Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q08237

Protein Details
Accession Q08237    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-43SESNPTSNGKNKQSNRKIRNVKKVSKTVNVSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 18.5, mito_nucl 13.5, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR037431  REX4_DEDDh_dom  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG sce:YOL080C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
CDD cd06144  REX4_like  
Amino Acid Sequences MALSSNWQALLASESNPTSNGKNKQSNRKIRNVKKVSKTVNVSSTTQYAPRKRKNGSKIMDMVYNMNKEISKHEKDKLEGKVFEFNPNKANTSTTIKEPVKVGISEDTRINSNKSKEIGKYIAMDCEFVGVGPEGKESALARISIVNYFGHVVLDEFVKPREKVVEWRTWVSGIKPEHMKNAITFKEAQKKTADILEGRILVGHALKHDLEALMLSHPKSLLRDTSRHLPFRKLYAKGKTPSLKKLTREVLKISIQEGEHSSVEDARATMLLYKKEKTEFEKIHRNTFN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.18
4 0.2
5 0.19
6 0.26
7 0.33
8 0.4
9 0.49
10 0.57
11 0.67
12 0.76
13 0.83
14 0.82
15 0.85
16 0.87
17 0.87
18 0.9
19 0.89
20 0.88
21 0.86
22 0.88
23 0.84
24 0.82
25 0.78
26 0.72
27 0.69
28 0.63
29 0.55
30 0.48
31 0.45
32 0.38
33 0.37
34 0.4
35 0.42
36 0.49
37 0.55
38 0.61
39 0.65
40 0.73
41 0.76
42 0.78
43 0.74
44 0.72
45 0.68
46 0.63
47 0.59
48 0.5
49 0.45
50 0.39
51 0.35
52 0.27
53 0.23
54 0.21
55 0.19
56 0.24
57 0.28
58 0.3
59 0.33
60 0.39
61 0.42
62 0.45
63 0.51
64 0.53
65 0.52
66 0.48
67 0.46
68 0.48
69 0.45
70 0.51
71 0.46
72 0.4
73 0.37
74 0.37
75 0.37
76 0.29
77 0.29
78 0.23
79 0.27
80 0.27
81 0.25
82 0.32
83 0.3
84 0.31
85 0.31
86 0.3
87 0.25
88 0.23
89 0.22
90 0.19
91 0.2
92 0.2
93 0.2
94 0.19
95 0.19
96 0.2
97 0.21
98 0.21
99 0.21
100 0.23
101 0.25
102 0.27
103 0.26
104 0.3
105 0.29
106 0.25
107 0.27
108 0.24
109 0.25
110 0.22
111 0.21
112 0.16
113 0.14
114 0.12
115 0.08
116 0.08
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.13
150 0.21
151 0.25
152 0.32
153 0.32
154 0.34
155 0.34
156 0.32
157 0.32
158 0.25
159 0.26
160 0.2
161 0.21
162 0.25
163 0.25
164 0.27
165 0.29
166 0.29
167 0.25
168 0.3
169 0.27
170 0.24
171 0.26
172 0.27
173 0.35
174 0.35
175 0.35
176 0.3
177 0.3
178 0.29
179 0.3
180 0.27
181 0.17
182 0.2
183 0.2
184 0.19
185 0.17
186 0.16
187 0.13
188 0.11
189 0.11
190 0.09
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.12
206 0.13
207 0.15
208 0.2
209 0.23
210 0.27
211 0.31
212 0.41
213 0.47
214 0.52
215 0.52
216 0.52
217 0.5
218 0.55
219 0.58
220 0.55
221 0.56
222 0.58
223 0.64
224 0.6
225 0.67
226 0.66
227 0.64
228 0.67
229 0.68
230 0.65
231 0.61
232 0.66
233 0.66
234 0.65
235 0.63
236 0.58
237 0.56
238 0.54
239 0.51
240 0.43
241 0.38
242 0.32
243 0.3
244 0.28
245 0.26
246 0.21
247 0.21
248 0.21
249 0.17
250 0.18
251 0.16
252 0.13
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.14
257 0.17
258 0.23
259 0.27
260 0.29
261 0.33
262 0.37
263 0.42
264 0.44
265 0.5
266 0.52
267 0.57
268 0.66
269 0.65