Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q02555

Protein Details
Accession Q02555    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MGSKVAGKKKTQNDNKLDNENGHydrophilic
450-471RSESVLKDPSQKNKKRKFSDTSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014720  dsRBD_dom  
IPR040540  RNase_3_N  
IPR011907  RNase_III  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
IPR044449  Rnt1/Pac1_DSRM_fungi  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0034963  P:box C/D RNA processing  
GO:0034964  P:box H/ACA RNA processing  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0070125  P:mitochondrial translational elongation  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0060237  P:regulation of fungal-type cell wall organization  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0009303  P:rRNA transcription  
GO:0030847  P:termination of RNA polymerase II transcription, exosome-dependent  
GO:0034473  P:U1 snRNA 3'-end processing  
GO:0034475  P:U4 snRNA 3'-end processing  
GO:0034476  P:U5 snRNA 3'-end processing  
KEGG sce:YMR239C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00035  dsrm  
PF00636  Ribonuclease_3  
PF18497  RNase_3_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50137  DS_RBD  
PS00517  RNASE_3_1  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd19876  DSRM_RNT1p-like  
cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences MGSKVAGKKKTQNDNKLDNENGSQQRENINTKTLLKGNLKISNYKYLEVIQLEHAVTKLVESYNKIIELSPNLVAYNEAVNNQDRVPVQILPSLSRYQLKLAAELKTLHDLKKDAILTEITDYENEFDTEQKQPILQEISKADMEKLEKLEQVKREKREKIDVNVYENLNEKEDEEEDEGEDSYDPTKAGDIVKATKWPPKLPEIQDLAIRARVFIHKSTIKDKVYLSGSEMINAHNERLEFLGDSILNSVMTLIIYNKFPDYSEGQLSTLRMNLVSNEQIKQWSIMYNFHEKLKTNFDLKDENSNFQNGKLKLYADVFEAYIGGLMEDDPRNNLPKIRKWLRKLAKPVIEEATRNQVALEKTDKLDMNAKRQLYSLIGYASLRLHYVTVKKPTAVDPNSIVECRVGDGTVLGTGVGRNIKIAGIRAAENALRDKKMLDFYAKQRAAIPRSESVLKDPSQKNKKRKFSDTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.83
3 0.8
4 0.73
5 0.66
6 0.59
7 0.57
8 0.55
9 0.5
10 0.45
11 0.4
12 0.44
13 0.47
14 0.49
15 0.43
16 0.42
17 0.4
18 0.41
19 0.45
20 0.42
21 0.44
22 0.42
23 0.46
24 0.48
25 0.51
26 0.52
27 0.53
28 0.53
29 0.55
30 0.53
31 0.47
32 0.41
33 0.36
34 0.38
35 0.32
36 0.3
37 0.22
38 0.24
39 0.23
40 0.22
41 0.2
42 0.16
43 0.14
44 0.12
45 0.13
46 0.11
47 0.14
48 0.16
49 0.2
50 0.22
51 0.23
52 0.23
53 0.21
54 0.22
55 0.23
56 0.23
57 0.21
58 0.19
59 0.18
60 0.17
61 0.17
62 0.15
63 0.15
64 0.13
65 0.12
66 0.14
67 0.15
68 0.17
69 0.17
70 0.2
71 0.16
72 0.18
73 0.2
74 0.19
75 0.19
76 0.21
77 0.21
78 0.2
79 0.23
80 0.21
81 0.21
82 0.23
83 0.22
84 0.22
85 0.26
86 0.24
87 0.27
88 0.28
89 0.28
90 0.28
91 0.28
92 0.28
93 0.3
94 0.31
95 0.27
96 0.27
97 0.25
98 0.24
99 0.29
100 0.28
101 0.21
102 0.2
103 0.2
104 0.18
105 0.18
106 0.19
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.09
114 0.09
115 0.12
116 0.15
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.14
121 0.17
122 0.22
123 0.19
124 0.2
125 0.2
126 0.23
127 0.23
128 0.23
129 0.2
130 0.18
131 0.2
132 0.19
133 0.21
134 0.2
135 0.21
136 0.23
137 0.28
138 0.32
139 0.41
140 0.45
141 0.5
142 0.56
143 0.6
144 0.62
145 0.67
146 0.66
147 0.62
148 0.65
149 0.6
150 0.56
151 0.54
152 0.49
153 0.41
154 0.38
155 0.32
156 0.23
157 0.2
158 0.16
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.09
178 0.1
179 0.13
180 0.14
181 0.17
182 0.19
183 0.22
184 0.24
185 0.25
186 0.26
187 0.29
188 0.35
189 0.35
190 0.4
191 0.39
192 0.38
193 0.37
194 0.36
195 0.31
196 0.26
197 0.23
198 0.16
199 0.13
200 0.15
201 0.15
202 0.14
203 0.19
204 0.2
205 0.22
206 0.26
207 0.32
208 0.3
209 0.31
210 0.3
211 0.29
212 0.28
213 0.26
214 0.23
215 0.22
216 0.21
217 0.2
218 0.2
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.14
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.06
229 0.06
230 0.08
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.1
249 0.11
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.16
255 0.17
256 0.15
257 0.13
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.12
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.15
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.16
274 0.19
275 0.26
276 0.26
277 0.28
278 0.3
279 0.27
280 0.29
281 0.32
282 0.32
283 0.28
284 0.28
285 0.29
286 0.32
287 0.32
288 0.39
289 0.34
290 0.33
291 0.31
292 0.33
293 0.3
294 0.27
295 0.34
296 0.24
297 0.25
298 0.24
299 0.23
300 0.22
301 0.24
302 0.22
303 0.16
304 0.16
305 0.14
306 0.12
307 0.11
308 0.09
309 0.08
310 0.07
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.1
318 0.11
319 0.15
320 0.16
321 0.21
322 0.25
323 0.32
324 0.42
325 0.5
326 0.58
327 0.6
328 0.7
329 0.75
330 0.77
331 0.78
332 0.77
333 0.75
334 0.68
335 0.65
336 0.6
337 0.53
338 0.46
339 0.39
340 0.38
341 0.31
342 0.29
343 0.26
344 0.24
345 0.22
346 0.25
347 0.26
348 0.2
349 0.21
350 0.25
351 0.26
352 0.23
353 0.31
354 0.31
355 0.36
356 0.39
357 0.39
358 0.36
359 0.36
360 0.35
361 0.29
362 0.27
363 0.2
364 0.15
365 0.15
366 0.14
367 0.15
368 0.15
369 0.13
370 0.12
371 0.1
372 0.1
373 0.13
374 0.19
375 0.24
376 0.31
377 0.33
378 0.34
379 0.35
380 0.4
381 0.46
382 0.42
383 0.39
384 0.35
385 0.38
386 0.4
387 0.38
388 0.33
389 0.24
390 0.22
391 0.19
392 0.17
393 0.12
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.08
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.09
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.12
408 0.13
409 0.15
410 0.16
411 0.17
412 0.18
413 0.18
414 0.21
415 0.21
416 0.21
417 0.27
418 0.28
419 0.27
420 0.26
421 0.26
422 0.28
423 0.33
424 0.34
425 0.34
426 0.36
427 0.42
428 0.52
429 0.52
430 0.48
431 0.49
432 0.54
433 0.5
434 0.49
435 0.48
436 0.41
437 0.45
438 0.49
439 0.44
440 0.41
441 0.44
442 0.4
443 0.45
444 0.47
445 0.53
446 0.6
447 0.69
448 0.74
449 0.78
450 0.86
451 0.86