Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38707

Protein Details
Accession P38707    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-94CDGLKKKAVKQKEQELKKQQKEAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-69RK
73-82GLKKKAVKQK
Subcellular Location(s) cyto 18, cyto_nucl 13.333, nucl 6.5, mito_nucl 4.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004364  Aa-tRNA-synt_II  
IPR006195  aa-tRNA-synth_II  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR004522  Asn-tRNA-ligase  
IPR002312  Asp/Asn-tRNA-synth_IIb  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR004365  NA-bd_OB_tRNA  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0004816  F:asparagine-tRNA ligase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006421  P:asparaginyl-tRNA aminoacylation  
KEGG sce:YHR019C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00152  tRNA-synt_2  
PF01336  tRNA_anti-codon  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50862  AA_TRNA_LIGASE_II  
CDD cd04323  AsnRS_cyto_like_N  
cd00776  AsxRS_core  
Amino Acid Sequences MSSLYIKEATGVDELTTAGSQDHPFKTPAYALFASQQKSDATEPKLFVFKTEDNEYQEISASALKKARKGCDGLKKKAVKQKEQELKKQQKEAENAAKQLSALNITIKEDESLPAAIKTRIYDSYSKVGQRVKVSGWIHRLRSNKKVIFVVLRDGSGFIQCVLSGDLALAQQTLDLTLESTVTLYGTIVKLPEGKTAPGGVELNVDYYEVVGLAPGGEDSFTNKIAEGSDPSLLLDQRHLALRGDALSAVMKVRAALLKSVRRVYDEEHLTEVTPPCMVQTQVEGGSTLFKMNYYGEEAYLTQSSQLYLETCLASLGDVYTIQESFRAEKSHTRRHLSEYTHIEAELAFLTFDDLLQHIETLIVKSVQYVLEDPIAGPLVKQLNPNFKAPKAPFMRLQYKDAITWLNEHDIKNEEGEDFKFGDDIAEAAERKMTDTIGVPIFLTRFPVEIKSFYMKRCSDDPRVTESVDVLMPNVGEITGGSMRIDDMDELMAGFKREGIDTDAYYWFIDQRKYGTCPHGGYGIGTERILAWLCDRFTVRDCSLYPRFSGRCKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.11
4 0.09
5 0.08
6 0.11
7 0.13
8 0.19
9 0.22
10 0.23
11 0.25
12 0.25
13 0.28
14 0.29
15 0.28
16 0.29
17 0.27
18 0.26
19 0.32
20 0.36
21 0.35
22 0.32
23 0.32
24 0.25
25 0.27
26 0.3
27 0.31
28 0.31
29 0.34
30 0.35
31 0.36
32 0.41
33 0.38
34 0.35
35 0.35
36 0.33
37 0.34
38 0.39
39 0.4
40 0.4
41 0.42
42 0.4
43 0.34
44 0.31
45 0.25
46 0.2
47 0.19
48 0.15
49 0.17
50 0.22
51 0.23
52 0.28
53 0.35
54 0.39
55 0.4
56 0.45
57 0.5
58 0.57
59 0.64
60 0.67
61 0.7
62 0.72
63 0.74
64 0.77
65 0.77
66 0.76
67 0.75
68 0.77
69 0.78
70 0.79
71 0.81
72 0.84
73 0.86
74 0.83
75 0.82
76 0.77
77 0.75
78 0.72
79 0.71
80 0.71
81 0.64
82 0.59
83 0.52
84 0.47
85 0.39
86 0.34
87 0.26
88 0.18
89 0.14
90 0.14
91 0.14
92 0.16
93 0.17
94 0.16
95 0.16
96 0.14
97 0.14
98 0.13
99 0.13
100 0.12
101 0.12
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.15
106 0.17
107 0.19
108 0.22
109 0.24
110 0.26
111 0.31
112 0.35
113 0.35
114 0.36
115 0.37
116 0.38
117 0.38
118 0.37
119 0.32
120 0.36
121 0.36
122 0.38
123 0.42
124 0.44
125 0.43
126 0.46
127 0.53
128 0.5
129 0.57
130 0.61
131 0.55
132 0.53
133 0.52
134 0.49
135 0.47
136 0.42
137 0.41
138 0.32
139 0.29
140 0.25
141 0.24
142 0.21
143 0.16
144 0.15
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.1
178 0.11
179 0.16
180 0.15
181 0.16
182 0.16
183 0.17
184 0.16
185 0.15
186 0.15
187 0.1
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.05
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.04
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.09
244 0.14
245 0.19
246 0.22
247 0.25
248 0.24
249 0.24
250 0.25
251 0.25
252 0.27
253 0.25
254 0.23
255 0.22
256 0.22
257 0.2
258 0.21
259 0.19
260 0.12
261 0.1
262 0.08
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.06
267 0.06
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.06
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.07
312 0.09
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.21
317 0.29
318 0.37
319 0.43
320 0.46
321 0.46
322 0.51
323 0.57
324 0.52
325 0.53
326 0.48
327 0.45
328 0.4
329 0.38
330 0.31
331 0.24
332 0.21
333 0.13
334 0.08
335 0.05
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.07
353 0.09
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.1
363 0.09
364 0.07
365 0.1
366 0.13
367 0.14
368 0.18
369 0.22
370 0.31
371 0.33
372 0.39
373 0.39
374 0.36
375 0.44
376 0.41
377 0.46
378 0.42
379 0.43
380 0.44
381 0.48
382 0.56
383 0.5
384 0.53
385 0.48
386 0.44
387 0.41
388 0.37
389 0.31
390 0.22
391 0.22
392 0.2
393 0.21
394 0.23
395 0.23
396 0.23
397 0.24
398 0.24
399 0.22
400 0.21
401 0.15
402 0.14
403 0.15
404 0.15
405 0.13
406 0.12
407 0.11
408 0.1
409 0.1
410 0.08
411 0.07
412 0.06
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.11
417 0.1
418 0.12
419 0.13
420 0.11
421 0.1
422 0.11
423 0.15
424 0.14
425 0.14
426 0.13
427 0.13
428 0.14
429 0.13
430 0.15
431 0.11
432 0.11
433 0.12
434 0.17
435 0.18
436 0.19
437 0.23
438 0.27
439 0.31
440 0.32
441 0.39
442 0.36
443 0.38
444 0.44
445 0.47
446 0.48
447 0.52
448 0.54
449 0.53
450 0.54
451 0.5
452 0.44
453 0.37
454 0.3
455 0.24
456 0.2
457 0.13
458 0.11
459 0.1
460 0.09
461 0.09
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.1
472 0.11
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.09
483 0.1
484 0.11
485 0.12
486 0.16
487 0.18
488 0.18
489 0.22
490 0.21
491 0.21
492 0.21
493 0.2
494 0.19
495 0.2
496 0.21
497 0.2
498 0.23
499 0.28
500 0.31
501 0.37
502 0.39
503 0.4
504 0.4
505 0.4
506 0.39
507 0.34
508 0.31
509 0.3
510 0.29
511 0.24
512 0.22
513 0.2
514 0.17
515 0.19
516 0.19
517 0.15
518 0.13
519 0.16
520 0.17
521 0.21
522 0.23
523 0.24
524 0.28
525 0.35
526 0.33
527 0.34
528 0.35
529 0.4
530 0.45
531 0.44
532 0.42
533 0.44
534 0.46