FuNGI

P23394

Protein Details

Accession

P23394

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-50	NTSGKISKPRFLNKQERSKQERLKENEE	Hydrophilic
75-97	FNETNDKKRNPSKQNGSKFHFSW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 7, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0005682 C:U5 snRNP GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000384 F:first spliceosomal transesterification activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0000395 P:mRNA 5'-splice site recognition GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	sce:YDR243C -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd17945 DEADc_DDX23 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MARPIDVSQLIAGINKKKGLDENTSGKISKPRFLNKQERSKQERLKENEESLTPTQSDSAKVEIKKVNSRDDSFFNETNDKKRNPSKQNGSKFHFSWNESEDTLSGYDPIVSTRAIDLLWKGKTPKNAAESSYMGKHWTEKSLHEMNERDWRILKEDYAIVTKGGTVENPLRNWEELNIIPRDLLRVIIQELRFPSPTPIQRITIPNVCNMKQYRDFLGVASTGSGKTLAFVIPILIKMSRSPPRPPSLKIIDGPKALILAPTRELVQQIQKETQKVTKIWSKESNYDCKVISIVGGHSLEEISFSLSEGCDILVATPGRLIDSLENHLLVMKQVETLVLDEADKMIDLGFEDQVTNILTKVDINADSAVNRQTLMFTATMTPVIEKIAAGYMQKPVYATIGVETGSEPLIQQVVEYADNDEDKFKKLKPIVAKYDPPIIIFINYKQTADWLAEKFQKETNMKVTILHGSKSQEQREHSLQLFRTNKVQIMIATNVAARGLDIPNVSLVVNFQISKKMDDYIHRIGRTGRAANEGTAVSFVSAAEDESLIRELYKYVRKHDPLNSNIFSEAVKNKYNVGKQLSNEIIY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.28
3	0.28
4	0.3
5	0.36
6	0.39
7	0.42
8	0.44
9	0.48
10	0.5
11	0.53
12	0.5
13	0.47
14	0.49
15	0.44
16	0.43
17	0.44
18	0.48
19	0.55
20	0.65
21	0.73
22	0.74
23	0.82
24	0.85
25	0.87
26	0.86
27	0.87
28	0.85
29	0.84
30	0.84
31	0.8
32	0.79
33	0.76
34	0.71
35	0.65
36	0.58
37	0.55
38	0.47
39	0.43
40	0.35
41	0.28
42	0.27
43	0.23
44	0.25
45	0.2
46	0.24
47	0.27
48	0.27
49	0.34
50	0.36
51	0.41
52	0.47
53	0.49
54	0.54
55	0.54
56	0.57
57	0.54
58	0.54
59	0.55
60	0.53
61	0.51
62	0.46
63	0.46
64	0.45
65	0.49
66	0.53
67	0.48
68	0.49
69	0.56
70	0.63
71	0.65
72	0.72
73	0.76
74	0.78
75	0.86
76	0.87
77	0.84
78	0.81
79	0.73
80	0.71
81	0.66
82	0.58
83	0.52
84	0.46
85	0.42
86	0.35
87	0.35
88	0.26
89	0.22
90	0.2
91	0.15
92	0.12
93	0.09
94	0.09
95	0.08
96	0.09
97	0.09
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.09
102	0.08
103	0.09
104	0.11
105	0.16
106	0.18
107	0.2
108	0.23
109	0.26
110	0.33
111	0.38
112	0.42
113	0.42
114	0.43
115	0.43
116	0.43
117	0.42
118	0.39
119	0.36
120	0.3
121	0.25
122	0.23
123	0.25
124	0.22
125	0.26
126	0.24
127	0.23
128	0.3
129	0.35
130	0.37
131	0.38
132	0.38
133	0.36
134	0.44
135	0.43
136	0.37
137	0.34
138	0.33
139	0.32
140	0.31
141	0.28
142	0.21
143	0.22
144	0.22
145	0.21
146	0.2
147	0.16
148	0.15
149	0.14
150	0.12
151	0.11
152	0.09
153	0.1
154	0.16
155	0.2
156	0.21
157	0.23
158	0.24
159	0.24
160	0.25
161	0.22
162	0.19
163	0.17
164	0.21
165	0.19
166	0.17
167	0.17
168	0.17
169	0.17
170	0.14
171	0.13
172	0.09
173	0.09
174	0.11
175	0.16
176	0.16
177	0.17
178	0.19
179	0.21
180	0.21
181	0.2
182	0.22
183	0.24
184	0.28
185	0.31
186	0.32
187	0.31
188	0.35
189	0.38
190	0.4
191	0.39
192	0.35
193	0.35
194	0.36
195	0.35
196	0.37
197	0.34
198	0.36
199	0.34
200	0.36
201	0.33
202	0.32
203	0.32
204	0.26
205	0.26
206	0.2
207	0.15
208	0.13
209	0.11
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.05
214	0.05
215	0.06
216	0.06
217	0.05
218	0.05
219	0.06
220	0.06
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.08
226	0.15
227	0.2
228	0.23
229	0.28
230	0.33
231	0.4
232	0.44
233	0.45
234	0.46
235	0.45
236	0.45
237	0.43
238	0.43
239	0.39
240	0.36
241	0.34
242	0.26
243	0.21
244	0.17
245	0.16
246	0.11
247	0.09
248	0.09
249	0.1
250	0.1
251	0.1
252	0.11
253	0.11
254	0.16
255	0.17
256	0.18
257	0.23
258	0.24
259	0.25
260	0.26
261	0.28
262	0.26
263	0.24
264	0.27
265	0.27
266	0.27
267	0.31
268	0.36
269	0.36
270	0.39
271	0.43
272	0.46
273	0.42
274	0.42
275	0.37
276	0.3
277	0.27
278	0.2
279	0.16
280	0.09
281	0.07
282	0.08
283	0.08
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.06
289	0.06
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.05
294	0.04
295	0.05
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.06
310	0.08
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.1
315	0.11
316	0.1
317	0.09
318	0.08
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.04
332	0.04
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.07
343	0.06
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.08
352	0.09
353	0.09
354	0.09
355	0.11
356	0.12
357	0.1
358	0.1
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.1
363	0.08
364	0.07
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.09
369	0.09
370	0.07
371	0.08
372	0.07
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.08
378	0.09
379	0.12
380	0.12
381	0.13
382	0.12
383	0.12
384	0.12
385	0.12
386	0.11
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.05
400	0.06
401	0.07
402	0.08
403	0.08
404	0.09
405	0.1
406	0.11
407	0.11
408	0.13
409	0.13
410	0.16
411	0.18
412	0.18
413	0.25
414	0.28
415	0.33
416	0.4
417	0.48
418	0.54
419	0.58
420	0.61
421	0.56
422	0.61
423	0.55
424	0.46
425	0.38
426	0.3
427	0.25
428	0.22
429	0.22
430	0.22
431	0.22
432	0.22
433	0.2
434	0.2
435	0.2
436	0.2
437	0.23
438	0.16
439	0.21
440	0.26
441	0.27
442	0.28
443	0.3
444	0.36
445	0.33
446	0.35
447	0.37
448	0.36
449	0.35
450	0.34
451	0.33
452	0.33
453	0.33
454	0.29
455	0.26
456	0.26
457	0.33
458	0.39
459	0.42
460	0.4
461	0.41
462	0.47
463	0.49
464	0.5
465	0.45
466	0.45
467	0.41
468	0.45
469	0.46
470	0.41
471	0.42
472	0.39
473	0.38
474	0.33
475	0.33
476	0.25
477	0.26
478	0.26
479	0.21
480	0.19
481	0.17
482	0.16
483	0.14
484	0.12
485	0.08
486	0.09
487	0.09
488	0.1
489	0.1
490	0.11
491	0.11
492	0.12
493	0.12
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.11
498	0.11
499	0.12
500	0.18
501	0.19
502	0.22
503	0.23
504	0.25
505	0.26
506	0.31
507	0.38
508	0.41
509	0.47
510	0.45
511	0.45
512	0.43
513	0.46
514	0.47
515	0.44
516	0.36
517	0.35
518	0.36
519	0.35
520	0.35
521	0.29
522	0.23
523	0.19
524	0.16
525	0.11
526	0.1
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.09
535	0.11
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.11
540	0.18
541	0.26
542	0.28
543	0.33
544	0.44
545	0.47
546	0.54
547	0.62
548	0.64
549	0.63
550	0.68
551	0.64
552	0.55
553	0.52
554	0.45
555	0.36
556	0.32
557	0.31
558	0.27
559	0.29
560	0.28
561	0.33
562	0.4
563	0.45
564	0.47
565	0.49
566	0.5
567	0.48
568	0.56

P23394

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer