Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53874

Protein Details
Accession P53874    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
762-792VNEPNNRPLKINSKKNNRKKWKKNKKRKFTKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
770-792LKINSKKNNRKKWKKNKKRKFTK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001394  Peptidase_C19_UCH  
IPR018200  USP_CS  
IPR028889  USP_dom  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0043596  C:nuclear replication fork  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0004197  F:cysteine-type endopeptidase activity  
GO:0016578  P:histone deubiquitination  
GO:0031509  P:subtelomeric heterochromatin formation  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG sce:YNL186W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00443  UCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00973  USP_2  
PS50235  USP_3  
Amino Acid Sequences MTTQESIKPLVDRILSNPLQFNAAMISNKSNNNDTSAAPENSSYIVIGKQHNNNSNSTAIAATAESKQIKENNLIDRPNGKKTNTVPKSMAEALLLYTSKNDKDAADATGAKKSAELSTELSTEPPSSSSEDDKVGKEEEEEGEIFHEARDYVEPRKASLKERDNADKGDGEDIGEDIGEDIGEDIGEDIGEDIGENLGSPLATIDDSSNENEKEKRKELSTSISSDDEIEDDEDEDDMDYDSSAMEKELPEEEENDSSSKISEGEKKSLYQDLMENSTVEVNRYEPVNNTKENGNRNPKGEEEEEEEEELKHKSRSITPPVTISNLSNFYQFNENINDRGSLNSTRIVKNWGDKFTNLKPRGLLNHGVTCYTNAAVQAMLHIPSIQHYLFDILMGKYDSTISKNSVSYTLAETSKKMWLPVSKNPRKNVSASYINPKHLISRLDDINCMMSEWQQEDSHEYFMSLMSRLQEDSVPKGHKLIESIIYDIFGGLLKQIVTCKSCGSISKTEQPFYDLSLHLKGKKKLDPNSDLSSDSINGTSATTSTTTSNAATKPSLSSSSSVNLNNGSPFAAASDLSSANRRFSIEKSIKDFFNPELIKVDKEQKGYVCEKCHKTTNAVKHSSILRAPETLLVHLKKFRFNGTSSSKMKQAVSYPMFLDLTEYCESKELPVKYQLLSVVVHEGRSLSSGHYIAHCKQPDGSWATYDDEYINIISERDVLKEPNAYYLLYTRLTPKSVPLPLAKSAMATGNVTSKSKQEQAVNEPNNRPLKINSKKNNRKKWKKNKKRKFTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.35
4 0.37
5 0.32
6 0.31
7 0.29
8 0.26
9 0.19
10 0.2
11 0.19
12 0.18
13 0.23
14 0.26
15 0.31
16 0.34
17 0.35
18 0.33
19 0.36
20 0.36
21 0.3
22 0.32
23 0.34
24 0.32
25 0.29
26 0.28
27 0.24
28 0.24
29 0.23
30 0.17
31 0.12
32 0.13
33 0.16
34 0.22
35 0.28
36 0.35
37 0.43
38 0.51
39 0.52
40 0.52
41 0.51
42 0.46
43 0.4
44 0.33
45 0.25
46 0.17
47 0.15
48 0.13
49 0.12
50 0.12
51 0.17
52 0.17
53 0.18
54 0.22
55 0.26
56 0.28
57 0.34
58 0.38
59 0.41
60 0.47
61 0.48
62 0.47
63 0.52
64 0.53
65 0.55
66 0.55
67 0.48
68 0.48
69 0.53
70 0.61
71 0.57
72 0.58
73 0.51
74 0.48
75 0.53
76 0.47
77 0.41
78 0.3
79 0.26
80 0.21
81 0.22
82 0.19
83 0.13
84 0.14
85 0.16
86 0.16
87 0.17
88 0.18
89 0.14
90 0.19
91 0.21
92 0.2
93 0.21
94 0.24
95 0.24
96 0.27
97 0.27
98 0.23
99 0.21
100 0.21
101 0.19
102 0.17
103 0.18
104 0.17
105 0.19
106 0.2
107 0.2
108 0.19
109 0.18
110 0.18
111 0.16
112 0.13
113 0.13
114 0.14
115 0.17
116 0.2
117 0.21
118 0.24
119 0.27
120 0.27
121 0.27
122 0.26
123 0.24
124 0.21
125 0.21
126 0.18
127 0.18
128 0.17
129 0.15
130 0.14
131 0.14
132 0.13
133 0.11
134 0.1
135 0.07
136 0.09
137 0.12
138 0.14
139 0.17
140 0.23
141 0.23
142 0.24
143 0.32
144 0.34
145 0.36
146 0.44
147 0.48
148 0.49
149 0.55
150 0.61
151 0.57
152 0.56
153 0.52
154 0.44
155 0.37
156 0.33
157 0.27
158 0.18
159 0.15
160 0.13
161 0.1
162 0.07
163 0.06
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.07
194 0.09
195 0.11
196 0.15
197 0.15
198 0.17
199 0.22
200 0.28
201 0.33
202 0.35
203 0.37
204 0.36
205 0.4
206 0.41
207 0.44
208 0.42
209 0.38
210 0.37
211 0.34
212 0.32
213 0.28
214 0.24
215 0.16
216 0.13
217 0.1
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.07
236 0.08
237 0.11
238 0.11
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.14
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.09
249 0.11
250 0.18
251 0.21
252 0.26
253 0.27
254 0.28
255 0.3
256 0.32
257 0.3
258 0.23
259 0.22
260 0.19
261 0.21
262 0.21
263 0.19
264 0.15
265 0.18
266 0.16
267 0.14
268 0.12
269 0.09
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.18
275 0.21
276 0.21
277 0.22
278 0.25
279 0.29
280 0.35
281 0.42
282 0.45
283 0.45
284 0.46
285 0.47
286 0.43
287 0.43
288 0.38
289 0.32
290 0.28
291 0.28
292 0.26
293 0.25
294 0.24
295 0.2
296 0.19
297 0.18
298 0.13
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.2
303 0.27
304 0.34
305 0.38
306 0.37
307 0.4
308 0.39
309 0.39
310 0.33
311 0.27
312 0.21
313 0.2
314 0.19
315 0.18
316 0.16
317 0.15
318 0.19
319 0.19
320 0.18
321 0.19
322 0.19
323 0.19
324 0.19
325 0.19
326 0.15
327 0.15
328 0.15
329 0.12
330 0.12
331 0.16
332 0.18
333 0.18
334 0.18
335 0.22
336 0.21
337 0.26
338 0.3
339 0.3
340 0.29
341 0.29
342 0.33
343 0.37
344 0.46
345 0.4
346 0.37
347 0.34
348 0.34
349 0.37
350 0.35
351 0.32
352 0.24
353 0.27
354 0.26
355 0.25
356 0.23
357 0.21
358 0.18
359 0.13
360 0.11
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.06
370 0.05
371 0.06
372 0.09
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.08
388 0.09
389 0.1
390 0.12
391 0.13
392 0.13
393 0.14
394 0.14
395 0.13
396 0.14
397 0.15
398 0.14
399 0.14
400 0.14
401 0.15
402 0.18
403 0.17
404 0.16
405 0.15
406 0.19
407 0.24
408 0.32
409 0.42
410 0.47
411 0.52
412 0.55
413 0.58
414 0.54
415 0.52
416 0.47
417 0.42
418 0.4
419 0.37
420 0.43
421 0.41
422 0.4
423 0.39
424 0.36
425 0.31
426 0.27
427 0.27
428 0.19
429 0.2
430 0.23
431 0.22
432 0.22
433 0.21
434 0.19
435 0.17
436 0.15
437 0.11
438 0.08
439 0.08
440 0.09
441 0.11
442 0.1
443 0.1
444 0.15
445 0.16
446 0.16
447 0.14
448 0.13
449 0.11
450 0.11
451 0.12
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.1
459 0.11
460 0.13
461 0.18
462 0.19
463 0.18
464 0.2
465 0.2
466 0.19
467 0.19
468 0.19
469 0.19
470 0.18
471 0.19
472 0.17
473 0.16
474 0.15
475 0.13
476 0.11
477 0.06
478 0.05
479 0.03
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.06
484 0.09
485 0.1
486 0.11
487 0.11
488 0.12
489 0.13
490 0.16
491 0.2
492 0.25
493 0.28
494 0.36
495 0.38
496 0.38
497 0.37
498 0.37
499 0.31
500 0.27
501 0.27
502 0.18
503 0.18
504 0.22
505 0.24
506 0.28
507 0.34
508 0.36
509 0.38
510 0.44
511 0.5
512 0.52
513 0.58
514 0.59
515 0.58
516 0.58
517 0.54
518 0.49
519 0.42
520 0.35
521 0.27
522 0.21
523 0.15
524 0.1
525 0.09
526 0.08
527 0.08
528 0.06
529 0.07
530 0.07
531 0.08
532 0.08
533 0.09
534 0.1
535 0.11
536 0.14
537 0.13
538 0.15
539 0.14
540 0.14
541 0.15
542 0.16
543 0.18
544 0.16
545 0.16
546 0.16
547 0.18
548 0.21
549 0.2
550 0.19
551 0.18
552 0.18
553 0.17
554 0.15
555 0.13
556 0.09
557 0.08
558 0.08
559 0.07
560 0.06
561 0.06
562 0.08
563 0.09
564 0.1
565 0.15
566 0.15
567 0.16
568 0.17
569 0.18
570 0.18
571 0.19
572 0.29
573 0.31
574 0.35
575 0.4
576 0.42
577 0.41
578 0.41
579 0.41
580 0.31
581 0.34
582 0.3
583 0.24
584 0.26
585 0.27
586 0.27
587 0.28
588 0.35
589 0.3
590 0.32
591 0.33
592 0.31
593 0.36
594 0.4
595 0.42
596 0.41
597 0.46
598 0.49
599 0.51
600 0.56
601 0.52
602 0.54
603 0.57
604 0.6
605 0.61
606 0.6
607 0.56
608 0.52
609 0.53
610 0.5
611 0.44
612 0.37
613 0.29
614 0.25
615 0.25
616 0.26
617 0.24
618 0.22
619 0.26
620 0.25
621 0.26
622 0.3
623 0.32
624 0.33
625 0.34
626 0.37
627 0.34
628 0.34
629 0.4
630 0.42
631 0.49
632 0.48
633 0.48
634 0.47
635 0.46
636 0.45
637 0.4
638 0.37
639 0.37
640 0.36
641 0.36
642 0.32
643 0.32
644 0.31
645 0.27
646 0.25
647 0.16
648 0.18
649 0.17
650 0.17
651 0.15
652 0.16
653 0.17
654 0.17
655 0.24
656 0.21
657 0.24
658 0.3
659 0.32
660 0.31
661 0.33
662 0.31
663 0.26
664 0.25
665 0.21
666 0.22
667 0.2
668 0.2
669 0.17
670 0.17
671 0.15
672 0.16
673 0.15
674 0.09
675 0.12
676 0.13
677 0.14
678 0.18
679 0.22
680 0.24
681 0.32
682 0.33
683 0.3
684 0.32
685 0.32
686 0.35
687 0.36
688 0.34
689 0.27
690 0.28
691 0.3
692 0.29
693 0.28
694 0.21
695 0.16
696 0.16
697 0.14
698 0.13
699 0.09
700 0.09
701 0.09
702 0.12
703 0.12
704 0.14
705 0.16
706 0.17
707 0.19
708 0.24
709 0.24
710 0.26
711 0.27
712 0.24
713 0.23
714 0.24
715 0.25
716 0.21
717 0.22
718 0.22
719 0.25
720 0.27
721 0.26
722 0.29
723 0.33
724 0.36
725 0.39
726 0.39
727 0.4
728 0.41
729 0.44
730 0.39
731 0.32
732 0.29
733 0.28
734 0.24
735 0.2
736 0.18
737 0.21
738 0.23
739 0.25
740 0.24
741 0.25
742 0.29
743 0.34
744 0.38
745 0.38
746 0.43
747 0.5
748 0.6
749 0.63
750 0.66
751 0.64
752 0.66
753 0.67
754 0.61
755 0.54
756 0.5
757 0.53
758 0.55
759 0.63
760 0.65
761 0.7
762 0.8
763 0.88
764 0.93
765 0.94
766 0.95
767 0.95
768 0.96
769 0.96
770 0.97
771 0.97
772 0.97