32
320 0.26