Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12383

Protein Details
Accession Q12383    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-42CEYFMEKKKRRCGMTRSSQNLYHydrophilic
82-107TVWADQLKKHLKKCNKTKLSHLNDDKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007871  Methyltransferase_TRM13  
IPR039044  Trm13  
IPR022776  TRM13/UPF0224_CHHC_Znf_dom  
IPR021721  Znf_CCCH-type_TRM13  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0052666  F:tRNA (cytosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0106050  F:tRNA 2'-O-methyltransferase activity  
GO:0008175  F:tRNA methyltransferase activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
GO:0002128  P:tRNA nucleoside ribose methylation  
KEGG sce:YOL125W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05206  TRM13  
PF11722  zf-TRM13_CCCH  
PF05253  zf-U11-48K  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51800  ZF_CHHC_U11_48K  
Amino Acid Sequences MLQDNNGPAVKRAKPSERLQCEYFMEKKKRRCGMTRSSQNLYCSEHLNLMKKAANSQVHNKNGSEAEKERERVPCPLDPNHTVWADQLKKHLKKCNKTKLSHLNDDKPYYEPGYNGENGLLSSSVKIDITAEHLVQSIELLYKVFEGESMDELPLRQLNNKLMSLKRFPQLPSNTKHAVQQSSLIENLVDAGAFERPESLNFIEFGCGRAEFSRYVSLYLLTQLTSLPAEHSGSNSNEFVLIDRATNRMKFDKKIKDDFSEIKSNSPSKPISCPSIKRIKIDIRDLKMDPILKSTPGDDIQYVCISKHLCGVATDLTLRCIGNSSILHGDDNNGCNPKLKAICIAMCCRHVCDYGDYVNRSYVTSLVEKYRAHGSILTYETFFRVLTKLCSWGTCGRKPGTAITDIVNVVESFEGAEPYTITIKERENIGLMARRVIDEGRLVYVKEKFTEFNAELIRYVESDVSLENVAMLVYKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.63
3 0.7
4 0.72
5 0.73
6 0.68
7 0.65
8 0.61
9 0.6
10 0.59
11 0.58
12 0.6
13 0.62
14 0.69
15 0.74
16 0.77
17 0.78
18 0.79
19 0.79
20 0.79
21 0.82
22 0.83
23 0.8
24 0.79
25 0.75
26 0.69
27 0.63
28 0.57
29 0.48
30 0.4
31 0.35
32 0.35
33 0.35
34 0.39
35 0.36
36 0.35
37 0.37
38 0.35
39 0.36
40 0.38
41 0.4
42 0.39
43 0.47
44 0.52
45 0.55
46 0.57
47 0.54
48 0.5
49 0.47
50 0.45
51 0.41
52 0.35
53 0.36
54 0.39
55 0.41
56 0.41
57 0.42
58 0.42
59 0.42
60 0.44
61 0.43
62 0.42
63 0.46
64 0.49
65 0.47
66 0.48
67 0.47
68 0.43
69 0.37
70 0.33
71 0.36
72 0.34
73 0.32
74 0.37
75 0.43
76 0.49
77 0.55
78 0.63
79 0.64
80 0.7
81 0.79
82 0.82
83 0.81
84 0.78
85 0.81
86 0.83
87 0.81
88 0.81
89 0.78
90 0.75
91 0.72
92 0.71
93 0.62
94 0.53
95 0.47
96 0.4
97 0.33
98 0.24
99 0.21
100 0.23
101 0.22
102 0.2
103 0.18
104 0.15
105 0.14
106 0.14
107 0.11
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.11
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.07
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.14
145 0.19
146 0.22
147 0.24
148 0.27
149 0.28
150 0.32
151 0.35
152 0.36
153 0.34
154 0.35
155 0.34
156 0.39
157 0.44
158 0.46
159 0.45
160 0.47
161 0.47
162 0.44
163 0.47
164 0.42
165 0.36
166 0.3
167 0.31
168 0.26
169 0.25
170 0.24
171 0.2
172 0.15
173 0.13
174 0.13
175 0.07
176 0.05
177 0.03
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.11
200 0.14
201 0.13
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.12
206 0.13
207 0.11
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.1
220 0.11
221 0.13
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.07
230 0.08
231 0.1
232 0.12
233 0.13
234 0.14
235 0.19
236 0.21
237 0.25
238 0.34
239 0.4
240 0.45
241 0.52
242 0.53
243 0.5
244 0.52
245 0.51
246 0.47
247 0.46
248 0.4
249 0.35
250 0.35
251 0.34
252 0.3
253 0.3
254 0.27
255 0.21
256 0.26
257 0.25
258 0.28
259 0.31
260 0.34
261 0.36
262 0.45
263 0.45
264 0.43
265 0.47
266 0.49
267 0.49
268 0.55
269 0.55
270 0.49
271 0.51
272 0.48
273 0.43
274 0.39
275 0.37
276 0.27
277 0.24
278 0.22
279 0.18
280 0.18
281 0.17
282 0.17
283 0.15
284 0.16
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.15
289 0.15
290 0.11
291 0.13
292 0.13
293 0.12
294 0.15
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.15
299 0.13
300 0.13
301 0.15
302 0.11
303 0.12
304 0.13
305 0.12
306 0.1
307 0.11
308 0.1
309 0.12
310 0.12
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.16
315 0.15
316 0.17
317 0.16
318 0.18
319 0.18
320 0.18
321 0.18
322 0.2
323 0.21
324 0.24
325 0.23
326 0.22
327 0.23
328 0.25
329 0.28
330 0.29
331 0.34
332 0.31
333 0.33
334 0.33
335 0.31
336 0.29
337 0.28
338 0.26
339 0.24
340 0.24
341 0.26
342 0.31
343 0.31
344 0.3
345 0.3
346 0.29
347 0.26
348 0.23
349 0.18
350 0.15
351 0.16
352 0.17
353 0.19
354 0.23
355 0.22
356 0.24
357 0.28
358 0.26
359 0.25
360 0.25
361 0.23
362 0.25
363 0.27
364 0.26
365 0.21
366 0.21
367 0.2
368 0.18
369 0.16
370 0.11
371 0.11
372 0.12
373 0.16
374 0.17
375 0.21
376 0.21
377 0.22
378 0.25
379 0.32
380 0.37
381 0.38
382 0.43
383 0.4
384 0.42
385 0.43
386 0.44
387 0.4
388 0.36
389 0.32
390 0.28
391 0.29
392 0.26
393 0.24
394 0.19
395 0.15
396 0.13
397 0.11
398 0.09
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.07
403 0.08
404 0.07
405 0.09
406 0.12
407 0.11
408 0.12
409 0.15
410 0.18
411 0.2
412 0.23
413 0.23
414 0.22
415 0.23
416 0.26
417 0.29
418 0.27
419 0.28
420 0.26
421 0.25
422 0.24
423 0.24
424 0.21
425 0.17
426 0.18
427 0.19
428 0.2
429 0.2
430 0.23
431 0.27
432 0.28
433 0.27
434 0.28
435 0.25
436 0.27
437 0.35
438 0.32
439 0.33
440 0.34
441 0.32
442 0.31
443 0.3
444 0.28
445 0.2
446 0.21
447 0.15
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.12
452 0.11
453 0.1
454 0.09
455 0.08
456 0.08