FuNGI

P38798

Protein Details

Accession

P38798

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1068-1089	EEEKLKTERNKIKKIVLKRSFD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0035145 C:exon-exon junction complex GO:0005844 C:polysome GO:0003723 F:RNA binding GO:0071026 P:cytoplasmic RNA surveillance GO:0006310 P:DNA recombination GO:0070478 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	sce:YHR077C -
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MDDGRKKELHDLNTRAWNGEEVFPLKSKKLDSSIKRNTGFIKKLKKGFVKGSESSLLKDLSEASLEKYLSEIIVTVTECLLNVLNKNDDVIAAVEIISGLHQRFNGRFTSPLLGAFLQAFENPSVDIESERDELQRITRVKGNLRVFTELYLVGVFRTLDDIESKDAIPNFLQKKTGRKDPLLFSILREILNYKFKLGFTTTIATAFIKKFAPLFRDDDNSWDDLIYDSKLKGALQSLFKNFIDATFARATELHKKVNKLQREHQKCQIRTGKLRDEYVEEYDKLLPIFIRFKTSAITLGEFFKLEIPELEGASNDDLKETASPMITNQILPPNQRLWENEDTRKFYEILPDISKTVEESQSSKTEKDSNVNSKNINLFFTDLEMADCKDIIDDLSNRYWSSYLDNKATRNRILKFFMETQDWSKLPVYSRFIATNSKYMPEIVSEFINYLDNGFRSQLHSNKINVKNIIFFSEMIKFQLIPSFMIFHKIRTLIMYMQVPNNVEILTVLLEHSGKFLLNKPEYKELMEKMVQLIKDKKNDRQLNMNMKSALENIITLLYPPSVKSLNVTVKTITPEQQFYRILIRSELSSLDFKHIVKLVRKAHWDDVAIQKVLFSLFSKPHKISYQNIPLLTKVLGGLYSYRRDFVIRCIDQVLENIERGLEINDYGQNMHRISNVRYLTEIFNFEMIKSDVLLDTIYHIIRFGHINNQPNPFYLNYSDPPDNYFRIQLVTTILLNINRTPAAFTKKCKLLLRFFEYYTFIKEQPLPKETEFRVSSTFKKYENIFGNTKFERSENLVESASRLESLLKSLNAIKSKDDRVKGSSASIHNGKESAVPIESITEDDEDEDDENDDGVDLLGEDEDAEISTPNTESAPGKHQAKQDESEDEDDEDDDEDDDDDDDDDDDDGEEGDEDDDEDDDDEDDDDEEEEDSDSDLEYGGDLDADRDIEMKRMYEEYERKLKDEEERKAEEELERQFQKMMQESIDARKSEKVVASKIPVISKPVSVQKPLLLKKSEEPSSSKETYEELSKPKKIAFTFLTKSGKKTQSRILQLPTDVKFVSDVLEEEEKLKTERNKIKKIVLKRSFD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.55
3	0.49
4	0.43
5	0.36
6	0.34
7	0.32
8	0.25
9	0.27
10	0.29
11	0.31
12	0.3
13	0.31
14	0.31
15	0.32
16	0.39
17	0.46
18	0.51
19	0.59
20	0.68
21	0.73
22	0.72
23	0.69
24	0.68
25	0.68
26	0.67
27	0.65
28	0.66
29	0.65
30	0.7
31	0.76
32	0.77
33	0.74
34	0.76
35	0.76
36	0.73
37	0.67
38	0.65
39	0.63
40	0.56
41	0.51
42	0.45
43	0.36
44	0.27
45	0.26
46	0.21
47	0.16
48	0.17
49	0.15
50	0.15
51	0.19
52	0.19
53	0.18
54	0.18
55	0.17
56	0.14
57	0.14
58	0.11
59	0.07
60	0.1
61	0.1
62	0.1
63	0.1
64	0.1
65	0.1
66	0.1
67	0.12
68	0.12
69	0.14
70	0.17
71	0.19
72	0.19
73	0.2
74	0.19
75	0.17
76	0.16
77	0.14
78	0.11
79	0.09
80	0.09
81	0.08
82	0.07
83	0.07
84	0.07
85	0.08
86	0.08
87	0.1
88	0.11
89	0.16
90	0.18
91	0.2
92	0.22
93	0.22
94	0.24
95	0.25
96	0.29
97	0.26
98	0.25
99	0.26
100	0.23
101	0.21
102	0.2
103	0.17
104	0.12
105	0.12
106	0.13
107	0.1
108	0.11
109	0.1
110	0.1
111	0.11
112	0.1
113	0.11
114	0.1
115	0.14
116	0.15
117	0.15
118	0.16
119	0.16
120	0.17
121	0.19
122	0.25
123	0.24
124	0.26
125	0.3
126	0.35
127	0.4
128	0.48
129	0.52
130	0.5
131	0.51
132	0.52
133	0.48
134	0.44
135	0.39
136	0.3
137	0.23
138	0.17
139	0.14
140	0.09
141	0.1
142	0.09
143	0.07
144	0.09
145	0.08
146	0.09
147	0.11
148	0.13
149	0.14
150	0.16
151	0.16
152	0.18
153	0.18
154	0.19
155	0.18
156	0.25
157	0.26
158	0.27
159	0.33
160	0.32
161	0.42
162	0.47
163	0.56
164	0.54
165	0.57
166	0.61
167	0.6
168	0.65
169	0.59
170	0.52
171	0.44
172	0.45
173	0.4
174	0.33
175	0.29
176	0.23
177	0.24
178	0.31
179	0.29
180	0.25
181	0.25
182	0.25
183	0.28
184	0.29
185	0.27
186	0.22
187	0.25
188	0.23
189	0.21
190	0.22
191	0.19
192	0.2
193	0.18
194	0.18
195	0.15
196	0.15
197	0.18
198	0.2
199	0.23
200	0.23
201	0.27
202	0.27
203	0.32
204	0.32
205	0.33
206	0.32
207	0.3
208	0.26
209	0.22
210	0.18
211	0.14
212	0.15
213	0.12
214	0.12
215	0.1
216	0.11
217	0.12
218	0.12
219	0.13
220	0.16
221	0.19
222	0.23
223	0.29
224	0.31
225	0.35
226	0.35
227	0.35
228	0.3
229	0.25
230	0.25
231	0.19
232	0.21
233	0.18
234	0.19
235	0.18
236	0.19
237	0.22
238	0.26
239	0.3
240	0.33
241	0.35
242	0.39
243	0.47
244	0.55
245	0.6
246	0.57
247	0.62
248	0.65
249	0.71
250	0.73
251	0.74
252	0.75
253	0.69
254	0.72
255	0.71
256	0.68
257	0.66
258	0.69
259	0.68
260	0.62
261	0.63
262	0.55
263	0.51
264	0.46
265	0.43
266	0.39
267	0.3
268	0.28
269	0.26
270	0.25
271	0.2
272	0.18
273	0.13
274	0.12
275	0.17
276	0.15
277	0.2
278	0.2
279	0.2
280	0.21
281	0.21
282	0.22
283	0.2
284	0.21
285	0.16
286	0.18
287	0.18
288	0.16
289	0.16
290	0.14
291	0.13
292	0.12
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.12
297	0.12
298	0.09
299	0.1
300	0.11
301	0.12
302	0.09
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.08
307	0.09
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.12
313	0.12
314	0.12
315	0.13
316	0.18
317	0.19
318	0.21
319	0.24
320	0.23
321	0.24
322	0.25
323	0.25
324	0.26
325	0.33
326	0.37
327	0.41
328	0.44
329	0.47
330	0.47
331	0.47
332	0.41
333	0.32
334	0.34
335	0.29
336	0.28
337	0.26
338	0.25
339	0.24
340	0.23
341	0.23
342	0.17
343	0.17
344	0.15
345	0.14
346	0.15
347	0.18
348	0.24
349	0.26
350	0.25
351	0.24
352	0.27
353	0.28
354	0.31
355	0.36
356	0.39
357	0.43
358	0.46
359	0.44
360	0.41
361	0.44
362	0.39
363	0.32
364	0.23
365	0.19
366	0.16
367	0.17
368	0.15
369	0.1
370	0.1
371	0.1
372	0.09
373	0.08
374	0.08
375	0.06
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.07
380	0.08
381	0.11
382	0.13
383	0.14
384	0.14
385	0.15
386	0.15
387	0.12
388	0.16
389	0.2
390	0.21
391	0.27
392	0.3
393	0.33
394	0.39
395	0.42
396	0.42
397	0.42
398	0.42
399	0.4
400	0.42
401	0.39
402	0.38
403	0.37
404	0.34
405	0.31
406	0.29
407	0.27
408	0.28
409	0.26
410	0.24
411	0.21
412	0.21
413	0.2
414	0.24
415	0.25
416	0.22
417	0.24
418	0.23
419	0.24
420	0.27
421	0.26
422	0.26
423	0.23
424	0.22
425	0.21
426	0.2
427	0.19
428	0.14
429	0.14
430	0.1
431	0.1
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.1
436	0.08
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.11
444	0.15
445	0.18
446	0.22
447	0.25
448	0.27
449	0.36
450	0.41
451	0.41
452	0.39
453	0.36
454	0.35
455	0.32
456	0.31
457	0.22
458	0.18
459	0.16
460	0.17
461	0.16
462	0.14
463	0.14
464	0.11
465	0.11
466	0.13
467	0.12
468	0.09
469	0.1
470	0.11
471	0.11
472	0.17
473	0.17
474	0.15
475	0.17
476	0.17
477	0.17
478	0.15
479	0.17
480	0.11
481	0.14
482	0.16
483	0.14
484	0.15
485	0.16
486	0.15
487	0.14
488	0.14
489	0.11
490	0.08
491	0.07
492	0.06
493	0.05
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.06
503	0.1
504	0.17
505	0.2
506	0.23
507	0.25
508	0.31
509	0.31
510	0.32
511	0.31
512	0.24
513	0.25
514	0.23
515	0.21
516	0.17
517	0.19
518	0.17
519	0.18
520	0.24
521	0.24
522	0.31
523	0.33
524	0.37
525	0.45
526	0.49
527	0.48
528	0.5
529	0.53
530	0.56
531	0.56
532	0.52
533	0.43
534	0.38
535	0.37
536	0.28
537	0.22
538	0.12
539	0.09
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.06
544	0.06
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.07
549	0.07
550	0.07
551	0.08
552	0.14
553	0.19
554	0.2
555	0.21
556	0.2
557	0.21
558	0.23
559	0.23
560	0.21
561	0.17
562	0.19
563	0.19
564	0.23
565	0.22
566	0.21
567	0.24
568	0.22
569	0.2
570	0.18
571	0.18
572	0.14
573	0.14
574	0.14
575	0.11
576	0.11
577	0.11
578	0.12
579	0.14
580	0.13
581	0.14
582	0.17
583	0.19
584	0.21
585	0.28
586	0.31
587	0.33
588	0.37
589	0.38
590	0.38
591	0.37
592	0.34
593	0.3
594	0.31
595	0.3
596	0.27
597	0.23
598	0.2
599	0.17
600	0.16
601	0.14
602	0.08
603	0.08
604	0.13
605	0.17
606	0.21
607	0.21
608	0.25
609	0.28
610	0.3
611	0.31
612	0.35
613	0.41
614	0.41
615	0.41
616	0.38
617	0.35
618	0.33
619	0.29
620	0.2
621	0.11
622	0.07
623	0.06
624	0.06
625	0.09
626	0.1
627	0.14
628	0.14
629	0.14
630	0.14
631	0.15
632	0.16
633	0.19
634	0.27
635	0.23
636	0.24
637	0.25
638	0.25
639	0.24
640	0.24
641	0.22
642	0.13
643	0.12
644	0.11
645	0.1
646	0.09
647	0.09
648	0.09
649	0.06
650	0.05
651	0.06
652	0.07
653	0.08
654	0.09
655	0.09
656	0.12
657	0.12
658	0.12
659	0.14
660	0.16
661	0.18
662	0.25
663	0.25
664	0.22
665	0.23
666	0.24
667	0.23
668	0.22
669	0.21
670	0.14
671	0.15
672	0.14
673	0.13
674	0.14
675	0.13
676	0.11
677	0.1
678	0.1
679	0.08
680	0.08
681	0.08
682	0.05
683	0.06
684	0.08
685	0.08
686	0.07
687	0.08
688	0.07
689	0.08
690	0.1
691	0.09
692	0.16
693	0.2
694	0.27
695	0.31
696	0.35
697	0.35
698	0.34
699	0.35
700	0.28
701	0.26
702	0.21
703	0.21
704	0.19
705	0.23
706	0.24
707	0.22
708	0.25
709	0.25
710	0.25
711	0.22
712	0.21
713	0.16
714	0.17
715	0.17
716	0.14
717	0.13
718	0.12
719	0.11
720	0.11
721	0.12
722	0.11
723	0.12
724	0.12
725	0.12
726	0.1
727	0.1
728	0.11
729	0.14
730	0.22
731	0.24
732	0.27
733	0.33
734	0.38
735	0.44
736	0.48
737	0.51
738	0.5
739	0.56
740	0.59
741	0.55
742	0.5
743	0.47
744	0.44
745	0.4
746	0.36
747	0.3
748	0.23
749	0.23
750	0.27
751	0.3
752	0.32
753	0.34
754	0.33
755	0.32
756	0.39
757	0.37
758	0.41
759	0.37
760	0.33
761	0.35
762	0.34
763	0.37
764	0.37
765	0.39
766	0.32
767	0.35
768	0.35
769	0.38
770	0.42
771	0.43
772	0.39
773	0.39
774	0.44
775	0.4
776	0.4
777	0.33
778	0.26
779	0.24
780	0.25
781	0.27
782	0.23
783	0.25
784	0.24
785	0.23
786	0.24
787	0.22
788	0.17
789	0.13
790	0.1
791	0.09
792	0.09
793	0.12
794	0.14
795	0.13
796	0.14
797	0.18
798	0.23
799	0.26
800	0.27
801	0.28
802	0.3
803	0.38
804	0.43
805	0.43
806	0.42
807	0.41
808	0.44
809	0.4
810	0.38
811	0.37
812	0.32
813	0.34
814	0.34
815	0.31
816	0.28
817	0.27
818	0.25
819	0.21
820	0.2
821	0.16
822	0.13
823	0.12
824	0.12
825	0.12
826	0.12
827	0.11
828	0.1
829	0.09
830	0.08
831	0.09
832	0.09
833	0.09
834	0.09
835	0.09
836	0.08
837	0.08
838	0.08
839	0.07
840	0.07
841	0.06
842	0.05
843	0.04
844	0.03
845	0.04
846	0.03
847	0.03
848	0.03
849	0.03
850	0.04
851	0.04
852	0.04
853	0.04
854	0.05
855	0.06
856	0.06
857	0.06
858	0.06
859	0.08
860	0.1
861	0.12
862	0.18
863	0.24
864	0.28
865	0.33
866	0.37
867	0.42
868	0.45
869	0.46
870	0.44
871	0.42
872	0.42
873	0.4
874	0.36
875	0.3
876	0.26
877	0.22
878	0.19
879	0.15
880	0.12
881	0.09
882	0.08
883	0.07
884	0.07
885	0.07
886	0.07
887	0.07
888	0.07
889	0.07
890	0.07
891	0.07
892	0.07
893	0.06
894	0.06
895	0.06
896	0.06
897	0.05
898	0.05
899	0.05
900	0.05
901	0.05
902	0.06
903	0.06
904	0.06
905	0.06
906	0.06
907	0.06
908	0.07
909	0.07
910	0.07
911	0.07
912	0.07
913	0.07
914	0.07
915	0.07
916	0.07
917	0.07
918	0.07
919	0.07
920	0.07
921	0.07
922	0.06
923	0.06
924	0.05
925	0.05
926	0.05
927	0.05
928	0.05
929	0.05
930	0.05
931	0.06
932	0.06
933	0.06
934	0.08
935	0.08
936	0.12
937	0.13
938	0.13
939	0.15
940	0.16
941	0.18
942	0.26
943	0.32
944	0.35
945	0.44
946	0.45
947	0.44
948	0.46
949	0.47
950	0.47
951	0.51
952	0.52
953	0.5
954	0.53
955	0.54
956	0.53
957	0.52
958	0.45
959	0.41
960	0.38
961	0.38
962	0.35
963	0.33
964	0.33
965	0.33
966	0.35
967	0.34
968	0.31
969	0.24
970	0.27
971	0.3
972	0.37
973	0.41
974	0.36
975	0.33
976	0.35
977	0.35
978	0.35
979	0.38
980	0.35
981	0.34
982	0.39
983	0.42
984	0.42
985	0.44
986	0.43
987	0.39
988	0.4
989	0.37
990	0.34
991	0.34
992	0.39
993	0.39
994	0.39
995	0.39
996	0.4
997	0.47
998	0.5
999	0.53
1000	0.47
1001	0.46
1002	0.5
1003	0.56
1004	0.57
1005	0.51
1006	0.5
1007	0.48
1008	0.52
1009	0.51
1010	0.45
1011	0.37
1012	0.33
1013	0.33
1014	0.34
1015	0.33
1016	0.34
1017	0.41
1018	0.44
1019	0.45
1020	0.46
1021	0.5
1022	0.45
1023	0.47
1024	0.44
1025	0.45
1026	0.46
1027	0.52
1028	0.58
1029	0.53
1030	0.57
1031	0.6
1032	0.63
1033	0.6
1034	0.61
1035	0.62
1036	0.63
1037	0.7
1038	0.72
1039	0.68
1040	0.64
1041	0.63
1042	0.65
1043	0.57
1044	0.51
1045	0.42
1046	0.36
1047	0.3
1048	0.25
1049	0.22
1050	0.16
1051	0.15
1052	0.16
1053	0.19
1054	0.19
1055	0.19
1056	0.21
1057	0.21
1058	0.21
1059	0.27
1060	0.29
1061	0.36
1062	0.46
1063	0.54
1064	0.63
1065	0.67
1066	0.76
1067	0.77
1068	0.81
1069	0.82

P38798

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer