Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38205

Protein Details
Accession P38205    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MARRKNFKKGNKKTFGARDDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-12KNFKKGNK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.166, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018314  Fmu/NOL1/Nop2p_CS  
IPR001678  MeTrfase_RsmB/NOP2  
IPR023267  RCMT  
IPR023270  RCMT_NCL1  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016428  F:tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
GO:0006400  P:tRNA modification  
GO:0002127  P:tRNA wobble base cytosine methylation  
KEGG sce:YBL024W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01189  Methyltr_RsmB-F  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01153  NOL1_NOP2_SUN  
PS51686  SAM_MT_RSMB_NOP  
Amino Acid Sequences MARRKNFKKGNKKTFGARDDSRAQKNWSELVKENEKWEKYYKTLALFPEDQWEEFKKTCQAPLPLTFRITGSRKHAGEVLNLFKERHLPNLTNVEFEGEKIKAPVELPWYPDHLAWQLDVPKTVIRKNEQFAKTQRFLVVENAVGNISRQEAVSMIPPIVLEVKPHHTVLDMCAAPGSKTAQLIEALHKDTDEPSGFVVANDADARRSHMLVHQLKRLNSANLMVVNHDAQFFPRIRLHGNSNNKNDVLKFDRILCDVPCSGDGTMRKNVNVWKDWNTQAGLGLHAVQLNILNRGLHLLKNNGRLVYSTCSLNPIENEAVVAEALRKWGDKIRLVNCDDKLPGLIRSKGVSKWPVYDRNLTEKTKGDEGTLDSFFSPSEEEASKFNLQNCMRVYPHQQNTGGFFITVFEKVEDSTEAATEKLSSETPALESEGPQTKKIKVEEVQKKERLPRDANEEPFVFVDPQHEALKVCWDFYGIDNIFDRNTCLVRNATGEPTRVVYTVCPALKDVIQANDDRLKIIYSGVKLFVSQRSDIECSWRIQSESLPIMKHHMKSNRIVEANLEMLKHLLIESFPNFDDIRSKNIDNDFVEKMTKLSSGCAFIDVSRNDPAKENLFLPVWKGNKCINLMVCKEDTHELLYRIFGIDANAKATPSAEEKEKEKETTESPAETTTGTSTEAPSAAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.81
3 0.78
4 0.71
5 0.67
6 0.66
7 0.7
8 0.67
9 0.62
10 0.6
11 0.56
12 0.56
13 0.55
14 0.51
15 0.48
16 0.46
17 0.49
18 0.54
19 0.51
20 0.55
21 0.57
22 0.54
23 0.53
24 0.54
25 0.52
26 0.47
27 0.53
28 0.5
29 0.45
30 0.48
31 0.47
32 0.47
33 0.44
34 0.41
35 0.42
36 0.39
37 0.35
38 0.34
39 0.35
40 0.33
41 0.31
42 0.35
43 0.33
44 0.34
45 0.38
46 0.41
47 0.42
48 0.44
49 0.51
50 0.54
51 0.49
52 0.49
53 0.45
54 0.39
55 0.41
56 0.38
57 0.36
58 0.36
59 0.42
60 0.41
61 0.41
62 0.45
63 0.38
64 0.41
65 0.42
66 0.41
67 0.38
68 0.39
69 0.38
70 0.34
71 0.4
72 0.34
73 0.36
74 0.35
75 0.32
76 0.36
77 0.46
78 0.46
79 0.4
80 0.39
81 0.34
82 0.28
83 0.27
84 0.25
85 0.15
86 0.16
87 0.15
88 0.15
89 0.13
90 0.14
91 0.16
92 0.19
93 0.21
94 0.23
95 0.25
96 0.29
97 0.28
98 0.28
99 0.27
100 0.23
101 0.21
102 0.19
103 0.2
104 0.22
105 0.22
106 0.22
107 0.21
108 0.22
109 0.25
110 0.28
111 0.3
112 0.32
113 0.37
114 0.42
115 0.51
116 0.5
117 0.54
118 0.58
119 0.61
120 0.57
121 0.53
122 0.5
123 0.42
124 0.4
125 0.37
126 0.31
127 0.24
128 0.21
129 0.19
130 0.17
131 0.15
132 0.14
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.11
141 0.12
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.12
147 0.12
148 0.11
149 0.13
150 0.18
151 0.21
152 0.21
153 0.2
154 0.19
155 0.2
156 0.2
157 0.24
158 0.18
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.16
163 0.17
164 0.17
165 0.11
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.14
170 0.15
171 0.18
172 0.19
173 0.2
174 0.19
175 0.18
176 0.18
177 0.17
178 0.19
179 0.16
180 0.13
181 0.11
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.15
197 0.25
198 0.32
199 0.36
200 0.39
201 0.42
202 0.43
203 0.47
204 0.46
205 0.38
206 0.31
207 0.29
208 0.23
209 0.21
210 0.21
211 0.16
212 0.15
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.1
217 0.09
218 0.13
219 0.13
220 0.15
221 0.17
222 0.17
223 0.2
224 0.23
225 0.29
226 0.33
227 0.43
228 0.48
229 0.51
230 0.53
231 0.5
232 0.48
233 0.42
234 0.38
235 0.33
236 0.28
237 0.24
238 0.23
239 0.25
240 0.25
241 0.26
242 0.21
243 0.19
244 0.16
245 0.16
246 0.14
247 0.14
248 0.12
249 0.14
250 0.16
251 0.17
252 0.23
253 0.23
254 0.22
255 0.23
256 0.27
257 0.28
258 0.3
259 0.29
260 0.3
261 0.34
262 0.35
263 0.35
264 0.32
265 0.27
266 0.25
267 0.22
268 0.16
269 0.12
270 0.11
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.06
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.16
286 0.2
287 0.26
288 0.28
289 0.26
290 0.25
291 0.24
292 0.25
293 0.23
294 0.2
295 0.15
296 0.13
297 0.16
298 0.16
299 0.16
300 0.13
301 0.13
302 0.12
303 0.11
304 0.11
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.1
316 0.14
317 0.17
318 0.23
319 0.27
320 0.33
321 0.36
322 0.39
323 0.36
324 0.34
325 0.31
326 0.25
327 0.21
328 0.15
329 0.17
330 0.15
331 0.16
332 0.15
333 0.16
334 0.18
335 0.18
336 0.21
337 0.21
338 0.2
339 0.24
340 0.28
341 0.34
342 0.34
343 0.38
344 0.37
345 0.41
346 0.46
347 0.41
348 0.39
349 0.35
350 0.34
351 0.32
352 0.3
353 0.22
354 0.18
355 0.19
356 0.2
357 0.18
358 0.16
359 0.12
360 0.12
361 0.11
362 0.1
363 0.09
364 0.05
365 0.07
366 0.08
367 0.09
368 0.1
369 0.14
370 0.16
371 0.18
372 0.19
373 0.25
374 0.24
375 0.28
376 0.28
377 0.28
378 0.26
379 0.27
380 0.32
381 0.33
382 0.37
383 0.37
384 0.37
385 0.34
386 0.37
387 0.36
388 0.29
389 0.2
390 0.16
391 0.12
392 0.12
393 0.11
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.06
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.1
416 0.09
417 0.09
418 0.13
419 0.2
420 0.21
421 0.23
422 0.24
423 0.25
424 0.3
425 0.31
426 0.33
427 0.3
428 0.4
429 0.47
430 0.54
431 0.6
432 0.59
433 0.62
434 0.63
435 0.64
436 0.6
437 0.55
438 0.49
439 0.5
440 0.52
441 0.51
442 0.48
443 0.42
444 0.36
445 0.32
446 0.29
447 0.21
448 0.14
449 0.13
450 0.11
451 0.13
452 0.13
453 0.14
454 0.13
455 0.13
456 0.21
457 0.19
458 0.18
459 0.15
460 0.15
461 0.16
462 0.16
463 0.25
464 0.17
465 0.18
466 0.19
467 0.19
468 0.19
469 0.18
470 0.18
471 0.11
472 0.12
473 0.11
474 0.13
475 0.13
476 0.14
477 0.17
478 0.18
479 0.22
480 0.23
481 0.24
482 0.22
483 0.24
484 0.23
485 0.2
486 0.19
487 0.13
488 0.14
489 0.19
490 0.19
491 0.17
492 0.17
493 0.18
494 0.19
495 0.21
496 0.2
497 0.17
498 0.18
499 0.18
500 0.21
501 0.24
502 0.24
503 0.22
504 0.2
505 0.17
506 0.15
507 0.17
508 0.18
509 0.15
510 0.16
511 0.17
512 0.17
513 0.17
514 0.19
515 0.22
516 0.22
517 0.21
518 0.21
519 0.24
520 0.26
521 0.26
522 0.3
523 0.28
524 0.26
525 0.28
526 0.28
527 0.25
528 0.23
529 0.24
530 0.24
531 0.26
532 0.27
533 0.25
534 0.24
535 0.29
536 0.34
537 0.35
538 0.37
539 0.39
540 0.41
541 0.48
542 0.54
543 0.55
544 0.51
545 0.49
546 0.43
547 0.38
548 0.37
549 0.31
550 0.24
551 0.16
552 0.15
553 0.15
554 0.13
555 0.1
556 0.07
557 0.06
558 0.1
559 0.11
560 0.13
561 0.14
562 0.16
563 0.16
564 0.16
565 0.23
566 0.21
567 0.25
568 0.27
569 0.28
570 0.31
571 0.34
572 0.39
573 0.34
574 0.37
575 0.33
576 0.3
577 0.31
578 0.25
579 0.23
580 0.19
581 0.19
582 0.15
583 0.16
584 0.17
585 0.19
586 0.19
587 0.2
588 0.2
589 0.19
590 0.26
591 0.24
592 0.24
593 0.27
594 0.29
595 0.28
596 0.31
597 0.34
598 0.3
599 0.31
600 0.29
601 0.26
602 0.27
603 0.26
604 0.27
605 0.3
606 0.3
607 0.29
608 0.32
609 0.33
610 0.36
611 0.39
612 0.41
613 0.39
614 0.43
615 0.43
616 0.45
617 0.42
618 0.37
619 0.37
620 0.34
621 0.3
622 0.27
623 0.28
624 0.25
625 0.24
626 0.24
627 0.22
628 0.2
629 0.19
630 0.15
631 0.14
632 0.17
633 0.17
634 0.2
635 0.19
636 0.18
637 0.18
638 0.18
639 0.19
640 0.18
641 0.21
642 0.24
643 0.27
644 0.31
645 0.39
646 0.43
647 0.42
648 0.4
649 0.41
650 0.37
651 0.42
652 0.43
653 0.37
654 0.33
655 0.33
656 0.3
657 0.27
658 0.25
659 0.18
660 0.15
661 0.16
662 0.15
663 0.15
664 0.17