FuNGI

P38688

Protein Details

Accession

P38688

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
545-576	AVSKVQKRKVLELKKKRKIKRLEKFLQGRDTS	Hydrophilic
582-609	ERWLPLRDRSTYRPKKKQQGAKQTQGGA	Hydrophilic
617-640	ALDISKKGKPTVNKKPKNKKKGRK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
540-570	RSKNTAVSKVQKRKVLELKKKRKIKRLEKFL
592-603	TYRPKKKQQGAK
612-613	KK
619-640	DISKKGKPTVNKKPKNKKKGRK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 12.5, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005789 C:endoplasmic reticulum membrane GO:0005730 C:nucleolus GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane GO:0006617 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition
KEGG	sce:YPL210C -
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72
PROSITE	View protein in PROSITE PS50293 TPR_REGION

Amino Acid Sequences

MAKDNLTNLLSQLNIQLSQDEHSQVEQTCVKLLDSGCENPADVFRRCLVAVIQQDKYQKALHYLKKFKHIDDKYGRKFALEKLYIFYKLNMPDEFNTLYTAIITDDLDTVLKKDIESLRGILHVRAQYCYKNGLYQEAFKIYQHLASHNEKDQDSQIELSCNERVPLSVATELMNRSPLVTPMDESSYDLLFNESFIMASVGKYDKAIELLEKALQGATNEGYQNDINTIKLQLSFVLQMVGKTAQSKEILKGLLQELKADSPFSLICQNNLNAFVDFSKYNTNFNLLLRELNVEKLNTFNLQTFTHEQWSNIQRNVLFLRLFNNVKIHSQESLLSRTFDKYSKLVDNVTLESYKTQAKKLYHHTTKTILSGTDGSTIGILLLTIQLLIIEKEWENAIRIGELFLNESWKSSFEKFNDSQAIVCYILFELYKIKGRNNSKSVLLKKLGSVRVQLSGKIQENIPFWKHVGFELLSMGNAKESKALLREISNFSKGDADVLVDRVVSSDSLDIAQGIDLVRDIDIDKLIQLGVKPLESSAKRSKNTAVSKVQKRKVLELKKKRKIKRLEKFLQGRDTSKLPDPERWLPLRDRSTYRPKKKQQGAKQTQGGAMNKKSEQALDISKKGKPTVNKKPKNKKKGRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.16
3	0.17
4	0.16
5	0.18
6	0.21
7	0.19
8	0.18
9	0.18
10	0.21
11	0.2
12	0.25
13	0.25
14	0.23
15	0.24
16	0.23
17	0.22
18	0.23
19	0.23
20	0.23
21	0.24
22	0.26
23	0.25
24	0.24
25	0.25
26	0.21
27	0.27
28	0.27
29	0.24
30	0.25
31	0.24
32	0.26
33	0.26
34	0.26
35	0.22
36	0.25
37	0.32
38	0.34
39	0.35
40	0.37
41	0.41
42	0.4
43	0.42
44	0.37
45	0.3
46	0.34
47	0.41
48	0.46
49	0.52
50	0.61
51	0.63
52	0.7
53	0.72
54	0.68
55	0.69
56	0.64
57	0.64
58	0.66
59	0.71
60	0.69
61	0.73
62	0.68
63	0.59
64	0.58
65	0.54
66	0.54
67	0.46
68	0.4
69	0.36
70	0.4
71	0.41
72	0.39
73	0.34
74	0.29
75	0.3
76	0.33
77	0.3
78	0.3
79	0.28
80	0.32
81	0.31
82	0.26
83	0.23
84	0.19
85	0.18
86	0.14
87	0.13
88	0.09
89	0.08
90	0.08
91	0.07
92	0.07
93	0.08
94	0.08
95	0.08
96	0.09
97	0.12
98	0.12
99	0.11
100	0.17
101	0.2
102	0.22
103	0.24
104	0.24
105	0.22
106	0.26
107	0.27
108	0.21
109	0.23
110	0.24
111	0.23
112	0.24
113	0.26
114	0.25
115	0.26
116	0.3
117	0.25
118	0.26
119	0.26
120	0.31
121	0.3
122	0.31
123	0.32
124	0.32
125	0.32
126	0.27
127	0.3
128	0.23
129	0.25
130	0.22
131	0.22
132	0.23
133	0.28
134	0.32
135	0.33
136	0.37
137	0.33
138	0.34
139	0.34
140	0.31
141	0.27
142	0.25
143	0.21
144	0.2
145	0.2
146	0.21
147	0.2
148	0.17
149	0.16
150	0.14
151	0.13
152	0.14
153	0.14
154	0.14
155	0.13
156	0.13
157	0.13
158	0.15
159	0.16
160	0.13
161	0.14
162	0.11
163	0.12
164	0.12
165	0.13
166	0.14
167	0.14
168	0.14
169	0.14
170	0.17
171	0.15
172	0.16
173	0.16
174	0.13
175	0.12
176	0.11
177	0.11
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.07
185	0.06
186	0.06
187	0.08
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.1
192	0.09
193	0.1
194	0.1
195	0.09
196	0.09
197	0.1
198	0.11
199	0.1
200	0.1
201	0.09
202	0.09
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.09
215	0.1
216	0.11
217	0.09
218	0.1
219	0.1
220	0.08
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.1
225	0.09
226	0.09
227	0.1
228	0.1
229	0.09
230	0.1
231	0.1
232	0.11
233	0.13
234	0.15
235	0.15
236	0.17
237	0.17
238	0.16
239	0.18
240	0.17
241	0.19
242	0.18
243	0.17
244	0.15
245	0.16
246	0.16
247	0.14
248	0.11
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.15
253	0.14
254	0.15
255	0.17
256	0.18
257	0.18
258	0.19
259	0.19
260	0.12
261	0.12
262	0.11
263	0.11
264	0.1
265	0.1
266	0.15
267	0.15
268	0.16
269	0.16
270	0.19
271	0.18
272	0.18
273	0.21
274	0.14
275	0.14
276	0.13
277	0.15
278	0.12
279	0.13
280	0.14
281	0.11
282	0.1
283	0.11
284	0.11
285	0.1
286	0.1
287	0.1
288	0.11
289	0.11
290	0.14
291	0.17
292	0.18
293	0.21
294	0.21
295	0.19
296	0.23
297	0.29
298	0.29
299	0.27
300	0.27
301	0.22
302	0.24
303	0.25
304	0.21
305	0.15
306	0.12
307	0.14
308	0.17
309	0.17
310	0.16
311	0.17
312	0.16
313	0.17
314	0.19
315	0.17
316	0.14
317	0.14
318	0.16
319	0.16
320	0.18
321	0.18
322	0.17
323	0.16
324	0.17
325	0.18
326	0.17
327	0.17
328	0.15
329	0.18
330	0.19
331	0.2
332	0.19
333	0.19
334	0.19
335	0.18
336	0.18
337	0.15
338	0.12
339	0.11
340	0.12
341	0.15
342	0.14
343	0.15
344	0.19
345	0.22
346	0.27
347	0.36
348	0.45
349	0.48
350	0.49
351	0.5
352	0.48
353	0.47
354	0.43
355	0.35
356	0.25
357	0.19
358	0.18
359	0.16
360	0.14
361	0.13
362	0.11
363	0.09
364	0.09
365	0.08
366	0.06
367	0.05
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.02
372	0.02
373	0.03
374	0.03
375	0.03
376	0.04
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.09
384	0.09
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.09
389	0.09
390	0.09
391	0.08
392	0.11
393	0.1
394	0.11
395	0.11
396	0.12
397	0.14
398	0.15
399	0.21
400	0.19
401	0.27
402	0.28
403	0.32
404	0.34
405	0.32
406	0.3
407	0.25
408	0.26
409	0.18
410	0.17
411	0.12
412	0.09
413	0.09
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.09
418	0.16
419	0.16
420	0.19
421	0.27
422	0.34
423	0.42
424	0.44
425	0.45
426	0.45
427	0.52
428	0.53
429	0.52
430	0.48
431	0.4
432	0.4
433	0.45
434	0.43
435	0.36
436	0.35
437	0.3
438	0.34
439	0.33
440	0.31
441	0.27
442	0.29
443	0.3
444	0.28
445	0.27
446	0.25
447	0.26
448	0.3
449	0.29
450	0.24
451	0.22
452	0.23
453	0.23
454	0.18
455	0.2
456	0.15
457	0.14
458	0.15
459	0.14
460	0.13
461	0.13
462	0.12
463	0.11
464	0.1
465	0.1
466	0.1
467	0.1
468	0.12
469	0.14
470	0.16
471	0.16
472	0.18
473	0.23
474	0.27
475	0.3
476	0.31
477	0.29
478	0.27
479	0.28
480	0.25
481	0.21
482	0.16
483	0.14
484	0.11
485	0.13
486	0.12
487	0.09
488	0.09
489	0.09
490	0.09
491	0.07
492	0.07
493	0.06
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.05
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.07
508	0.07
509	0.07
510	0.08
511	0.07
512	0.07
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.11
517	0.12
518	0.12
519	0.12
520	0.13
521	0.21
522	0.21
523	0.28
524	0.34
525	0.42
526	0.43
527	0.46
528	0.51
529	0.53
530	0.59
531	0.6
532	0.6
533	0.62
534	0.71
535	0.79
536	0.79
537	0.75
538	0.71
539	0.72
540	0.72
541	0.73
542	0.74
543	0.75
544	0.8
545	0.84
546	0.91
547	0.9
548	0.89
549	0.89
550	0.89
551	0.89
552	0.89
553	0.88
554	0.88
555	0.89
556	0.86
557	0.85
558	0.77
559	0.69
560	0.62
561	0.56
562	0.5
563	0.47
564	0.48
565	0.42
566	0.45
567	0.5
568	0.53
569	0.57
570	0.57
571	0.55
572	0.52
573	0.58
574	0.58
575	0.57
576	0.56
577	0.57
578	0.65
579	0.71
580	0.76
581	0.78
582	0.82
583	0.86
584	0.9
585	0.92
586	0.91
587	0.92
588	0.91
589	0.9
590	0.87
591	0.8
592	0.74
593	0.7
594	0.65
595	0.61
596	0.56
597	0.51
598	0.45
599	0.44
600	0.41
601	0.35
602	0.31
603	0.29
604	0.34
605	0.35
606	0.41
607	0.41
608	0.42
609	0.45
610	0.48
611	0.49
612	0.49
613	0.53
614	0.58
615	0.66
616	0.74
617	0.81
618	0.88
619	0.93
620	0.95

P38688

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer