Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38886

Protein Details
Accession P38886    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-257EEQQRQERLRQQQQQQDQPEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 11, nucl 9.5, cyto_nucl 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027040  PSMD4  
IPR003903  UIM_dom  
IPR002035  VWF_A  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000502  C:proteasome complex  
GO:0008540  C:proteasome regulatory particle, base subcomplex  
GO:0036435  F:K48-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding  
GO:0031593  F:polyubiquitin modification-dependent protein binding  
GO:0043248  P:proteasome assembly  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG sce:YHR200W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13519  VWA_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
PS50234  VWFA  
CDD cd01452  VWA_26S_proteasome_subunit  
Amino Acid Sequences MVLEATVLVIDNSEYSRNGDFPRTRFEAQIDSVEFIFQAKRNSNPENTVGLISGAGANPRVLSTFTAEFGKILAGLHDTQIEGKLHMATALQIAQLTLKHRQNKVQHQRIVAFVCSPISDSRDELIRLAKTLKKNNVAVDIINFGEIEQNTELLDEFIAAVNNPQEETSHLLTVTPGPRLLYENIASSPIILEEGSSGMGAFGGSGGDSDANGTFMDFGVDPSMDPELAMALRLSMEEEQQRQERLRQQQQQQDQPEQSEQPEQHQDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.15
4 0.18
5 0.2
6 0.28
7 0.32
8 0.33
9 0.4
10 0.44
11 0.44
12 0.43
13 0.44
14 0.4
15 0.37
16 0.4
17 0.34
18 0.29
19 0.27
20 0.25
21 0.22
22 0.17
23 0.18
24 0.14
25 0.19
26 0.2
27 0.26
28 0.32
29 0.38
30 0.41
31 0.42
32 0.43
33 0.4
34 0.38
35 0.33
36 0.26
37 0.22
38 0.17
39 0.13
40 0.11
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.09
50 0.12
51 0.12
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.14
56 0.13
57 0.12
58 0.09
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.08
83 0.1
84 0.16
85 0.22
86 0.28
87 0.3
88 0.38
89 0.46
90 0.55
91 0.64
92 0.66
93 0.64
94 0.61
95 0.6
96 0.56
97 0.5
98 0.39
99 0.28
100 0.19
101 0.16
102 0.12
103 0.12
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.14
113 0.12
114 0.12
115 0.14
116 0.18
117 0.21
118 0.27
119 0.32
120 0.33
121 0.35
122 0.36
123 0.37
124 0.33
125 0.28
126 0.23
127 0.19
128 0.14
129 0.12
130 0.1
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.07
154 0.12
155 0.13
156 0.13
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.17
161 0.17
162 0.13
163 0.12
164 0.11
165 0.12
166 0.15
167 0.16
168 0.15
169 0.15
170 0.15
171 0.15
172 0.16
173 0.15
174 0.12
175 0.11
176 0.08
177 0.07
178 0.06
179 0.05
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.08
222 0.07
223 0.11
224 0.16
225 0.18
226 0.24
227 0.27
228 0.31
229 0.32
230 0.38
231 0.43
232 0.49
233 0.57
234 0.61
235 0.66
236 0.72
237 0.79
238 0.81
239 0.8
240 0.78
241 0.71
242 0.66
243 0.62
244 0.55
245 0.48
246 0.47
247 0.41
248 0.39