Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P47043

Protein Details
Accession P47043    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
742-782WHDCHRTFPQRQKLIRHLKVHSKYKPYKCKTCKRCFSSEETHydrophilic
835-861ESSNLSKHIKTHQKKYKCSDCSKSFDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040792  Zap1_Znf2  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000977  F:RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YJL056C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18217  Zap1_zf2  
PF00096  zf-C2H2  
PF13912  zf-C2H2_6  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MDALTPRDSPKRDDSMATSAATAASAKPDALTIGKEGIVHGHIHNYNNLTYIHGHLHHSAPVNDSSASATPAAAAVADAATSAFASGASHDMGGDCHVNEKCKEYTDCQHFEFLNYHNNPSLTKYNDTATYNSNNHSFANNFHSVASDPTSPQQNSKSDLPRRKDSWFNDDLILLPSSKKNKPNPPPGSDDCYCTPKILEICCDETHPKSEANIKQGESDQPTKKDISENGNDVAIFTDVKNDHLMPNFNLHDQYCNSTNHDSHNHNNTVPDSFSQLMSHLSEIDCDLTCDTPCTASTSATSGHKFVQDHQSSNNDDVFHKYCKFCEESTDNQPCSKHMHLESKPPQLPPKCSSLRKPTNTLQGTNHAYHEHILNTDMDLKILEDLCNISSLYEVPFGKHINHHDHNNAGNGCDGSSTGNNENGNQTMNLLLSSINRCNPKNNLNGSNNNTAGATSTDHQHHHHRIQFHSHKPNRNNIVNNSGISAANTTADLTNNDLNDLISREYSYERFRNQSEPPSLPKVTHQNQKNRRSWPTKDLESTDFSSLEDSLPSSISPPIQTTSTINFNWCFKEEKNNDLKCKWKECPESCSSLFDLQRHLLKDHVSQDFKHPMEPLACNWEDCDFLGDDTCSIVNHINCQHGINFDIQFANPDSFLPGSISKEKHHLLHCPNPQTHEVSKADGAPDMTSANDVSNIPPIKQPEQVICQWDGCNKSFSSAQELNDHLEAVHLTRGKSEYQCLWHDCHRTFPQRQKLIRHLKVHSKYKPYKCKTCKRCFSSEETLVQHTRTHSGEKPYKCHICNKKFAISSSLKIHIRTHTGEKPLQCKICGKRFNESSNLSKHIKTHQKKYKCSDCSKSFDDLGKLNSQKVKCALERKPYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.48
3 0.48
4 0.43
5 0.35
6 0.28
7 0.25
8 0.21
9 0.17
10 0.11
11 0.11
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.13
17 0.14
18 0.15
19 0.13
20 0.15
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.16
25 0.16
26 0.17
27 0.15
28 0.21
29 0.24
30 0.25
31 0.29
32 0.29
33 0.28
34 0.29
35 0.28
36 0.23
37 0.21
38 0.22
39 0.23
40 0.23
41 0.25
42 0.26
43 0.27
44 0.29
45 0.32
46 0.3
47 0.28
48 0.28
49 0.27
50 0.24
51 0.23
52 0.22
53 0.19
54 0.19
55 0.16
56 0.14
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.07
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.1
81 0.11
82 0.09
83 0.15
84 0.17
85 0.21
86 0.22
87 0.27
88 0.26
89 0.31
90 0.35
91 0.35
92 0.43
93 0.48
94 0.51
95 0.48
96 0.51
97 0.46
98 0.44
99 0.41
100 0.34
101 0.35
102 0.32
103 0.33
104 0.31
105 0.32
106 0.3
107 0.33
108 0.36
109 0.31
110 0.32
111 0.31
112 0.31
113 0.36
114 0.37
115 0.34
116 0.32
117 0.35
118 0.34
119 0.35
120 0.34
121 0.3
122 0.29
123 0.29
124 0.26
125 0.22
126 0.27
127 0.27
128 0.25
129 0.23
130 0.24
131 0.21
132 0.23
133 0.23
134 0.18
135 0.16
136 0.19
137 0.27
138 0.26
139 0.3
140 0.34
141 0.33
142 0.37
143 0.43
144 0.49
145 0.52
146 0.6
147 0.63
148 0.66
149 0.66
150 0.67
151 0.68
152 0.63
153 0.62
154 0.56
155 0.52
156 0.44
157 0.4
158 0.36
159 0.29
160 0.25
161 0.17
162 0.15
163 0.18
164 0.23
165 0.29
166 0.36
167 0.42
168 0.52
169 0.62
170 0.71
171 0.74
172 0.73
173 0.75
174 0.73
175 0.71
176 0.62
177 0.57
178 0.49
179 0.45
180 0.41
181 0.33
182 0.28
183 0.25
184 0.27
185 0.24
186 0.25
187 0.24
188 0.28
189 0.27
190 0.3
191 0.29
192 0.27
193 0.29
194 0.27
195 0.24
196 0.22
197 0.3
198 0.31
199 0.34
200 0.36
201 0.33
202 0.34
203 0.35
204 0.38
205 0.35
206 0.39
207 0.38
208 0.37
209 0.39
210 0.37
211 0.36
212 0.36
213 0.35
214 0.35
215 0.34
216 0.35
217 0.33
218 0.33
219 0.31
220 0.26
221 0.22
222 0.16
223 0.11
224 0.08
225 0.13
226 0.12
227 0.14
228 0.15
229 0.15
230 0.17
231 0.19
232 0.22
233 0.17
234 0.23
235 0.23
236 0.22
237 0.24
238 0.22
239 0.22
240 0.21
241 0.24
242 0.22
243 0.22
244 0.25
245 0.26
246 0.27
247 0.28
248 0.33
249 0.34
250 0.36
251 0.42
252 0.41
253 0.38
254 0.39
255 0.35
256 0.31
257 0.28
258 0.22
259 0.18
260 0.16
261 0.16
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.16
287 0.18
288 0.19
289 0.16
290 0.17
291 0.2
292 0.2
293 0.22
294 0.3
295 0.29
296 0.29
297 0.31
298 0.34
299 0.33
300 0.34
301 0.32
302 0.23
303 0.21
304 0.24
305 0.24
306 0.23
307 0.25
308 0.24
309 0.22
310 0.25
311 0.27
312 0.23
313 0.27
314 0.29
315 0.31
316 0.4
317 0.46
318 0.43
319 0.42
320 0.42
321 0.36
322 0.37
323 0.33
324 0.28
325 0.26
326 0.34
327 0.34
328 0.45
329 0.5
330 0.53
331 0.54
332 0.51
333 0.54
334 0.49
335 0.53
336 0.45
337 0.47
338 0.45
339 0.47
340 0.52
341 0.55
342 0.6
343 0.59
344 0.62
345 0.59
346 0.62
347 0.6
348 0.56
349 0.47
350 0.44
351 0.44
352 0.38
353 0.35
354 0.25
355 0.23
356 0.21
357 0.2
358 0.13
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.11
364 0.1
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.08
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.11
384 0.12
385 0.13
386 0.16
387 0.2
388 0.24
389 0.27
390 0.3
391 0.29
392 0.31
393 0.31
394 0.32
395 0.27
396 0.19
397 0.17
398 0.14
399 0.13
400 0.1
401 0.09
402 0.06
403 0.07
404 0.09
405 0.09
406 0.12
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.13
411 0.13
412 0.1
413 0.09
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.06
420 0.09
421 0.1
422 0.13
423 0.16
424 0.17
425 0.2
426 0.24
427 0.28
428 0.33
429 0.36
430 0.4
431 0.42
432 0.47
433 0.48
434 0.48
435 0.43
436 0.36
437 0.31
438 0.23
439 0.19
440 0.14
441 0.11
442 0.07
443 0.1
444 0.11
445 0.13
446 0.15
447 0.21
448 0.25
449 0.3
450 0.33
451 0.33
452 0.33
453 0.42
454 0.47
455 0.49
456 0.55
457 0.56
458 0.61
459 0.62
460 0.69
461 0.66
462 0.64
463 0.6
464 0.52
465 0.51
466 0.43
467 0.4
468 0.32
469 0.26
470 0.2
471 0.15
472 0.13
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.07
480 0.08
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.1
488 0.08
489 0.06
490 0.07
491 0.07
492 0.09
493 0.11
494 0.16
495 0.18
496 0.2
497 0.23
498 0.25
499 0.29
500 0.3
501 0.35
502 0.35
503 0.34
504 0.36
505 0.39
506 0.38
507 0.33
508 0.34
509 0.36
510 0.38
511 0.43
512 0.46
513 0.5
514 0.6
515 0.7
516 0.72
517 0.69
518 0.72
519 0.72
520 0.69
521 0.68
522 0.65
523 0.6
524 0.57
525 0.54
526 0.48
527 0.44
528 0.41
529 0.33
530 0.26
531 0.22
532 0.19
533 0.16
534 0.13
535 0.09
536 0.07
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.07
541 0.07
542 0.08
543 0.09
544 0.09
545 0.1
546 0.11
547 0.12
548 0.13
549 0.15
550 0.19
551 0.19
552 0.19
553 0.19
554 0.2
555 0.21
556 0.21
557 0.21
558 0.18
559 0.28
560 0.28
561 0.36
562 0.44
563 0.48
564 0.52
565 0.51
566 0.59
567 0.54
568 0.59
569 0.54
570 0.53
571 0.57
572 0.56
573 0.6
574 0.56
575 0.56
576 0.5
577 0.49
578 0.42
579 0.38
580 0.37
581 0.3
582 0.29
583 0.26
584 0.29
585 0.27
586 0.26
587 0.22
588 0.22
589 0.25
590 0.28
591 0.32
592 0.3
593 0.29
594 0.35
595 0.41
596 0.39
597 0.36
598 0.31
599 0.27
600 0.28
601 0.29
602 0.24
603 0.23
604 0.23
605 0.22
606 0.22
607 0.2
608 0.17
609 0.16
610 0.16
611 0.1
612 0.09
613 0.1
614 0.09
615 0.09
616 0.09
617 0.09
618 0.06
619 0.07
620 0.11
621 0.1
622 0.14
623 0.16
624 0.18
625 0.19
626 0.2
627 0.2
628 0.17
629 0.18
630 0.17
631 0.15
632 0.14
633 0.14
634 0.13
635 0.14
636 0.15
637 0.14
638 0.11
639 0.11
640 0.12
641 0.11
642 0.11
643 0.11
644 0.11
645 0.15
646 0.21
647 0.23
648 0.22
649 0.28
650 0.3
651 0.33
652 0.35
653 0.39
654 0.4
655 0.48
656 0.54
657 0.56
658 0.55
659 0.54
660 0.54
661 0.51
662 0.45
663 0.43
664 0.37
665 0.32
666 0.31
667 0.29
668 0.27
669 0.23
670 0.22
671 0.15
672 0.14
673 0.11
674 0.1
675 0.09
676 0.09
677 0.08
678 0.09
679 0.09
680 0.09
681 0.16
682 0.17
683 0.17
684 0.2
685 0.24
686 0.26
687 0.29
688 0.31
689 0.29
690 0.34
691 0.36
692 0.37
693 0.34
694 0.33
695 0.31
696 0.33
697 0.32
698 0.28
699 0.28
700 0.24
701 0.25
702 0.26
703 0.25
704 0.3
705 0.29
706 0.3
707 0.31
708 0.32
709 0.33
710 0.3
711 0.28
712 0.19
713 0.16
714 0.15
715 0.11
716 0.14
717 0.14
718 0.13
719 0.16
720 0.18
721 0.21
722 0.23
723 0.26
724 0.27
725 0.3
726 0.36
727 0.36
728 0.39
729 0.42
730 0.47
731 0.43
732 0.47
733 0.5
734 0.54
735 0.6
736 0.65
737 0.69
738 0.71
739 0.77
740 0.76
741 0.78
742 0.8
743 0.8
744 0.78
745 0.74
746 0.75
747 0.79
748 0.8
749 0.77
750 0.77
751 0.79
752 0.82
753 0.86
754 0.84
755 0.86
756 0.87
757 0.9
758 0.9
759 0.91
760 0.91
761 0.87
762 0.87
763 0.81
764 0.79
765 0.78
766 0.73
767 0.68
768 0.61
769 0.59
770 0.51
771 0.47
772 0.41
773 0.34
774 0.31
775 0.27
776 0.3
777 0.3
778 0.39
779 0.46
780 0.49
781 0.53
782 0.58
783 0.65
784 0.62
785 0.67
786 0.68
787 0.68
788 0.73
789 0.73
790 0.73
791 0.68
792 0.66
793 0.65
794 0.59
795 0.55
796 0.51
797 0.53
798 0.46
799 0.45
800 0.47
801 0.43
802 0.44
803 0.44
804 0.46
805 0.44
806 0.49
807 0.51
808 0.54
809 0.55
810 0.57
811 0.56
812 0.51
813 0.53
814 0.56
815 0.61
816 0.63
817 0.61
818 0.62
819 0.66
820 0.69
821 0.68
822 0.65
823 0.62
824 0.6
825 0.63
826 0.56
827 0.5
828 0.48
829 0.5
830 0.56
831 0.57
832 0.62
833 0.66
834 0.73
835 0.8
836 0.87
837 0.87
838 0.86
839 0.87
840 0.86
841 0.84
842 0.82
843 0.77
844 0.72
845 0.66
846 0.61
847 0.56
848 0.49
849 0.46
850 0.47
851 0.44
852 0.45
853 0.48
854 0.43
855 0.45
856 0.47
857 0.5
858 0.48
859 0.56
860 0.58