FuNGI

A7TH36

Protein Details

Accession

A7TH36

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
39-59	NNPNERSKKAPTPRFEKPKSS	Hydrophilic
337-365	DLPTIKTQTKGNKKRKERRKKGAMSDISG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
346-358	KGNKKRKERRKKG
439-467	KLAKKDSERDRLKAAADEASKGKLSMRRK

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
KEGG	vpo:Kpol_1032p85 -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MSKKFDKKNSQKYAVVHRPHDDPRFYDAEASDHILVPINNPNERSKKAPTPRFEKPKSSANRDAANAHAGESALYGITFDDSKYDYTQHLKPIGLDPENSVFIPVKSNAVDDENEKLQKKKNIEDLFVEPSYRDEAKPQASAPLFQRGMATAEYLKHQEEISNDISGFRPDLNPALREVLEALEDEAYVINEDIEVVVDDKSKVKKSKEAKVENTEELEGDDDFFAELLGGGEAADEDEFEDEFDEWDVDNLQDYEDEHYRDEIEKLDNIENLEDLQGIDYQADVRRFQREKARARKEYDTDDDFSQDDLESIEPLEDDLAGELENEDEEEEDVLGDLPTIKTQTKGNKKRKERRKKGAMSDISGFSMSSSAIARTEVMTVLDDKYDTIINSYDNYEEEQEIDEEENYTPFDMKEERADFESLLDDFLDNYELESGGRKLAKKDSERDRLKAAADEASKGKLSMRRKRENMVNAAANSLQSLHL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.76
3	0.7
4	0.64
5	0.63
6	0.65
7	0.67
8	0.59
9	0.53
10	0.51
11	0.5
12	0.46
13	0.43
14	0.36
15	0.31
16	0.29
17	0.3
18	0.25
19	0.22
20	0.21
21	0.2
22	0.19
23	0.19
24	0.24
25	0.25
26	0.26
27	0.28
28	0.36
29	0.39
30	0.43
31	0.46
32	0.46
33	0.52
34	0.6
35	0.67
36	0.68
37	0.69
38	0.77
39	0.82
40	0.8
41	0.79
42	0.73
43	0.74
44	0.74
45	0.75
46	0.74
47	0.69
48	0.68
49	0.62
50	0.59
51	0.51
52	0.46
53	0.37
54	0.28
55	0.23
56	0.18
57	0.15
58	0.13
59	0.11
60	0.07
61	0.07
62	0.06
63	0.05
64	0.06
65	0.06
66	0.06
67	0.07
68	0.09
69	0.11
70	0.13
71	0.14
72	0.16
73	0.21
74	0.25
75	0.29
76	0.31
77	0.3
78	0.3
79	0.34
80	0.38
81	0.34
82	0.31
83	0.28
84	0.28
85	0.29
86	0.27
87	0.23
88	0.17
89	0.16
90	0.19
91	0.17
92	0.16
93	0.15
94	0.16
95	0.15
96	0.17
97	0.18
98	0.15
99	0.19
100	0.21
101	0.25
102	0.26
103	0.28
104	0.33
105	0.38
106	0.41
107	0.43
108	0.49
109	0.49
110	0.5
111	0.51
112	0.48
113	0.48
114	0.43
115	0.37
116	0.27
117	0.24
118	0.25
119	0.22
120	0.18
121	0.15
122	0.2
123	0.23
124	0.25
125	0.24
126	0.26
127	0.26
128	0.28
129	0.28
130	0.31
131	0.28
132	0.27
133	0.27
134	0.21
135	0.22
136	0.19
137	0.18
138	0.11
139	0.12
140	0.13
141	0.14
142	0.14
143	0.13
144	0.13
145	0.13
146	0.13
147	0.17
148	0.17
149	0.16
150	0.16
151	0.16
152	0.16
153	0.15
154	0.14
155	0.1
156	0.09
157	0.09
158	0.13
159	0.14
160	0.14
161	0.15
162	0.17
163	0.16
164	0.16
165	0.15
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.08
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.05
174	0.05
175	0.05
176	0.04
177	0.04
178	0.03
179	0.03
180	0.03
181	0.03
182	0.03
183	0.04
184	0.04
185	0.05
186	0.06
187	0.1
188	0.13
189	0.18
190	0.23
191	0.25
192	0.32
193	0.39
194	0.47
195	0.54
196	0.59
197	0.6
198	0.63
199	0.65
200	0.58
201	0.53
202	0.44
203	0.34
204	0.26
205	0.2
206	0.12
207	0.08
208	0.07
209	0.05
210	0.05
211	0.04
212	0.04
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.02
218	0.02
219	0.02
220	0.02
221	0.03
222	0.02
223	0.02
224	0.02
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.04
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.08
243	0.09
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.11
248	0.12
249	0.12
250	0.11
251	0.11
252	0.11
253	0.13
254	0.14
255	0.14
256	0.14
257	0.13
258	0.12
259	0.11
260	0.09
261	0.07
262	0.06
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.06
269	0.09
270	0.1
271	0.11
272	0.12
273	0.2
274	0.22
275	0.26
276	0.34
277	0.4
278	0.49
279	0.58
280	0.67
281	0.65
282	0.69
283	0.72
284	0.66
285	0.63
286	0.59
287	0.52
288	0.44
289	0.38
290	0.34
291	0.28
292	0.24
293	0.19
294	0.13
295	0.09
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.05
325	0.05
326	0.06
327	0.08
328	0.08
329	0.09
330	0.14
331	0.24
332	0.35
333	0.46
334	0.56
335	0.64
336	0.75
337	0.84
338	0.91
339	0.92
340	0.92
341	0.93
342	0.93
343	0.92
344	0.91
345	0.91
346	0.85
347	0.77
348	0.7
349	0.6
350	0.5
351	0.41
352	0.31
353	0.2
354	0.15
355	0.11
356	0.08
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.09
372	0.1
373	0.11
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.11
378	0.12
379	0.13
380	0.13
381	0.12
382	0.14
383	0.14
384	0.14
385	0.13
386	0.13
387	0.12
388	0.13
389	0.13
390	0.11
391	0.11
392	0.11
393	0.11
394	0.1
395	0.11
396	0.1
397	0.09
398	0.12
399	0.13
400	0.14
401	0.22
402	0.23
403	0.25
404	0.27
405	0.28
406	0.25
407	0.24
408	0.24
409	0.16
410	0.15
411	0.13
412	0.1
413	0.09
414	0.09
415	0.1
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.11
422	0.11
423	0.14
424	0.19
425	0.2
426	0.24
427	0.32
428	0.41
429	0.45
430	0.54
431	0.59
432	0.66
433	0.71
434	0.7
435	0.67
436	0.62
437	0.57
438	0.52
439	0.44
440	0.4
441	0.35
442	0.35
443	0.32
444	0.31
445	0.29
446	0.25
447	0.28
448	0.28
449	0.37
450	0.43
451	0.52
452	0.59
453	0.64
454	0.73
455	0.77
456	0.8
457	0.78
458	0.76
459	0.72
460	0.62
461	0.59
462	0.51
463	0.41
464	0.32

A7TH36

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer