Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P39970

Protein Details
Accession P39970    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
392-418ERNRIAASKCRQRKKMSQLQLQREFDQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
386-388KRA
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004827  bZIP  
IPR046347  bZIP_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YER045C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00170  bZIP_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50217  BZIP  
PS00036  BZIP_BASIC  
CDD cd14687  bZIP_ATF2  
Amino Acid Sequences MDYKHNFATSPDSFLDGRQNPLLYTDFLSSNKELIYKQPSGPGLVDSAYNFHHQNSLHDRSVQENLGPMFQPFGVDISHLPITNPPIFQSSLPAFDQPVYKRRISISNGQISQLGEDLETVENLYNCQPPILSSKAQQNPNPQQVANPSAAIYPSFSSNELQNVPQPHEQATVIPEAAPQTGSKNIYAAMTPYDSNIKLNIPAVAATCDIPSATPSIPSGDSTMNQAYINMQLRLQAQMQTKAWKNAQLNVHPCTPASNSSVSSSSSCQNINDHNIENQSVHSSISHGVNHHTVNNSCQNAELNISSSLPYESKCPDVNLTHANSKPQYKDATSALKNNINSEKDVHTAPFSSMHTTATFQIKQEARPQKIENNTAGLKDGAKAWKRARLLERNRIAASKCRQRKKMSQLQLQREFDQISKENTMMKKKIENYEKLVQKMKKISRLHMQECTINGGNNSYQSLQNKDSDVNGFLKMIEEMIRSSSLYDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.36
3 0.31
4 0.33
5 0.32
6 0.32
7 0.28
8 0.31
9 0.31
10 0.24
11 0.24
12 0.22
13 0.21
14 0.22
15 0.27
16 0.24
17 0.24
18 0.23
19 0.22
20 0.21
21 0.25
22 0.31
23 0.31
24 0.31
25 0.36
26 0.36
27 0.37
28 0.37
29 0.31
30 0.25
31 0.21
32 0.21
33 0.15
34 0.16
35 0.15
36 0.17
37 0.17
38 0.16
39 0.2
40 0.19
41 0.26
42 0.32
43 0.37
44 0.37
45 0.39
46 0.39
47 0.39
48 0.43
49 0.37
50 0.29
51 0.26
52 0.25
53 0.24
54 0.24
55 0.2
56 0.16
57 0.15
58 0.15
59 0.11
60 0.11
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.12
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.15
69 0.21
70 0.23
71 0.23
72 0.2
73 0.21
74 0.22
75 0.22
76 0.25
77 0.22
78 0.22
79 0.23
80 0.23
81 0.2
82 0.21
83 0.27
84 0.25
85 0.3
86 0.32
87 0.31
88 0.33
89 0.35
90 0.41
91 0.4
92 0.45
93 0.47
94 0.5
95 0.5
96 0.49
97 0.48
98 0.4
99 0.36
100 0.27
101 0.18
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.11
116 0.11
117 0.17
118 0.2
119 0.2
120 0.21
121 0.31
122 0.38
123 0.44
124 0.46
125 0.52
126 0.56
127 0.61
128 0.6
129 0.51
130 0.46
131 0.44
132 0.43
133 0.34
134 0.26
135 0.19
136 0.16
137 0.17
138 0.14
139 0.12
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.18
150 0.19
151 0.22
152 0.24
153 0.24
154 0.22
155 0.22
156 0.21
157 0.19
158 0.18
159 0.15
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.12
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.12
207 0.1
208 0.1
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.13
216 0.15
217 0.12
218 0.12
219 0.13
220 0.14
221 0.16
222 0.16
223 0.17
224 0.17
225 0.2
226 0.21
227 0.24
228 0.25
229 0.27
230 0.27
231 0.28
232 0.27
233 0.29
234 0.33
235 0.33
236 0.35
237 0.34
238 0.35
239 0.29
240 0.28
241 0.24
242 0.21
243 0.17
244 0.16
245 0.15
246 0.14
247 0.15
248 0.16
249 0.15
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.13
256 0.14
257 0.16
258 0.19
259 0.2
260 0.19
261 0.19
262 0.19
263 0.19
264 0.18
265 0.15
266 0.13
267 0.11
268 0.1
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.12
273 0.13
274 0.12
275 0.13
276 0.16
277 0.16
278 0.17
279 0.18
280 0.16
281 0.19
282 0.24
283 0.23
284 0.2
285 0.2
286 0.19
287 0.17
288 0.18
289 0.15
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.14
301 0.15
302 0.16
303 0.18
304 0.19
305 0.22
306 0.24
307 0.26
308 0.29
309 0.29
310 0.32
311 0.31
312 0.34
313 0.33
314 0.31
315 0.32
316 0.27
317 0.3
318 0.3
319 0.35
320 0.33
321 0.37
322 0.38
323 0.39
324 0.38
325 0.39
326 0.41
327 0.34
328 0.32
329 0.3
330 0.28
331 0.25
332 0.26
333 0.22
334 0.18
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.16
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.17
343 0.17
344 0.2
345 0.23
346 0.23
347 0.2
348 0.27
349 0.27
350 0.29
351 0.37
352 0.44
353 0.41
354 0.46
355 0.49
356 0.48
357 0.53
358 0.56
359 0.48
360 0.44
361 0.42
362 0.36
363 0.35
364 0.28
365 0.22
366 0.17
367 0.2
368 0.22
369 0.24
370 0.31
371 0.33
372 0.39
373 0.41
374 0.48
375 0.52
376 0.55
377 0.62
378 0.65
379 0.68
380 0.66
381 0.66
382 0.62
383 0.55
384 0.53
385 0.53
386 0.53
387 0.57
388 0.6
389 0.67
390 0.71
391 0.79
392 0.81
393 0.82
394 0.82
395 0.83
396 0.83
397 0.86
398 0.87
399 0.81
400 0.72
401 0.65
402 0.56
403 0.47
404 0.44
405 0.37
406 0.31
407 0.3
408 0.29
409 0.32
410 0.36
411 0.43
412 0.4
413 0.41
414 0.45
415 0.49
416 0.58
417 0.6
418 0.61
419 0.6
420 0.65
421 0.67
422 0.65
423 0.67
424 0.61
425 0.59
426 0.63
427 0.63
428 0.63
429 0.62
430 0.64
431 0.65
432 0.72
433 0.7
434 0.67
435 0.63
436 0.58
437 0.54
438 0.54
439 0.46
440 0.37
441 0.32
442 0.28
443 0.26
444 0.24
445 0.25
446 0.2
447 0.23
448 0.26
449 0.31
450 0.31
451 0.33
452 0.34
453 0.33
454 0.34
455 0.32
456 0.31
457 0.28
458 0.26
459 0.22
460 0.2
461 0.2
462 0.16
463 0.15
464 0.14
465 0.13
466 0.13
467 0.15
468 0.16
469 0.15