FuNGI

P40010

Protein Details

Accession

P40010

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-53	MRVRKRQSRRTSTKLKEGIKKKASAHRKKEKKMAKKDVTWRSRSKKDPGIPSN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-47	RKRQSRRTSTKLKEGIKKKASAHRKKEKKMAKKDVTWRSRSKKD

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR030378 G_CP_dom IPR014813 Gnl3_N_dom IPR006073 GTP-bd IPR023179 GTP-bd_ortho_bundle_sf IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005634 C:nucleus GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0003729 F:mRNA binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
KEGG	sce:YER006W -
Pfam	View protein in Pfam PF08701 GN3L_Grn1 PF01926 MMR_HSR1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51721 G_CP
CDD	cd04178 Nucleostemin_like

Amino Acid Sequences

MRVRKRQSRRTSTKLKEGIKKKASAHRKKEKKMAKKDVTWRSRSKKDPGIPSNFPYKAKILEEIEAKKMKDLEERELAKQQRLEARKAAKEQGVDAMDEDMIEDDENGLAALVESAQQAAAEYEGTPSNDADVRDDELDVIDYNIDFYGEDVEGESELEKSRKAYDKIFKSVIDASDVILYVLDARDPESTRSRKVEEAVLQSQGKRLILILNKVDLIPPHVLEQWLNYLKSSFPTIPLRASSGAVNGTSFNRKLSQTTTASALLESLKTYSNNSNLKRSIVVGVIGYPNVGKSSVINALLARRGGQSKACPVGNEAGVTTSLREIKIDNKLKILDSPGICFPSENKKRSKVEHEAELALLNALPAKHIVDPYPAVLMLVKRLAKSDEMTESFKKLYEIPPIPANDADTFTKHFLIHVARKRGRLGKGGIPNLASAGLSVLNDWRDGKILGWVLPNTSAAASQQDKQNLSTINTGTKQAPIAANESTIVSEWSKEFDLDGLFSSLDKAIDASKDQDTMME

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.87
2	0.85
3	0.84
4	0.83
5	0.83
6	0.8
7	0.79
8	0.76
9	0.77
10	0.79
11	0.8
12	0.82
13	0.82
14	0.85
15	0.87
16	0.9
17	0.91
18	0.9
19	0.91
20	0.91
21	0.89
22	0.88
23	0.9
24	0.9
25	0.89
26	0.87
27	0.86
28	0.84
29	0.84
30	0.81
31	0.8
32	0.79
33	0.78
34	0.8
35	0.79
36	0.79
37	0.74
38	0.71
39	0.72
40	0.65
41	0.59
42	0.51
43	0.45
44	0.41
45	0.38
46	0.4
47	0.33
48	0.34
49	0.39
50	0.39
51	0.43
52	0.43
53	0.41
54	0.38
55	0.37
56	0.35
57	0.35
58	0.36
59	0.36
60	0.4
61	0.44
62	0.44
63	0.51
64	0.51
65	0.48
66	0.46
67	0.45
68	0.44
69	0.45
70	0.46
71	0.46
72	0.51
73	0.53
74	0.55
75	0.56
76	0.5
77	0.47
78	0.43
79	0.42
80	0.35
81	0.29
82	0.25
83	0.2
84	0.16
85	0.15
86	0.14
87	0.07
88	0.07
89	0.06
90	0.06
91	0.05
92	0.05
93	0.05
94	0.05
95	0.04
96	0.03
97	0.03
98	0.03
99	0.03
100	0.04
101	0.04
102	0.05
103	0.05
104	0.04
105	0.05
106	0.05
107	0.05
108	0.05
109	0.05
110	0.07
111	0.08
112	0.09
113	0.1
114	0.09
115	0.11
116	0.13
117	0.13
118	0.14
119	0.14
120	0.16
121	0.16
122	0.16
123	0.14
124	0.12
125	0.12
126	0.1
127	0.08
128	0.06
129	0.05
130	0.06
131	0.06
132	0.05
133	0.04
134	0.04
135	0.06
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.07
140	0.07
141	0.07
142	0.07
143	0.06
144	0.07
145	0.08
146	0.08
147	0.09
148	0.15
149	0.22
150	0.24
151	0.31
152	0.39
153	0.45
154	0.5
155	0.52
156	0.46
157	0.42
158	0.43
159	0.35
160	0.29
161	0.22
162	0.17
163	0.15
164	0.15
165	0.12
166	0.09
167	0.08
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.04
172	0.05
173	0.08
174	0.09
175	0.13
176	0.21
177	0.23
178	0.27
179	0.31
180	0.32
181	0.31
182	0.32
183	0.34
184	0.31
185	0.35
186	0.33
187	0.33
188	0.32
189	0.3
190	0.3
191	0.26
192	0.21
193	0.15
194	0.13
195	0.14
196	0.15
197	0.19
198	0.18
199	0.17
200	0.17
201	0.17
202	0.17
203	0.13
204	0.14
205	0.11
206	0.1
207	0.11
208	0.11
209	0.12
210	0.11
211	0.12
212	0.15
213	0.17
214	0.16
215	0.15
216	0.15
217	0.15
218	0.16
219	0.18
220	0.12
221	0.13
222	0.17
223	0.18
224	0.19
225	0.2
226	0.21
227	0.18
228	0.19
229	0.15
230	0.12
231	0.11
232	0.1
233	0.1
234	0.09
235	0.09
236	0.11
237	0.11
238	0.11
239	0.13
240	0.13
241	0.14
242	0.16
243	0.2
244	0.2
245	0.2
246	0.22
247	0.2
248	0.2
249	0.18
250	0.16
251	0.11
252	0.09
253	0.08
254	0.06
255	0.07
256	0.07
257	0.09
258	0.11
259	0.18
260	0.24
261	0.26
262	0.31
263	0.31
264	0.31
265	0.3
266	0.28
267	0.23
268	0.17
269	0.16
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.09
274	0.08
275	0.06
276	0.06
277	0.05
278	0.06
279	0.04
280	0.04
281	0.07
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.11
286	0.12
287	0.13
288	0.13
289	0.11
290	0.1
291	0.11
292	0.12
293	0.14
294	0.15
295	0.18
296	0.22
297	0.22
298	0.2
299	0.21
300	0.23
301	0.21
302	0.19
303	0.14
304	0.11
305	0.11
306	0.11
307	0.09
308	0.08
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.14
314	0.24
315	0.3
316	0.29
317	0.31
318	0.32
319	0.32
320	0.33
321	0.31
322	0.26
323	0.2
324	0.22
325	0.21
326	0.22
327	0.21
328	0.19
329	0.19
330	0.25
331	0.33
332	0.35
333	0.39
334	0.46
335	0.5
336	0.56
337	0.62
338	0.61
339	0.57
340	0.58
341	0.56
342	0.48
343	0.44
344	0.38
345	0.3
346	0.2
347	0.15
348	0.08
349	0.06
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.07
354	0.08
355	0.09
356	0.1
357	0.12
358	0.13
359	0.14
360	0.14
361	0.13
362	0.11
363	0.12
364	0.11
365	0.1
366	0.14
367	0.15
368	0.14
369	0.16
370	0.18
371	0.18
372	0.19
373	0.21
374	0.22
375	0.24
376	0.29
377	0.29
378	0.3
379	0.28
380	0.27
381	0.25
382	0.21
383	0.22
384	0.27
385	0.28
386	0.29
387	0.33
388	0.34
389	0.35
390	0.33
391	0.32
392	0.23
393	0.24
394	0.22
395	0.19
396	0.21
397	0.2
398	0.22
399	0.19
400	0.18
401	0.19
402	0.25
403	0.32
404	0.38
405	0.47
406	0.49
407	0.53
408	0.59
409	0.62
410	0.59
411	0.57
412	0.53
413	0.51
414	0.56
415	0.56
416	0.52
417	0.45
418	0.41
419	0.34
420	0.29
421	0.2
422	0.11
423	0.09
424	0.08
425	0.07
426	0.07
427	0.09
428	0.09
429	0.11
430	0.12
431	0.11
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.16
436	0.18
437	0.19
438	0.22
439	0.22
440	0.21
441	0.22
442	0.22
443	0.17
444	0.16
445	0.14
446	0.1
447	0.16
448	0.17
449	0.2
450	0.25
451	0.3
452	0.31
453	0.32
454	0.37
455	0.33
456	0.34
457	0.35
458	0.32
459	0.33
460	0.33
461	0.35
462	0.3
463	0.3
464	0.28
465	0.26
466	0.28
467	0.23
468	0.25
469	0.23
470	0.22
471	0.21
472	0.2
473	0.17
474	0.14
475	0.14
476	0.11
477	0.13
478	0.12
479	0.15
480	0.16
481	0.15
482	0.15
483	0.15
484	0.16
485	0.15
486	0.16
487	0.14
488	0.13
489	0.13
490	0.14
491	0.13
492	0.12
493	0.11
494	0.1
495	0.11
496	0.14
497	0.16
498	0.18
499	0.19
500	0.2

P40010

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer