Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q04418

Protein Details
Accession Q04418    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-71PELYKPKKISSWKERLREKRAQKKKTSGKDAEKQQTSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-61KPKKISSWKERLREKRAQKKKTSG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013929  RNA_pol_II_AP1_C  
IPR013930  RNA_pol_II_AP1_N  
IPR039913  RPAP1/Rba50  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YDR527W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08620  RPAP1_C  
PF08621  RPAP1_N  
Amino Acid Sequences MDLLGDIVEKDTSDSVESNDNGTLSTNNCGTGFPELYKPKKISSWKERLREKRAQKKKTSGKDAEKQQTSTDAPLSEAKSIHNENIKVLQGMSDEQIVQEREDLYNSLDPKLIAKLLKNINKRAKDENNTPLFAEIEGASGTWVGGNKQGIYDLPPLDDEDVDVALEIRPMLGKDAKHVQFEEAGKEKDVEEEAKTNDDVDDIAPLDFQMAQCIDHMKNEELFKDVHFIKEESQNEINLEKLDINDPNFNDKLHEKYFPDLPKEVDKLKWMQPVQQKTDKNYIIEDVSECRFDFNGDLVPPTRQIDSTIHSGLHHHSDSPELAGYTIVELEHLARSTFPSQRCIAIQTLGRILYKLGQKSYYQLVPEIDADTYKEDGSISNVMDKIYSMFWDLIKDGKVIESLEISSDEKFTRNLSVRNYAIDALWLWKQGGGDFRTKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.19
4 0.2
5 0.2
6 0.21
7 0.19
8 0.18
9 0.18
10 0.18
11 0.14
12 0.17
13 0.16
14 0.16
15 0.16
16 0.16
17 0.16
18 0.2
19 0.21
20 0.19
21 0.27
22 0.34
23 0.38
24 0.46
25 0.46
26 0.44
27 0.5
28 0.58
29 0.6
30 0.63
31 0.69
32 0.71
33 0.78
34 0.85
35 0.87
36 0.86
37 0.86
38 0.86
39 0.86
40 0.87
41 0.88
42 0.87
43 0.88
44 0.9
45 0.9
46 0.9
47 0.88
48 0.88
49 0.86
50 0.87
51 0.86
52 0.8
53 0.71
54 0.62
55 0.57
56 0.49
57 0.43
58 0.36
59 0.26
60 0.23
61 0.26
62 0.27
63 0.24
64 0.22
65 0.21
66 0.24
67 0.26
68 0.28
69 0.3
70 0.29
71 0.28
72 0.32
73 0.32
74 0.27
75 0.25
76 0.21
77 0.16
78 0.17
79 0.15
80 0.12
81 0.11
82 0.1
83 0.14
84 0.14
85 0.13
86 0.13
87 0.14
88 0.13
89 0.14
90 0.15
91 0.14
92 0.17
93 0.18
94 0.17
95 0.17
96 0.16
97 0.17
98 0.18
99 0.18
100 0.16
101 0.16
102 0.23
103 0.31
104 0.38
105 0.43
106 0.51
107 0.57
108 0.61
109 0.64
110 0.65
111 0.65
112 0.65
113 0.66
114 0.66
115 0.62
116 0.57
117 0.53
118 0.44
119 0.36
120 0.28
121 0.22
122 0.13
123 0.09
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.09
138 0.12
139 0.16
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.1
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.07
159 0.09
160 0.09
161 0.13
162 0.22
163 0.24
164 0.26
165 0.26
166 0.25
167 0.26
168 0.27
169 0.28
170 0.23
171 0.22
172 0.21
173 0.21
174 0.2
175 0.16
176 0.17
177 0.14
178 0.11
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.13
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.12
204 0.12
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.15
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.21
218 0.22
219 0.22
220 0.23
221 0.22
222 0.22
223 0.21
224 0.19
225 0.13
226 0.12
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.14
233 0.14
234 0.18
235 0.18
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.21
240 0.21
241 0.23
242 0.2
243 0.22
244 0.29
245 0.29
246 0.31
247 0.28
248 0.28
249 0.29
250 0.31
251 0.3
252 0.25
253 0.25
254 0.26
255 0.29
256 0.34
257 0.3
258 0.34
259 0.4
260 0.46
261 0.49
262 0.53
263 0.52
264 0.49
265 0.57
266 0.53
267 0.46
268 0.4
269 0.35
270 0.27
271 0.25
272 0.21
273 0.15
274 0.14
275 0.15
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.1
282 0.12
283 0.11
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.15
288 0.16
289 0.15
290 0.12
291 0.15
292 0.15
293 0.18
294 0.21
295 0.21
296 0.2
297 0.19
298 0.21
299 0.2
300 0.23
301 0.2
302 0.16
303 0.15
304 0.17
305 0.17
306 0.17
307 0.15
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.07
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.11
323 0.15
324 0.21
325 0.22
326 0.25
327 0.26
328 0.28
329 0.29
330 0.29
331 0.27
332 0.25
333 0.26
334 0.24
335 0.25
336 0.25
337 0.23
338 0.2
339 0.19
340 0.21
341 0.24
342 0.25
343 0.24
344 0.26
345 0.26
346 0.29
347 0.34
348 0.32
349 0.28
350 0.27
351 0.25
352 0.24
353 0.25
354 0.22
355 0.17
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.14
360 0.12
361 0.11
362 0.1
363 0.1
364 0.14
365 0.15
366 0.14
367 0.17
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.17
372 0.15
373 0.13
374 0.13
375 0.11
376 0.12
377 0.13
378 0.15
379 0.15
380 0.17
381 0.18
382 0.17
383 0.15
384 0.15
385 0.16
386 0.15
387 0.15
388 0.13
389 0.12
390 0.13
391 0.15
392 0.15
393 0.14
394 0.16
395 0.16
396 0.16
397 0.16
398 0.17
399 0.23
400 0.28
401 0.33
402 0.36
403 0.43
404 0.43
405 0.45
406 0.46
407 0.38
408 0.32
409 0.29
410 0.24
411 0.19
412 0.2
413 0.18
414 0.16
415 0.17
416 0.17
417 0.18
418 0.25
419 0.25